秦燕研究员
YanQin,Professor

专家类别:研究员
简历&研究组工作摘要1999年南开大学生物学学士2000-2006年在德国马-普学会攻读并获得博士学位，留任博士后。2006年至今为中国科学院生物物理研究所研究员,RNA平台首席技术专家2007.5至今为创新课题组长，博士生导师主要研究方向：生命体的核心反应-蛋白质的生物合成过程，即在分子水上研究遗传信息传递到蛋白质的全过程，包括DNA对蛋白质表达的影响、mRNA研究、蛋白质在核糖体中的合成（核心课题）、新生肽链的折叠等方向，以及蛋白质生物合成的主要抑制剂-抗生素的研发。工作进展：核糖体是蛋白质的合成工厂，它沿着mRNA从5'到3'方向运动，将遗传信息翻译成为肽链（蛋白质）。LepA蛋白是种极度保守的蛋白质，存在于几乎所有已知的基因组中，其同源物的氨基酸序列和结构域预测都有很高的相似性，但它的功能多年来一直未知。最近工作发现，LepA是核糖体作用蛋白，可以诱导核糖体在mRNA上倒退运动[1]。我们继续这项工作，深入研究LepA及其同源蛋白的生物化学特性和生理学意义，在大肠杆菌、果蝇、线虫、小鼠以及人等模式生物中深入研究LepA蛋白的功能。主持所RNA平台建设，在此基础上建立了大规模密度梯度分离技术平台、反向HPLC的RNA分离技术平台，在实验方法上建立起了蛋白质体外表达平台，在体外研究翻译过程的每个步骤、每种因子，从微观上认识蛋白质翻译过程的机制。
Biography&IntroductionEducation1999NankaiUniversity,BachelorofScience.2000-2006Germany,Max-Plank-InstituteofMolecularGenetics,Berlin,PhDandpost-doc.ResearchinterestThetranslation/proteinbiosynthesisisthesecondstepinthecentraldogmawhichisdescribingtheprocessoftheconversionofthegeneticinformationfrommRNAtoprotein.Myresearchisfocusingonthisstep,includingthecomprehensiveinfluencesofDNA、RNAandproteinfactorsontheproteintranslationprocess,andalsothefoldingofnewlysynthesizedpeptides,theantibioticsetc.CurrentworkRibosomeistheproteinbiosynthesisfactory.ItmovesalongthemRNAinthedirection5’to3’,translatingthegeneticinformationintopolypeptide/protein.LepAproteinisahighlyuniversallyconservedproteinexistinginalmostallknowngenomes.Allitshomologueshaveverysimilaraminoacidsequenceandinsilicostructuresbutitsfunctionremainselusive.Recently,thefirstpaperofLepAfunctionuncoveredthemystery:itisaribosomalfactorworkingontheelongationstepandtriggerstheback-translocationofthepost-translationalribosomalcomplextothepre-translationalstate[1].Now,wearefocusingonthebiochemicalandphysiologicalcharacterizationofthisproteinintheprokaryoticsystem(E.coli).Meantime,wearesettinguptheeukaryoticLepAhomologueresearchsysteminthemodelorganisms:Drosophilamelanogaster,MusmusculusandHomosapiens.SinceIjoinedtheinstitute,myeffortshavebeenmainlycontributedtosetuptheRNAplatformwiththelarge-scalezonalgradientultracentrifugeisolationsystemandreverse-phaseHPLCsystem.Atthemeantime,IsetuptheinvitrotranslationsystemastheworkingmethodtostudytheribosomeandthetranslationalfactorLepA(EF4)functionallyandstructurally.
SelectedPublications1.　ZhangD,LiuG,XueJ,LouJ,NierhausKH,GongW*andQinY*(2012)CommonchaperoneactivityintheG-domainoftrGTPaseprotectsL11–L12interactionontheribosome,NucleicAcidsRes.,DOI:10.1093/nar/gks833.(*correspondingauthor)2.　WangL,YangF,ZhangD,ChenZ,XuR,NierhausKH,GongWandQinY*(2012)AconservedprolineswitchontheribosomefacilitatestherecruitmentandbindingoftrGTPases,Nat.Struct.Mol.Biol.,19(4)403-410.(*correspondingauthor)3.　PechM,KarimZ,YamamotoH,KitakawaM,QinYandNierhausKH(2011)Elongationfactor4(ef4/lepa)acceleratesproteinsynthesisatincreasedmg2+concentrations.PNAS,108(8):3199-32034.　DiGiaccoV^#,MarquezV^#,QinY^#,PechM,Triana-AlonsoFJ,WilsonDN,NierhausKH(2008)Shine-dalgarnointeractionpreventsincorporationofnoncognateaminoacidsatthecodonfollowingtheaug.PNAS105(31):10715-10720.(#co-firstauthor)5.　ConnellSR^#,TopfM^#,QinY^#,WilsonDN,MielkeT,FuciniP,NierhausKH,SpahnCM(2008)Anewtrnaintermediaterevealedontheribosomeduringef4-mediatedback-translocation.NatureStruct.Mol.Biol.15(9):910-915.(#co-firstauthor)6.　QinY,PolacekN,VesperO,StaubE,EinfeldtE,WilsonDN,NierhausKH(2006)Thehighlyconservedlepaisaribosomalelongationfactorthatback-translocatestheribosome.Cell127(4):721-733.patents1.　KnudHNierhaus,YanQin;DanielWilson.TheproteinfactorLepA(EF4)asanewtargetforantibioticsagainstbacteria.PCT/EP2007/0089612.　KnudHNierhaus,YanQin;DanielWilson.UseofLepAforimprovingtheaccuracyofproteinsynthesisinvitro.PCT/EP2006/006503（2012-08-29）
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