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中国科学院生物物理研究所研究生导师简介-陈润生
生物物理研究所 免费考研网/2013-11-28
陈润生院士
RunshengChen,Prof.,MCAS
专家类别:院士,研究员
简历&研究组工作摘要:1964年,毕业于中国科技大学生物物理系1978-1980年,吉林大学理论化学进修班学习1985-1987年,获洪堡奖学金在德国纽伦堡大学从事量子生物学研究1994-2003年,作为访问学者或访问教授先后在香港中文大学;美国加州洛杉矶大学;美国哈佛大学;日本大阪大学蛋白质研究所;台湾理论科学中心等从事合作研究。1989年至今,生物物理研究所研究员2007年11月,当选中国科学院院士现为国际人类基因组组织(HUGO)会员;国际数据库组织(CODATA)生物大分子专业组委员。国际纯粹及应用物理学会(IUPAP)生物信息学专业委员会委员;国际学术期刊《JournalofTheoreticalBiology》的编委陈润生院士是我国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究,曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识,曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。共发表SCI学术论文120余篇,自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告二十余次。由于其在基因组信息学领域的早期工作,1996年9月29日至10月3日在日本筑波召开的第十五届国际科学技术数据委员会(CODATA)大会上应邀作"KotaniMemorialLecture",同时获得“小谷正雄”奖("KotaniPrize",生物领域)
Biography&Introduction1964:GraduatedfromDepartmentofBiophysics,UniversityofScienceandTechnologyofChina(USTC)1978-1980:Postgraduate:InstituteofTheoreticalChemistry,JilinUniversity1985.6-1987.8:InstituteforTheoreticalChemistry,UniversityErlangen-Nurnberg,FRG,asaFellowofAlexandervonHumboldtFoundation.1994-2003:Dept.ofStatistics,theChineseUniversityofHongKong;InterdivisionalPrograminStatistics,theUniversityofCaliforniaatLosAngeles(UCLA);DepartmentofBiostatistics,HarvardUniversity;InstituteofProteinResearch,OsakaUniversity,Japan;NationalCenterforTheoreticalSciences,Taiwan;asaVisitingScholarorVisitingProfessor.ProfessorRunshengChenisoneofthepioneerscholarsdevelopingtheresearchesontheoreticalbiologyandbioinformaticsinChina.Formorethantwentyyears,Prof.Chenhasledhisgrouptoperformaseriesofsystemicresearchesinthefieldofbioinformatics,includingthewholegenomeassemblyandannotationforT.tengcongensisB4(thefirstbacteriumgenomecompletelysequencedinChina),the1%HumanGenomeProject,andtheDraftSequenceoftheRiceGenome.Sofar,Prof.Chenhaspublishedmorethan120papersinSCI,andmademorethan20conferenceorgroupreportsintheinternationalacademicconferencessince1996.Forhisoutstandingearlystudiesongenomicinformatics,Prof.Chenwasinvitedtogivethe"KotaniMemorialLecture"onthe15thInternationalCODATAConference,Tsukuba,Japan,29Sep.-Oct.1996,andthenselectedasthewinnerof"KotaniPrize".
SelectedPublications:1.WangY,ChenJ,WeiG,HeH,ZhuX,XiaoT,YuanJ,DongB,HeS,Skogerb?G,ChenR.TheCaenorhabditiselegansintermediate-sizetranscriptomeshowshighdegreeofstage-specificexpression.NucleicAcidsRes,2011,39(12),5203-142.HeSM,SuH,LiuCN,SkogerboG,HeHS,HeDD,ZhuXP,LiuT,ZhaoY,ChenRS*.MicroRNA-encodinglongnon-codingRNAs.BMCGenomics2008,9:236.3.HSHe,JWang,TLiu,XSLiu,TTLi,YFWang,ZWQian,HXZheng,XPZhu,TWu,BCShi,WDeng,WZhou,GSkogerb?andRSChen,MappingtheC.elegansnoncodingtranscriptomewithawhole-genometilingmicroarray,GENOMERES,2007,17(10):1471-1477.4.SMHe,CNLiu,GSkogerb?HTZhao,JWang,TLiu,BYBai,YZhaoandRSChen,NONCODEv2.0:decodingthenon-coding,NucleicAcidsRes,2007,1-3.doi:10.1093/nar/gkm1011.5.SunH,SkogerboG,ChenRS,Conserveddistancesbetweenvertebratehighlyconservedelements,HUMMOLGEN2006,5(19):2911-2922.6.ZhangZH,LiuCN,SkogerboG,ZhuX,LuH,ChenL,ShiB,ZhangY,WangJ,WuT,ChenR,DynamicchangesinsubgraphpreferenceprofilesofcrucialtranscriptionfactorsPLOSCOMPUTBIO,2006,2(5):383-391.7.DengW,ZhuXP,SkogerboG,………,ChenR.OrganizationoftheCaenorhabditiseleganssmallnon-codingtranscriptome:Genomicfeatures,biogenesis,andexpression.GENomeRES,2006,16(1):20-29.8.YongZhang,ZhihuaZhang,LunjiangLing,BaochenShiandRunshengChen.ConservationanalysisofsmallRNAgenesinEscherichiacoli.BIOINFORMATICS20,599-603(2004).9.DongboBu,YiZhao,LunCai,HongXue,XiaopengZhu,HongchaoLu,JingfenZhang,ShiweiSun,LunjiangLing,NanZhang,GuojieLiandRunshengChen,Topologicalstructureanalysisoftheprotein-proteininteractionnetworkinbuddingyeast.NUCLEICACIDSRES31(9),2443-2450(2003).10.QiyuBao,……,RunshengChen,……,HuanmingYang.ACompleteSequenceoftheThemoanaerobactertengcongensisGenome.GENOMERES12,689-700(2002).11.J.Yu,…….,R.S.Chen,……H.M.Yang.ADraftSequenceoftheRiceGenome(OryzasativaL.ssp.Indica).Science296,79-92(2002).
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