熊冬金^1,2,*, 王吴彬^1,*, 赵团结¹, 盖钧镒^1,*
1南京农业大学大豆研究所 / 国家大豆改良中心 / 农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合) / 作物遗传与种质创新国家重点实验室, 江苏南京 210095

²南昌大学生命科学与食品工程学院, 江西南昌330031

^*通讯作者(Corresponding author): 盖钧镒, E-mail:sri@njau.edu.cn 收稿日期:2014-03-04 基金资助:本研究由国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB1093); 国家公益性行业(农业)科研专项经费项目(200803060, 201203026-4); 国家自然科学基金项目(30871550, 31260332); ****和创新团队发展计划资助(PCSIRT13073); 教育部高等学校创新引智计划项目(B08025); 江苏省优势学科建设工程专项和国家重点实验室自主课题资助;

摘要以我国10个大豆育成品种重要家族的179个品种为材料, 选用161个均匀分布于大豆基因组的SSR分子标记, 采用PowerMarker Ver. 3.25软件分析参试材料的遗传多样性、相似性与特异性。结果表明, 161个位点上共检测到1697个等位变异, 单位点变幅为5~24个, 平均10.5个; 多态信息含量在0.549~0.937间, 平均0.819; 群体具有丰富的遗传变异。聚类分析表明, 179个品种可归为6大类11小类, 同一家族的品种有聚为一类的趋势。品种间亲本系数和遗传相似系数显著相关(r= 0.67); 山东寿张县无名地方品种(A295)、即墨油豆(A133)、滑县大绿豆(A122)和铜山天鹅蛋(A231) 4个家族亲本系数和相似系数均较小, 遗传基础较宽广; 矮脚早(A291)、上海六月白(A201)、奉贤穗稻黄(A084)和51-83 (A002) 4个家族亲本系数和相似系数较大, 遗传基础较狭窄, 这与选择育种品种较多有关; 东北白眉(A019)家族与其他家族间的亲本系数和遗传相似系数均最小。家族间特异性分析表明, 东北白眉(A019)家族和其他9个家族地理距离较远, 存在较多互补、特有、特缺等位变异; 而III区和II区地理位置较近, 种质交流较多, 两区家族间特有、特缺等位点数较少, 其中A002、A231和A122三个家族无特有等位变异, A084、A201、A034和A231四个家族无特缺等位变异。本研究结果对拓宽大豆育成品种遗传基础具有指导意义。

关键词:大豆; 育成品种; SSR; 遗传多样性; 特异性
Genetic Similarity and Specificity of Ten Important Soybean Cultivar Families Released in China
XIONG Dong-Jin^1,2,**, WANG Wu-Bin^1,**, ZHAO Tuan-Jie¹, GAI Jun-Yi^1,*
1Soybean Research Institute of Nanjing Agricultural University / National Center for Soybean Improvement / National Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Nanjing 210095, China

² School of Life Science and food Engineering, Nanchang University, Nanchang 330031, China

Fund:
AbstractAnalysis of the affinity relationship and genetic similarity among cultivars is important for crop genetic improvement. In this study, a total of 161 SSRs covering the entire soybean genome were analyzed for the genetic diversity, similarity and specificity of 10 important families composed of 179 cultivars using PowerMarker Ver. 3.25. The results showed that there were totally 1697 alleles, averaging 10.5 per locus, ranging from 5 to 24 with average polymorphism information content of 0.832, ranging from 0.545 to 0.943 in the population. According to the SSR cluster analysis, the 179 cultivars were clustered into six groups, eleven subgroups, with a tendency that the cultivars in a family tended to be grouped into a same cluster. There existed significant correlation (r= 0.67) between coefficient of parentage (CP) and genetic similarity coefficient (GSC) of the population. The CP and GSC values of A295, A133, A122, and A231 families were relatively low, which means that the genetic bases of the four families were relatively broad. In contrast, the CP and GSC values of A291, A201, A084, and A002 families were relatively high, indicating their genetic bases were relatively narrow due to more cultivars obtained from pure line selection. The CP and GSC values between the A019 family from Northeast China and other nine families were the lowest among all pairwise combinations of families. The genetic specificity analysis showed that there existed much more complementary alleles, specifically existent and specifically deficient alleles in A019 in comparison with in other families, indicating the former is distant from the latter. On the other hand, the families in Eco-region II and III, contained fewer complementary alleles, specifically existent and specifically deficient alleles, which might be due to some frequent germplasm exchange between the neighboring eco-regions. For example, there were no specifically existent alleles in A002, A231, A122 and no specifically deficient alleles in A084, A201, A034, and A231. The present results are of significance in broadening the genetic basis of soybean cultivar.

Keyword:Soybean; Released cultivar; SSR; Genetic diversity; Specificity
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0 引言亲本系数(CP)是指品种间携带血缘等同基因的概率, 它所阐明的是品种间的亲缘程度, 可以反映出品种整体亲缘关系的相近程度。品种间的亲本系数是一个非常有用且有说服力的遗传参数, 具有可比性, 可以反映总体的基因流, 是对基因组的宏观分析。近年来, 国内外都重视大豆育成品种及其亲本的研究, 主要是分析品种的系谱, 系统获得品种亲缘关系信息, 为大豆育种理论与应用研究提供参考^{[ 1, 2, 3]}。Sneller等^{[ 4]}分析了美国大豆育成品种间的亲缘关系(亲本系数或共祖先度), 发现群体亲本系数均值为0.173, 遗传多样性高。Bharadwaj等^{[ 5]}对印度1968—2000年的育成品种系谱分析表明66个品种亲本系数平均值为0.050。Bonato等^{[ 6]}对巴西1984— 1998年育成的100个品种CP分析的结果, 平均值为0.21, 比美国的育成品种略低。
近年来分子标记技术在作物亲缘关系及其遗传相似性研究中发挥重要作用^{[ 7]}, 尤其是共显性的SSR标记, 具有丰富的等位变异, 是研究品种间相似性较理想的分子标记。分子标记方法是通过抽取整个基因组上有代表性的部分标记来研究品种间的遗传相似程度。迄今已有利用分子标记分析大豆的遗传多样性、品种间遗传关系^{[ 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15]}和群体分化^{[ 16, 17]}的大量报道, 也有一些利用分子标记和系谱资料综合分析作物品种间亲缘关系及其遗传相似性研究的报道^{[ 17, 18, 19, 20]}。
作物育成品种对环境的适应能力是作物育种的关键, 拓宽栽培品种的遗传基础是作物品种能否大量推广的关键所在。大豆育成品种不仅是重要的受体亲本也是重要的供体亲本, 是直接应用于育种实践的核心种质资源。若要拓宽作物育种材料的遗传背景, 一方面要通过表型鉴定不断挖掘丰富的优异种质, 另一方面要分析比较作物种质间的相似性和相异性, 为作物育种的亲本选择提供依据。
熊冬金等^{[ 21, 22]}对我国2005年以前育成的1300个育成品种进行系谱分析, 追溯到来自670个祖先亲本, 并归纳出54个最为重要的祖先亲本, 其中51-83 (A002)、白眉(A019)、滨海大白花(A034)、奉贤穗稻黄(A084)、滑县大绿豆(A122)、即墨油豆(A133)、上海六月白(A201)、铜山天鹅蛋(A231)、武汉菜用大豆混合群体(A291)和山东寿张县无名地方品种(A295)等10个祖先亲本衍生的品种数共计1228份(次)。本研究以这10个家族群体为对象, 通过计算亲本系数和SSR标记分析, 研究其品种间的遗传关系, 揭示其衍生群体的遗传基础, 以期为我国大豆育种亲本选配, 扩大亲本来源, 拓宽我国大豆育成品种遗传基础提供参考。
1 材料与方法1.1 供试材料选用我国51-83 (A002)、白眉(A019)、滨海大白花(A034)、奉贤穗稻黄(A084)、滑县大绿豆(A122)、即墨油豆(A133)、上海六月白(A201)、铜山天鹅蛋(A231)、武汉菜用大豆混合群体(A291)和山东寿张县无名地方品种(A295)等10个主要亲本家族的179份系谱信息完整的大豆品种(表1), 为研究材料。这些大豆分布于I、II、III、IV和V等5个不同生态区, 包括从1943年育成的丰地黄到2005年育成的GS郑交9525等, 具有广泛的代表性。
1.2 基因组DNA提取及SSR扩增利用苗期的幼嫩叶片, 参考Aljanabi等^{[ 23]}的CTAB法, 提取和纯化大豆基因组DNA。所用的161个SSR标记均匀覆盖大豆20条染色体^{[ 24]}。PCR体系为10 μL, 含模板基因组DNA溶液(50 ng) 3.0 μL、10×buffer 1.46 μL、10 mmol L^-1 dNTPs 0.24 μL、0.5 U Taq酶0.1 μL、25 mmol L^-1 Mg²⁺0.8 μL、引物3.0 μL、ddH₂O 1.4 μL。PCR程序为94℃预变性3 min; 95℃变性30 s, 55℃退火40 s, 72℃延伸40 s, 30个循环; 72℃延伸8 min; 4℃保温。PCR扩增产物中加入2 μL溴酚蓝缓冲液, 在8%聚丙烯酰胺胶上20 W恒功率电泳1 h左右, 然后用银染法显色, 进行凝胶成像扫描保存图像, 接着用Bio-Rad的Quantity One软件、根据晶美生物工程公司生产的pBR322DNA/ BsuRI ( HaeIII) Marker测定扩增条带的分子量大小。
1.3 亲本系数计算参考Cox等^{[ 25]}和Cui等^{[ 26]}方法, 计算亲本系数计算原则如下: 品种分别从其双亲得到一半的基因; 所有祖先种、亲本及其后代品种都是纯合的; 最早的祖先品种(系)间的亲缘系数为0; 混合授粉材料, 各花粉供体享有相同的等同于雌配子的亲本系数概率; 品种与其系选所得品种间的 CP=0.75; 自然突变和诱导突变材料与其祖先的亲本系数为0.75; 品种与其自身的 CP=1.0; 含有部分相同亲本的旁系品种间的亲本系数, 计算公式为 CP= R_SD＝Σ[(1/2) ⁿ], R代表品种S和品种D之间的亲本系数, n代表品种S和品种D的共同亲本到品种S和品种D的世代数之和。
表1
Table 1
表1(Table 1)

表1 供试材料来源 Table 1 Source of tested materials 家族代号 Family code 祖先亲本 Ancestor 祖先亲本生态区 Ancestor eco-region 衍生品种数 No. of derived cultivars 参试品种数 No. of tested cultivars 品种分布生态区 Eco-region A019 白眉 Baimei I 352 14 I A295 山东寿张县无名地方种 Shouzhang difangzhong II 130 50 II, III, IV A133 即墨油豆 Jimoyoudou II 153 66 II, III, IV, V A122 滑县大绿豆 Huaxiandalüdou II 46 30 II A034 滨海大白花 Binhaidabaihua II 180 93 II, III, IV A231 铜山天鹅蛋 Tongshantian’edan II 208 82 II, III A002 51-83 III 40 27 II, III A084 奉贤穗稻黄 Fengxiansuidaohuang III 45 27 II, III, IV, V A201 上海六月白 Shanghailiuyuebai III 35 24 III, IV, V A291 武汉菜用大豆混合群体Vegetable soybean population in Wuhan III 39 14 III, IV, V I: 北方一熟春豆生态区; II: 黄淮海二熟春夏豆生态区; III: 长江中下游二熟春夏豆生态区; IV: 中南多熟春夏秋豆生态区; V: 西南高原二熟春夏豆生态区; 华南热带多熟多播季生态区(VI)的大豆未包括在本研究中。 I: Northern single cropping, spring planting eco-region; II: Huanghuaihai double cropping, spring and summer planting eco-region; III: Middle and lower Changjiang valley double cropping, spring and summer planting eco-region; IV: Central south multiple cropping, spring, summer and autumn planting eco-region; V: Southwest plateau double cropping, spring and summer planting eco-region; cultivars from South China tropical multiple cropping, all season planting eco-region (VI) is excluded in the present study.

表1 供试材料来源 Table 1 Source of tested materials

1.4 数据分析利用PowerMarker Ver. 3.25软件^{[ 27]}对群体进行遗传多样性分析、聚类分析和遗传距离计算。遗传多样性的评价指标主要是等位变异数和多态性信息量(polymorphism information content, PIC)。根据Nei’s等^{[ 28]}的方法计算遗传距离: ,遗传相似系数为GSC=1-DA, 其中 p _ij、 q _ij分别是两群体在 j位点第 i个等位变异的频率, a _j是在 j位点等位变异数, m是检测位点总数。通过Neighbor-Joining算法进行无根树状遗传关系聚类。
比较2个群体的等位变异时, A群体有而B群体没有的等位变异可以作为用A拓宽B遗传基础的潜力, 此处称为A对B的补充等位变异; A对B与B对A的补充等位变异数之和可以衡量A与B实际相差的等位变异数、也可以评价A和B遗传关系远近, 此处称为A与B的互补等位变异数。群体间互补的等位变异中有一部分变异是群体特殊的。特有等位变异是某群体具有而其他各群体都没有的等位变异; 特缺等位变异是某群体没有而其他各群体都有的等位变异; 特有、特缺等位变异表示了群体的特异性^{[ 17]}。

2 结果与分析2.1 我国大豆育成品种10个重要家族群体的遗传多样性161个SSR位点在染色体上的分布见表2, 在这些位点上检测到1697个等位变异, 平均每个位点等位变异数为10.5个, 变化介于5~24个; 多态性信息量平均值为0.819, 范围在0.549~0.937间。以上表明10个重要家族群体所构成的样本具有丰富的遗传变异, 品种间多样性高。
10个重要家族群体中, 平均等位变异数较多的是滨海大白花(A034)家族、铜山天鹅蛋(A231)家族、即墨油豆(A133)家族和山东寿张县无名地方品种(A295)家族; 较少的是武汉菜用大豆混合群体(A291)家族, 为5.4个。10个重要家族群体PIC均值变化范围在0.670~0.810之间, 遗传多样性结果与根据等位变异数分析结果基本一致。综上所述, A034家族遗传多样性最高, A231家族其次, A291家族最低, 且各家族群体间遗传差异明显, 其中A034与A291家族间遗传差异最为明显(表3)。
表2
Table 2
表2(Table 2)

表2 用于分析179个大豆品种的161个SSR标记所在连锁群及其多样性 Table 2 Position of 161 SSR markers on chromosomes and genetic diversity of 179 cultivars 染色体 Chr. 标记数 No. of markers 等位变异数Allele number 多态信息量 PIC 染色体 Chr. 标记数 No. of markers 等位变异数Allele number 多态信息量 PIC Chr.1 5 7-13 0.811-0.895 Chr.12 7 8-12 0.730-0.530 Chr.2 9 9-14 0.811-0.876 Chr.13 9 6-15 0.621-0.896 Chr.3 5 9-24 0.835-0.937 Chr.14 7 8-13 0.817-0.874 Chr.4 10 7-17 0.619-0.905 Chr.15 5 9-12 0.802-0.864 Chr.5 8 5-17 0.634-0.926 Chr.16 9 6-16 0.688-0.890 Chr.6 10 5-16 0.549-0.890 Chr.17 9 6-15 0.685-0.915 Chr.7 11 7-15 0.791-0.896 Chr.18 9 5-18 0.690-0.916 Chr.8 14 6-19 0.660-0.915 Chr.19 9 5-15 0.677-0.909 Chr.9 4 5-15 0.600-0.903 Chr.20 3 9-16 0.799-0.870 Chr.10 10 5-20 0.696-0.914 总计Total 161 1697 0.549-0.937 Chr.11 8 6-12 0.629-0.893 平均Average 8.1 10.5 0.819 Chr.: chromosome; PIC: polymorphism information content.

表2 用于分析179个大豆品种的161个SSR标记所在连锁群及其多样性 Table 2 Position of 161 SSR markers on chromosomes and genetic diversity of 179 cultivars

表3
Table 3
表3(Table 3)

表3 10个重要家族群体的遗传多样性 Table 3 Genetic diversity of 10 important families 家族 Family 位点等位变异数Allele number per locus 多态性信息量PIC 个数Number 最小值Min 最大值Max 平均Mean 最小值Min 最大值Max 平均Mean A002 1287 3 18 8.0 0.478 0.923 0.774 A019 986 2 11 6.1 0.280 0.878 0.740 A034 1628 4 22 10.1 0.546 0.938 0.810 A084 1254 3 16 7.8 0.437 0.901 0.771 A122 1253 3 14 7.8 0.468 0.901 0.768 A133 1569 4 21 9.7 0.568 0.935 0.805 A201 1018 3 13 6.3 0.346 0.883 0.678 A231 1607 4 21 10.0 0.564 0.932 0.810 A291 864 2 10 5.4 0.240 0.854 0.670 A295 1488 4 19 9.2 0.529 0.915 0.796 总数Total 1697 5 24 10.5 0.549 0.937 0.819

表3 10个重要家族群体的遗传多样性 Table 3 Genetic diversity of 10 important families

2.2 10个重要家族群体的聚类根据Nei’s (1983)遗传距离, 用Neighbor-Joining tree方法进行品种遗传关系聚类, 179个大豆品种可分为A、B、C、D、E和F等6个亚群, A、B、C1、C2、C3、D、E1、E2、F1、F2和F3等11小类。
179个品种的详细归类结果见附表。A亚群包括12个品种, 其中以铜山天鹅蛋(A231)家族的品种为主, 占7个, 主要分布在II生态区。B亚群包括21个品种, 其中以即墨油豆(A133)家族为主, 有17个, 分布的地区主要为II区的河南和山东等地。
C亚群包含品种较多, 共40个品种, 又可以C1和C2两小类及1个独立品种(豫豆29)。C1类包括沧豆4号等27个品种, 其中滨海大白花家族(A034)的品种有17个; 主要分布在北京、安徽和河南等黄淮地区(II); C2类包括12个品种, 以山东寿张县无名地方品种(A295)家族为主有10个品种, 主要分布在II生态区的河南省; C3仅包含一个独立的大豆品种豫豆29。
图1
Fig. 1

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	图1 供试179个品种的SSR聚类图Fig. 1 Dendrogram of 179 soybean cultivars based on SSR markers

D亚群包括36个品种, 又可分为D1和D2两个小类。D1小类包括24个品种, 其中有23个品种分布在江苏省, 多属于III生态区, 该亚群以51-83 (A002)家族的品种为主, 占12个; D2小类的品种以即墨油豆(A133)家族为主, 12个品种中有7个属于该家族, 主要分布在II和IV生态区。
E亚群包括39个品种, 可分为E1和E2两小类。E1小类包括26个品种, 以滨海大白花家族(A034)、即墨油豆(A133)家族的品种为主, 分别有14和11品种聚在此类; 东北白眉(A019)家族的品种, 如绥农14和合丰33等也多聚在此类。E2类包括13个大豆品种, 其中有11个品种属于滨海大白花家族(A034), 分布地区集中在II和III生态区。
F亚群包括31个品种, 可分为F1和F2两小类。F1小类包括20个品种, 以上海六月白(A201)和武汉菜用大豆混合群体(A291)家族的品种为主。F2类包括11个大豆品种, 以上海六月白(A201)为主, 有7个, 该类品种主要分布在IV生态区。
2.3 我国大豆育成品种10个重要家族群体的遗传相似性2.3.1 亲本系数 179个育成品种成对组成的 15 931个组合中, 亲本系数平均值为0.02, 分布范围在0~0.75间(表4); 其中有7371个组合的亲本系数为0, 且总体有95%以上的亲本系数分布在0~0.13之间。以上说明, 尽管这些品种来自10个祖先亲本家族, 但其遗传基础仍相对较宽广。
表4
Table 4
表4(Table 4)

表4 主要家族品种间亲本系数和遗传相似系数的比较 Table 4 Comparison of parentage coefficient and genetic similarity coefficient among cultivars in the families 家族 Family 亲本系数 Coefficient of parentage 遗传相似系数 Genetic similarity coefficient 最小值Min 最大值Max 平均值Mean 最小值Min 最大值Max 平均值Mean 全部品种 Whole 0 0.75 0.02 0.03 0.80 0.16 A019 0.01 0.19 0.07 0.06 0.53 0.18 A295 0 0.50 0.04 0.05 0.61 0.17 A133 0 0.50 0.04 0.05 0.61 0.16 A122 0 0.34 0.05 0.06 0.60 0.18 A034 0 0.50 0.06 0.04 0.74 0.16 A231 0 0.36 0.05 0.04 0.74 0.16 A002 0 0.56 0.12 0.04 0.61 0.17 A084 0 0.75 0.12 0.06 0.63 0.17 A201 0.02 0.50 0.12 0.05 0.80 0.25 A291 0.06 0.56 0.20 0.05 0.56 0.23

表4 主要家族品种间亲本系数和遗传相似系数的比较 Table 4 Comparison of parentage coefficient and genetic similarity coefficient among cultivars in the families

由表5和图2-A可知, 家族群体内, 寿张县无名地方品种家族(A295)、墨油豆(A133)家族、滑县大绿豆(A122)家族、铜山天鹅蛋(A231)家族、滨海大白花家族(A034)和白眉(A019)家族的亲本系数均值相对较小, 且分布较为集中。如A295家族的亲本系数平均值为0.04, 分布范围在0~0.50间, 99%以上分布在0~0.13间。
由表5可知, 主要家族群体间, 白眉家族(A019)与其他家族间的亲本系数均较小, 说明其遗传相似性低, 彼此拓宽遗传基础的可能性较大, 而奉贤穗稻黄家族(A084)与51-83家族(A002)间和菜用大豆混合群体家族(A291)与上海六月白家族(A201)间的亲本系数较大, 说明二者间遗传基础较窄。
从上述亲本系数数据分析数据可知, A291家族的亲本系数平均值最大, 其遗传基础最为狭窄, 其次为A002、A084和A201; 相对来说, A295和A133家族的遗传基础最为宽广。东北的白眉家族(A019)与其他家族亲本系数较小, 以后育种中要加强彼此间种质交流。
4个生态区中, II生态区品种家族较大、涉及祖先亲本数多, 其亲本系数平均值最低, 为0.04, 并较为紧凑地分布在平均值附近, 该区品种的遗传基础最为宽广; III生态区的品种家族自然选择育种较多, 涉及祖先亲本数少, 其亲本系数平均值最高, 为0.08, 且较分散, 该区品种的遗传基础最为狭窄(图2-B)。
表5
Table 5
表5(Table 5)

表5 主要家族间亲本系数和遗传相似系数的比较 Table 5 Comparison of parentage coefficient and genetic similarity coefficient among the families 家族Family A019 A295 A133 A122 A034 A231 A002 A084 A201 A291 A019 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.13 0.14 0.13 0.13 A295 0 0.17 0.18 0.17 0.17 0.16 0.16 0.16 0.17 A133 0 0.05 0.17 0.16 0.16 0.15 0.16 0.16 0.16 A122 0 0.06 0.04 0.17 0.17 0.16 0.16 0.15 0.17 A034 0 0.06 0.04 0.04 0.17 0.16 0.16 0.16 0.17 A231 0 0.04 0.04 0.04 0.06 0.16 0.16 0.16 0.16 A002 0.01 0.03 0.03 0.03 0.06 0.05 0.18 0.14 0.15 A084 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.11 0.16 0.16 A201 0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.24 A291 0 0.01 0.01 0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.09 对角线上方为遗传相似系数, 对角线下方为亲本系数。 Numbers above the diagonal are genetic similarity coefficient (GSC) values; those below the diagonal are coefficient of parentage (CP) values.

表5 主要家族间亲本系数和遗传相似系数的比较 Table 5 Comparison of parentage coefficient and genetic similarity coefficient among the families

图2
Fig. 2

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	图2 成对品种间亲本系数频数分布图A: 不同家族; B: 不同生态区。Fig. 2 Frequency distribution of CP in pairwised soybean cultivarsA: frequency distribution in different families; B: frequency distribution in different eco-regions.

51-83家族(A002)、奉贤穗稻黄家族(A084)和上海六月白家族(A201)的亲本系数居中, 分布相对分散。如A002家族品种间亲本系数平均值为0.12, 分布范围在0~0.56间, 74.5%密集分布在0~0.15范围间。武汉菜用大豆混合群体家族(A291)亲本系数均值最大, 为0.20, 分布最为分散, 0.06~0.28间居多, 63.0%分布0.13~0.28间。
2.3.2 遗传相似系数 179个品种成对品种间GSC分布见表6, 其均值为0.16, 分布范围在0.03~ 0.80间, 95%以上分布在0.07~0.22之间, 其中齐黄29与合豆3号间的遗传相似系数最小, 为0.03, 湘春豆23与湘春豆22间的遗传相似系数最大, 为0.80。品种间遗传相似性较小, 群体遗传基础便较广泛。
10个家族亚群内, 滨海大白花家族(A034)、即墨油豆(A133)家族和铜山天鹅蛋(A231)家族品种间遗传相似系数平均值最小, 均为0.16, 且分布较为集中; 如A034家族, 85.0%分布在0~0.20间, 以(0.10~ 0.20)最为密集。
51-83家族(A002)、奉贤穗稻黄家族(A084)、寿张县无名地方品种家族(A295)、白眉(A019)家族和滑县大绿豆(A122)家族的遗传相似系数均值居中, 分别为0.17、0.17、0.17、0.18和0.18, 且分布相对分散。如A002家族品种间遗传相似系数分布范围为0.04~0.61, 多数分布在(0.10~0.20)区间内, 79.0%集中于(0~0.20)区间。武汉菜用大豆混合群体家族(A291)和上海六月白家族(A201)品种间遗传相似系数最大, 分别为0.23和0.25, 且分布范围相对分散。如A201家族遗传相似系数分布在0.05~0.80间, 仅55.0%以上分布在0~0.20间。
10个重要家族群体间, 白眉家族(A019)与其他家族间的遗传相似系数均较小, 说明其遗传相似性低, 而菜用大豆混合群体家族(A291)与上海六月白家族(A201)间的亲本系数较大, 与基于亲本系数的分析结果相同(表5)。
表6
Table 6
表6(Table 6)

表6 成对品种间遗传相似系数次数分布表 Table 6 Frequency distribution of GSC in pairwised soybean cultivars 类群 Group 0-0.1 0.1-0.2 0.2-0.3 0.3-0.4 0.4-0.5 0.5-0.6 0.6-0.7 0.7-0.8 变幅 Range 均值 Mean 全部品种?Whole 1453 12342 1590 391 102 29 14 10 0.03-0.80 0.16 A019 14 59 7 8 2 1 0 0 0.06-0.53 0.18 A295 102 928 123 43 19 8 2 0 0.05-0.61 0.17 A133 202 1628 214 68 24 7 2 0 0.05-0.61 0.16 A122 30 311 55 21 13 4 1 0 0.06-0.60 0.18 A034 383 3260 477 106 36 13 2 1 0.04-0.74 0.16 A231 315 2533 347 79 35 10 1 1 0.04-0.74 0.16 A002 32 244 47 20 6 1 1 0 0.04-0.61 0.17 A084 27 259 36 14 12 1 2 0 0.06-0.63 0.17 A201 9 144 50 34 14 7 9 9 0.05-0.80 0.25 A291 2 41 28 9 9 2 0 0 0.05-0.56 0.23 I 38 84 18 12 4 0 0 0 0.04-0.74 0.16 II 836 7536 1132 284 76 28 6 2 0.05-0.61 0.16 III 24 816 190 98 48 10 4 0 0.08-0.63 0.20 IV 66 452 98 68 26 10 18 18 0.05-0.80 0.21

表6 成对品种间遗传相似系数次数分布表 Table 6 Frequency distribution of GSC in pairwised soybean cultivars

从上述遗传相似系数分析可知, A291和A201家族的遗传基础应最狭窄, A034、A133和A231的遗传基础最宽广; 东北的白眉家族与其他家族遗传相似系数均较低。上述结果与亲本系数分析结果一致。
4个生态区中, II生态区所包含的品种及家族最多, 平均遗传相似系数最高, 为0.16, 并较为紧凑分布在平均值附近, 所以该区品种的遗传基础最宽广; 其次为I生态区, 尽管该区仅包含A019家族, 但品种间遗传相似系数仍高达0.16, 这与其育种进程相对较快有关。IV生态区的品种家族遗传相似性系数平均值最高(GSC=0.21), 且分布较松散, 该区品种的遗传基础最狭窄, 这与该区的品种多经过选择育种相关。
2.3.3 亲本系数与遗传相似性系数间关系 表4列举了各主要家族的亲本系数和SSR遗传相似性系数情况, 家族亲本系数均值大小顺序为A133= A295 P<0.0001)有关。
2.4 我国大豆育成品种10个重要家族群体的遗传特异性2.4.1 家族间种质互补 从成对家族来看, 补充等位变异数最多的是滨海大白花家族(A034)对武汉菜用大豆混合群体家族(A291), 为770个, 说明A291家族拓宽A034家族遗传基础的潜力最大; 最少的是滑县大绿豆(A122)家族对寿张县无名地方品种家族(A295), 为7个, 其他家族间的补充等位变异数见表7。亚群间互补等位变异数最多的是铜山天鹅蛋家族(A231)与武汉菜用大豆混合群体家族(A291)间, 为787个。
从整体来看, II生态区的滨海大白花家族(A034)、寿张县无名地方品种家族(A295)、铜山天鹅蛋家族(A231)分别对其他9个家族具有较多的补充等位变异总数, 所以这些家族具有拓宽其他家族遗传基础的较大潜力。I区的A019、III区的A201和A291分别与其他家族具有最多的互补等位变异总数, 所以其他7个家族具有拓宽这3个家族遗传基础的较大潜力。
2.4.2 各家族种质的特异性 特有等位变异是某群体具有而其他各群体都没有的等位变异; 特缺等位变异是某群体没有而其他各群体都有的等位变异; 特有、特缺等位变异表示了群体的特异性^{[ 17]}。10个家族群体中, 东北的A019家族与其他9个家族地理距离最远, 特有、特缺等位点数最多, 其特有标记(特有等位变异数)是10(10)、103(145)个。南方的A002与黄淮海的A231和A122家族的育成品种主要分布于江苏、河南和山东等地家族间种质交流较多, 所以无特有等位变异。南方的A084、黄淮海的A034和A231来自江苏, 其向江苏南北交流, 因此这3个家族和南方的A201家族间无特缺等位变异(表8)。
表7
Table 7
表7(Table 7)

表7 不同家族间互补等位变异数 Table 7 Number of complementary alleles among different families 家族Family A019 A295 A133 A122 A034 A231 A002 A084 A201 A291 A019 102 48 201 35 33 182 166 363 433 A295 604(706) 20 242 21 23 298 309 538 670 A133 642(690) 112(132) 336 43 46 339 335 593 733 A122 468(669) 7(249) 9(345) 9 11 221 211 437 522 A034 668(703) 152(173) 82(125) 375(384) 26 350 367 638 770 A231 656(689) 144(167) 75(121) 367(378) 16(42) 344 353 632 766 A002 483(665) 97(395) 46(385) 255(476) 18(368) 22(366) 131 467 573 A084 467(633) 187(496) 42(377) 245(456) 35(402) 31(384) 131(262) 459 547 A201 380(743) 53(591) 16(609) 187(624) 22(660) 26(658) 183(650) 175(634) 256 A291 331(764) 46(716) 17(750) 133(655) 15(785) 21(787) 150(723) 124(671) 117(373) 表中所列的行家族对列家族补充的等位变异数; 括号内的数字为2个亚群间互补等位变异数。 The numbers of complementary alleles in the Table are those in the vertical lines to the horizontal lines; the numbers in parentheses are the numbers of complementary alleles between two families.

表7 不同家族间互补等位变异数 Table 7 Number of complementary alleles among different families

表8
Table 8
表8(Table 8)

表8 不同家族群体间特有等位变异和特缺等位变异 Table 8 Specifically existent and specifically deficient alleles between different ancestor families 家族 Family 特有等位变异 Specifically existent allele 特缺等位变异 Specifically deficient allele 标记数 Marker number 等位变异数 Allele number 标记数 Marker number 等位变异数 Allele number A002 0 0 14 15 A019 10 10 103 145 A034 3 3 0 0 A084 2 2 0 0 A201 3 3 0 0 A231 0 0 0 0 A291 1 1 17 17 A295 4 4 36 37 A122 0 0 60 71 A133 3 3 0 0

表8 不同家族群体间特有等位变异和特缺等位变异 Table 8 Specifically existent and specifically deficient alleles between different ancestor families

3 讨论3.1 家族的地区性现代大豆育种中, 由于大量使用相同的骨干亲本, 育成的大豆品种群体内的遗传基础非常狭窄。从10个重要家族群体的生态区分布来看, 相同家族的品种有主要分布在1个或少数几个区域的趋势, 如A019家族主要分布在I生态区, A133家族主要分布在II区, 但是不同生态区间也有少数的种质交流, 尤其是II与III生态区间, 如南方的A084家族、黄淮海的A034家族和A231家族。上述结果与盖钧镒等^{[ 29]}通过对我国1923—1995育成品种的系谱资料分析后的研究结果相一致, 认为我国大豆育成品种的祖先亲本主要在本生态区使用, 异生态区间的种质交流利用较少, I区(东北)极少利用其他生态区的种质, 相对来说, II区(黄淮海)、III区(南方)稍好些。
同时, 本研究SSR标记聚类分析在分子水平上显示10个家族育成品种的遗传组成与其所在的地理分布有一定关系, 如D1小类的24个品种中, 有23个分布在江苏省。因此, 加强不同生态区间大豆种质的交流, 对拓宽大豆育种品种的遗传基础是十分必要的。今后我国大豆育种在使用现有祖先亲本时, 还应该注重其他生态区优异种质亲本筛选、发掘及应用。美国大豆育种的成功是很好地应用了国外和异地的种质, 这个经验值得中国借鉴。加强国内外优异种质在各生态区间的交流与应用应是行之有效的方法。问题是如何交流使用这些优异种质材料, 一方面可以驯化这些优异种质适应新的环境以便和当地品种杂交, 另一方面是建立一个由多个生态区优异祖先亲本组成的群体在各区进行轮回选择。无庸置疑, 今后大豆育种中, 亲本材料的改良比祖先亲本的研究更为重要。
3.2 亲本系数与遗传相似系数间的关系与应用本研究结果表明, 利用亲本系数和遗传相似系数评价群体遗传基础的结果相对一致, 而又不完全一致。这与亲本系数和遗传相似系数间的相关系数仅为 r= 0.67^**相一致, 因为2个品种间的亲本系数是指该两品种携带相同的等位基因来自同一个亲本的概率, 遗传相似系数则仅指品种间携带相同的等位基因的概率但并不计较是否来自同一个亲本。前者称为传递相同(identical by descent, 或ibd)后者, 称为状态相同(identical by state, 或ibs)。前者用于研究2个品种间的亲缘关系, 后者用于研究2个品种间种质的相似程度, 有亲缘关系必然具有相似性, 但有相似性不一定有近缘关系。本研究结果, 亲本系数和遗传相似系数有相关, 而又不完全相关, 就是因为上述差异。一般在研究群体中品种间的亲缘关系时常用亲本系数做度量, 而在育种过程中作选择时则常用遗传相似系数做度量。亲本系数的计算必须知道品种间的系谱关系, 遗传相似系数则可以通过分子标记作估计。有时系谱关系难找, 无法估计亲本系数, 有人用遗传相似系数当作亲本系数, 显然这只是近似估计, 以本研究为例, 准确性只有 r=0.67。实际上亲本系数反映了整体基因流向, 是对基因组的宏观分析, 不考虑人工选择和遗传漂变等外界环境和育种条件的影响, 而遗传相似系数是对基因组受各种影响后的实测相似性程度, 而且受标记抽样误差的影响。所以亲本系数和分子标记方法在研究品种间遗传关系中各有特点^{[ 30]}。本研究中群体亲本系数均值为0.02, 比Zhou等^{[ 2]}分析86个大豆品种的结果低( CP=0.04), 与Cui等^{[ 1]}分析651份中国大豆育种品种的亲本系数相当( CP=0.02), 表明大豆重要家族群体遗传基础广泛。根据亲本系数和遗传相似系数具有相关性的特点, 两者都可以对育种过程中的亲本组配方案提供指导。育种家可以用当地的优良品种为受体, 选择与其亲本系数或遗传相似系数较小的供体优先组配; 也可以根据SSR聚类结果, 选择与受体遗传距离较远的品种作为供体。
3.3 大豆主要家族群体间遗传互补性与特异性及其应用大豆主要家族群体遗传互补性与特异性分析表明, 不同群体间存在大量的互补等位变异, 如A231家族对A291家族具有787个互补等位变异, 占总等位变异数1697个的46.4%。同时不同群体间还存在着特有等位变异和特缺等位变异。这显示了不同家族间遗传交流的潜力。
作物育成品种对环境的适应能力是作物育种成败的关键。东北的A019家族与其他家族间遗传交流较少, 相比具有最多的互补等位变异、特有及特缺等位变异数。根据本文的结果, 为拓宽作物育种材料的遗传背景, 一方面要通过表型鉴定不断挖掘丰富的优异种质, 另一方面要利用分子标记技术, 分析比较作物种质间的相似和相异性, 从而对亲本进行基因型差异基础上的组配, 获得超亲的后代。

4 结论以我国10个大豆育成品种重要家族的179个品种为材料, 采用161个均匀分布于大豆基因组的SSR分子标记进行遗传多样性分析, 群体具有丰富的遗传变异, 161个位点上共检测到1697个等位变异, 每位点5~24个, 平均10.5个; 多态信息量(PIC)变化为0.549~0.937, 平均0.819。179个品种可归为6大类11小类, 同一家族的品种有聚为一类的趋势。亲本系数和SSR标记计算的相似系数间 r=0.67; 山东寿张县无名地方品种(A295)、即墨油豆(A133)、滑县大绿豆(A122)和铜山天鹅蛋(A231) 4个家族两者均较小, 其遗传基础最宽广; 矮脚早(A291)、上海六月白(A201)、奉贤穗稻黄(A084)和51-83(A002) 4个家族两者均较高, 遗传基础较狭窄。东北白眉(A019)家族和其他9个家族地理距离较远, 存在较多特有、特缺等位点, 而III区和II区地理位置较近, 种质交流较多, 两区祖先亲本家族间特有、特缺等位点数较少, 其中A002、A231和A122家族未发现特有等位变异, A084、A201、A034和A231家族未发现特缺等位变异。
附表附表
Supplemental Table
附表(Supplemental Table)

附表 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars 类 Cluster 品种 Variety 祖先亲本 Ancestor 区 Eco-region A 苏协19-15 Suxie 19-15 A002, A084 III A 苏协18-6 Suxie18-6 A002, A084 III A 川豆6号Chuandou 6 A084, A201, A291 IV A 中黄15 Zhonghuang 15 A034, A231 II A 跃进10号 Yuejin 10 A034, A133, A231 II A 中豆27 Zhongdou 27 A002, A084, A231 II A 北丰9号 Beifeng 9 A019 I A 北丰7号 Beifeng 7 A019 I A 周豆12 Zhoudou 12 A034, A122, A133, A231, A295 II A 周豆11 Zhoudou 11 A034, A122, A133, A231, A295 II A 豫豆26 Yudou 26 A034, A122, A133, A231, A295 II A 豫豆24 Yudou 24 A034, A122, A133, A231, A295 II B 豫豆1号 Yudou 1 A133 II B 豫豆2号 Yudou 2 A122, A295 II B 豫豆5号 Yudou 5 A034, A133 II B 北丰14 Beifeng 14 A019 I B 北丰13 Beifeng 13 A019 I B 北丰11 Beifeng 11 A019 I B 北丰10号 Beifeng 10 A019 I B 豫豆17 Yudou 17 A034, A231 II B 郑长叶7 Zhengchangye 7 A034, A133 II B 豫豆27 Yudou 27 A002, A034, A084, A133, A231, A295 II B 河南早丰1号 Henanzaofeng 1 A133 II B 豫豆15 Yudou 15 A034, A133, A231, A295 II B 豫豆11 Yudou 11 A034, A133, A231, A295 II B 豫豆10号 Yudou 10 A034, A122, A133, A231, A295 II B 豫豆7号 Yudou 7 A034, A122, A133, A231 II B 郑州135 Zhengzhou 135 A133 II B 合丰25 Hefeng 25 A019 I B 浙春2号 Zhechun 2 A133 IV B 浙春1号 Zhechun 1 A133 IV B 浙春3号 Zhechun 3 A034, A133 IV B 中黄24 Zhonghuang 24 A002, A019, A034, A084, A231 II C1 川豆2号 Chuandou 2 A084 IV C1 沧豆4号 Cangdou 4 A034, A231 II C1 中黄3号 Zhonghuang 3 A034, A231 II C1 菏84-1 He 84-1 A034, A231 II C1 中黄25 Zhonghuang 25 A034, A231 II C1 皖豆13 Wandou 13 A034, A231 II C1 皖豆19 Wandou 19 A034, A231 II C1 中黄14 Zhonghuang 14 A034, A133 II C1 中黄2号 Zhonghuang 2 A034, A231 II C1 中黄1号Zhonghuang 1 A034, A231 II C1 郑77249 Zheng 77249 A034, A133, A231, A295 II C1 郑86506 Zheng 86506 A034, A122, A133, A231, A295 II

附表 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars

(续附表)
Supplemental Table
(续附表)(Supplemental Table)

(续附表) 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars 类 Cluster 品种 Variety 祖先亲本 Ancestor 区 Eco-region C1 郑州126 Zhengzhou 126 A133 II C1 郑133 Zheng 133 A122, A133, A295 II C1 南豆5号 Nandou 5 A034, A201, A231, A291 IV C1 宁镇3号Ningzhen 3 A084 III C1 中黄7号 Zhonghuang 7 A034, A231 II C1 中黄9 Zhonghuang 9 A034 II C1 徐豆8号 Xudou 8 A231, A295 II C1 徐豆10号 Xudou 10 A034, A133, A231, A295 II C1 徐豆11 Xudou 11 A034, A133, A231, A295 II C1 徐豆12 Xudou 12 A034, A133, A231, A295 II C1 齐黄29 Qihuang 29 A133 II C1 齐黄28 Qihuang 28 A133 II C1 贡豆11 Gongdou 11 A034, A133, A201, A231 IV C1 宁镇2号 Ningzhen 2 A084 III C1 合丰36 Hefeng 36 A019 I C2 豫豆25 Yudou 25 A034, A122, A133, A231, A295 II C2 豫豆22 Yudou 22 A002, A034, A084, A122, A133, A231, A295 II C2 豫豆21 Yudou 21 A034, A122, A133, A231, A295 II C2 豫豆23 Yudou 23 A034, A122, A133, A231, A295 II C2 豫豆28 Yudou 28 A002, A034, A084, A122, A133, A231, A295 II C2 滑豆20 Huadou 20 A034, A122, A133, A231, A295 II C2 地神21 Dishen 21 A002, A034, A084, A122, A133, A231, A295 II C2 豫豆12 Yudou 12 A122, A295 II C2 黔豆3号 Qiandou 3 A084, A201, A291 V C2 黔豆5号 Qiandou 5 A133, A201 V C2 科新3号 Kexin 3 A122, A295 II C2 桂早1号 Guizao 1 A291 IV C3 豫豆29 Yudou 29 A034, A122, A133, A231, A295 II D1 南农87C-38 Nannong 87C-38 A231, A295 III D1 南农菜豆1号Nannongcaidou 1 A084 III D1 南农73-935 Nannong 73-935 A002, A084 III D1 南农493-1 Nannong 493-1 A002 III D1 淮豆2号Huaidou 2 A034 III D1 南农1138-2 Nannong 1138-2 A084 III D1 58-161 A034 II D1 灌豆1号 Guandou 1 A002, A034, A231 II D1 淮豆1号 Huaidou 1 A002, A034, A231 II D1 南农86-4 Nannong 86-4 A084 III D1 南农88-48 Nanong 88-48 A002, A084 III D1 宁镇1号 Ningzhen 1 A084 III D1 苏7209 Su 7209 A002, A034 III D1 苏协4-1 Suxie 4-1 A002, A034 III D1 苏豆3号 Sudou 3 A002, A034 III D1 泗豆11 Sidou 11 A034 II D1 徐豆7号 Xudou 7 A231 II

(续附表) 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars

(续附表)
Supplemental Table
(续附表)(Supplemental Table)

(续附表) 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars 类 Cluster 品种 Variety 祖先亲本 Ancestor 区 Eco-region D1 徐豆3号 Xudou 3 A034, A231 II D1 南农88-31 Nannong 88-31 A002, A084 III D1 通豆3号 Tongdou 3 A002, A034 III D1 淮豆6号 Huaidou 6 A002, A034, A133, A231, A295 II D1 淮豆3号Huaidou 3 A034, A231 II D1 南农99-10 Nannong 99-10 A002, A084 III D1 徐豆1号 Xudou 1 A231 II D1 兖黄1号 Yanhuang 1 A133 II D2 齐黄22 Qihuang 22 A133, A295 II D2 鲁豆1号 Ludou 1 A133, A295 II D2 菏84-4 He 84-4 A034, A231 II D2 莒选23 Juxuan 23 A133 II D2 贡豆7号 Gongdou 7 A133, A201 IV D2 淮豆4号 Huaidou 4 A002, A034, A231 II D2 为民1号 Weimin 1 A133, A295 II D2 鲁豆12号Ludou 12 A034, A133, A231, A295 II D2 贡豆2号 Gongdou 2 A034, A231 IV D2 贡豆6号 Gongdou 6 A034, A231 IV D2 贡豆4号Gongdou 4 A034, A133, A201, A231, A295 IV E1 苏豆1号 Sudou 1 A002, A034 III E1 科丰53 Kefeng 53 A034, A231 II E1 黔豆4号 Qiandou 4 A133 V E1 豫豆3号 Yudou 3 A034, A133 II E1 早熟18 Zaoshu 18 A034, A231 II E1 中黄4号 Zhonghuang 4 A034, A231 II E1 早熟6号Zaoshu 6 A034, A231 II E1 中黄6号 Zhonghuang 6 A034, A231 II E1 中黄8号Zhonghuang 8 A133 II E1 文丰7号Wenfeng 7 A133, A295 II E1 周7327-118 Zhou 7327-118 A133, A295 II E1 豫豆19 Yudou 19 A034, A122, A133, A231 II E1 濮海10号 Puhai 10 A034, A122, A133, A231, A295 II E1 豫豆8号 Yudou 8 A034, A133 II E1 豫豆16 Yudou 16 A034, A122, A133 II E1 商丘1099 Shangqiu 1099 A034, A122, A231, A295 II E1 地神22 Dishen 22 A002, A034, A084, A122, A133, A231, A295 II E1 中豆20 Zhongdou 20 A002, A034, A084, A133, A231 III E1 苏协1号 Suxie 1 A002, A084 III E1 中豆19 Zhongdou 19 A002, A084, A231 II E1 中豆8号 Zhongdou 8 A084 III E1 绥农14 Suinong 14 A019 I E1 合丰33 Hefeng 33 A019 I E1 抗线虫5号 Kangxianchong 5 A019 I E1 八五七-1 857-1 A019 I E1 九农20 Jiunong 20 A019 I

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(续附表) 供试的179份大豆品种聚类结果 Supplemental Table Clusters of 179 soybean cultivars 类 Cluster 品种 Variety 祖先亲本 Ancestor 区 Eco-region E2 皖豆9号 Wandou 9 A034, A231, A295 II E2 皖豆16 Wandou 16 A034 II E2 皖豆1号Wandou 1 A231 II E2 皖豆6号 Wandou 6 A002, A295 II E2 合豆2号 Hedou 2 A034, A122, A133, A231, A295 III E2 皖豆21 Wandou 21 A034 II E2 皖豆3号 Wandou 3 A034, A231 III E2 诱处4号 Youchu 4 A034, A231 II E2 诱变31 Youbian 31 A034, A231 II E2 科丰35 Kefeng 35 A034, A231 II E2 诱变30 Youbian 30 A034, A231 II E2 合豆3号 Hedou 3 A034, A231 III E2 阜豆1号 Fudou 1 A034, A231 II F1 中豆30 Zhongdou 30 A201 III F1 中豆29 Zhongdou 29 A201 III F1 湘春豆20 Xiangchundou 20 A201 IV F1 湘春豆19 Xiangchundou19 A201 IV F1 湘春豆16 Xiangchundou 16 A201 IV F1 湘春豆22 Xiangchundou 22 A201 IV F1 湘春豆23 Xiangchundou 23 A201, A291 IV F1 湘春豆15 Xiangchundou 15 A201 IV F1 湘春豆10号 Xiangchundou 10 A201 IV F1 中豆32 Zhongdou 32 A201 III F1 早春1号 Zaochun 1 A291 III F1 鄂豆7号 Edou 7 A034, A231, A291 III F1 鄂豆5号 Edou 5 A291 III F1 矮脚早 Aijiaozao A291 III F1 中豆24 Zhongdou 24 A291 III F1 GS郑交9525 GS Zhengjiao 9525 A034, A122, A133, A231, A295 II F1 郑92116 Zheng 92116 A034, A122, A133, A231, A295 II F1 郑90007 Zheng 90007 A034, A084, A133, A231, A295 II F1 郑长交14 Zhengchangjiao 14 A122, A295 II F1 郑交107 Zhengjiao 107 A034, A122, A231, A295 II F2 贡豆9号 Gongdou 9 A201 IV F2 贡豆8号 Gongdou 8 A034, A133, A201, A231, A291 IV F2 贡豆12 Gongdou 12 A034, A133, A201, A231, A295 IV F2 贡豆5号 Gongdou 5 A034, A133, A201, A231, A295 IV F2 贡豆10号 Gongdou 10 A133, A201, A295 IV F2 川豆5号 Chuandou 5 A201 IV F2 川豆4号 Chuandou 4 A291 IV F2 成豆9号 Chengdou 9 A291 IV F2 徐豆9号 Xudou 9 A122, A295 II F2 赣豆4号 Gandou 4 A034, A201 IV F2 苏豆4号 Sudou 4 A291 III

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The authors have declared that no competing interests exist.
作者已声明无竞争性利益关系。The authors have declared that no competing interests exist.

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[1]	Cui Z L, Carter T E, Burton J W. Genetic diversity patterns in Chinese soybean cultivars based on coefficient of parentage. Crop Sci, 2000, 40: 1780-1793[本文引用:2][JCR: 1.513]
[2]	Zhou X G, Carter T E, Cui Z L, Miyazaki S, Burton J W. Genetic diversity patterns in Japanese soybean cultivars based on coefficient of parentage. Crop Sci, 2002, 42: 1331-1342[本文引用:2][JCR: 1.513]
[3]	盖钧镒, 崔章林. 中国大豆育成品种的亲本分析. 南京农业大学学报, 1994, 17: 19-23 Gai J Y, Cui Z L. Ancestral analysis of soybean cultivars released in China. J Nanjing Agric Univ, 1994, 17: 19-23 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1][CJCR: 0.916]
[4]	Sneller C H. Pedigree analysis of elite soybean lines. Crop Sci, 1994, 34: 1515-1522[本文引用:1][JCR: 1.513]
[5]	Bharadwaj C H, Satyavathi C T, Tiwari S P. Genetic base of soybean (Glycine max) varieties released in India as revealed by coefficient of parentage. Ind J Agric Sci, 2002, 72: 467-469[本文引用:1]
[6]	Bonato A L V, Calvo E S, Geraldi I O, Arias C A A. Genetic similarity among soybean (Glycine max (L. ) Merrill) cultivars released in Brazil using AFLP markers. Genet Mol Biol, 2006, 29: 692-704[本文引用:1][JCR: 0.744]
[7]	Narvel J M, Fehr W R, Chu W S, Grant D, Shoemaker R C. Simple sequence repeat diversity among soybean plant introductions and elite genotypes. Crop Sci, 2000, 40: 1452-1458[本文引用:1][JCR: 1.513]
[8]	Abe J, Xu D H, Suzuki Y, Kanazawa A, Shimamoto Y. Soybean germplasm pools in Asia revealed by nuclear SSRs. Theor Appl Genet, 2003, 106: 445-453[本文引用:1][JCR: 3.658]
[9]	Mimura M, Coyne C J, Bambuck M W, Lumpkin T A. SSR diversity of vegetable soybean [Glycine max (L. ) Merr. ]. Genet Resour Crop Evol, 2007, 54: 497-508[本文引用:1][JCR: 1.593]
[10]	Wang L X, Guan R X, Li Y H, Lin F Y, Luan W J, Li W, Ma Y S, Liu Z X, Chang R Z, Qiu L J. Genetic diversity of Chinese spring soybean germplasm revealed by SSR markers. Plant Breed, 2008, 127: 56-61[本文引用:1][JCR: 1.175]
[11]	Ude G N, Kenworthy W J, Costa J M, Cregan P B, Alvernaz J. Genetic diversity of soybean cultivars from China, Japan, North America, and North American ancestral lines determined by amplified fragment length polymorphism. Crop Sci, 2003, 43: 1858-1867[本文引用:1][JCR: 1.513]
[12]	Fu Y, Peterson G W, Morrison M J. Genetic diversity of Canadian soybean cultivars and exotic germplasm revealed by simple sequence repeat markers. Crop Sci, 2007, 47: 1947-1954[本文引用:1][JCR: 1.513]
[13]	Yamanaka N, Sato H, Yang Z, Xu D H, Catelli L L, Arias C A A, Abdelnoor R V, Nepomuceno A L. Genetic relationships between Chinese, Japanese, and Brazilian soybean gene pools revealed by simple sequence repeat (SSR) markers. Genet Mol Biol, 2007, 30: 85-88[本文引用:1][JCR: 0.744]
[14]	Priolli R H G, Mendes-Junior C T, Sousa S M B, Sousa N E A, Contel E P B. Soybean genetic diversity in time and among breeding programs in Brazil. Pesq Agropec Bras, 2004, 39: 967-975[本文引用:1]
[15]	Priolli R H G, Mendes-Junior C T, Arantes N E, Contel E P B. Characterization of Brazilian soybean cultivars using microsatellite markers. Genet Mol Biol, 2002, 25: 185-193[本文引用:1][JCR: 0.744]
[16]	关荣霞, 郭娟娟, 常汝镇, 邱丽娟. 国外种质对中国大豆育成品种遗传贡献的分子证据. 作物学报, 2007, 33: 1393-1398 Guan R X, Guo L L, Chang L Z, Qiu L J. Marker-based evidence of broadening the genetic base of Chinese soybeans by using introduced soybeans. Acta Agron Sin, 2007, 33: 1393-1398 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1][CJCR: 1.667]
[17]	张军, 赵团结, 盖钧镒. 亚洲大豆栽培品种遗传多样性、特异性和群体分化研究. 中国农业科学, 2008, 41: 3511-3520 Zhang J, Zhao T J, Gai J Y. Genetic diversity, specificity and population differentiation of soybean cultivars in Asia. Sci Agric. Sin, 2008, 41: 3511-3520 (in Chinese with English abstract)[本文引用:4]
[18]	Maccaferri M, Sanguineti M C, Xie C, Smith J S, Tuberosa R. Relationships among durum wheat accessions: II. A comparison of molecular and pedigree information. Genome, 2007, 50: 385-399[本文引用:1][JCR: 1.668]
[19]	Van Becelaere G, Lubbers E L, Paterson A H, Chee P W. Pedigree- vs. DNA marker-based genetic similarity estimates in cotton. Crop Sci, 2005, 45: 2281-2287[本文引用:1][JCR: 1.513]
[20]	张军, 赵团结, 盖钧镒. 我国黄淮和南方主要大豆育成品种家族产量和品质优异等位变异在系谱中遗传的研究. 作物学报, 2009, 35: 191-201 Zhang J, Zhao T J, Gai J Y. Inheritance of elite alleles of yield and quality traits in the pedigrees of major cultivar families released in Huanghuai Valleys and Southern China. Acta Agron Sin, 2009, 35: 191-201 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1][CJCR: 1.667]
[21]	熊冬金, 赵团结, 盖钧镒. 中国大豆育成品种亲本分析. 中国农业科学, 2008, 41: 2589-2598 Xiong D J, Zhao T J, Gai J Y. Parental analysis of soybean cultivars released in China. Sci AgricSin, 2008, 41: 2589-2598 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1][JCR: 1.44]
[22]	熊冬金, 赵团结, 盖钧镒. 1923—2005年中国大豆育成品种的核心祖先亲本分析. 大豆科学, 2007, 26: 2589-2598 Xiong D J, Zhao T J, Gai J Y. The core ancestors of soybean cultivars released during 1923-2005 in China. Soybean Sci, 2007, 26: 2589-2598 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1]
[23]	Aljanabi S M, Forget L, Dookun A. An improved and rapid protocol for the isolation of polysaccharide- and polyphenol-free sugarcane DNA. Plant Mol Biol Rep, 1999, 17: 181[本文引用:1][JCR: 5.319]
[24]	Song Q J, Marek L F, Shoemaker R C, Lark K G, Concibido V C, Delannay X, Specht J E, Cregan P B. A new integrated genetic linkage map of the soybean. Theor Appl Genet, 2004, 109: 122-128[本文引用:1][JCR: 3.658]
[25]	Cox T S, Kiang Y T, Gorman M B, Rodgers D M. Relationship between coefficient of parentage and genetic similarity indices in the soybean. Crop Sci, 1985, 25: 529-532[本文引用:1][JCR: 1.513]
[26]	Cui Z L, Carter T E, Burton J W, Genetic base of 651 Chinese soybean cultivars released during 1923 to 1995. of 651 Chinese soybean cultivars released during 1923 to 1995. Crop Sci, 2000, 40: 1470-1481[本文引用:1][JCR: 1.513]
[27]	Liu K, Muse S V. PowerMarker: An integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 2005, 21: 2128-2129[本文引用:1][JCR: 5.323]
[28]	Nei M, Tajima F, Tateno Y. Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. J Mol Evol, 1983, 19: 153-170[本文引用:1][JCR: 2.145]
[29]	盖钧镒, 赵团结, 崔章林, 邱家驯. 中国大豆育成品种中不同地理来源种质的遗传贡献. 中国农业科学, 1998, 31: 35-43 Gai J Y, Zhao T J, Cui Z L, Qiu J X. Nuclear and cytoplasmic contributions of germplasm from distinct areas to the soybean cultivars released during 1923-1995 in China. Sci AgricSin, 1998, 31: 35-43 (in Chinese with English abstract)[本文引用:1][JCR: 1.44]
[30]	Barrett B A, Kidwell K K, Fox P N. Comparison of AFLP and pedigree-gased genetic diversity assessment methods uing wheat cultivars from the Pacific Northwest. Crop Sci, 1998, 38: 1271-1278[本文引用:1][JCR: 1.513]