梁喜丽, 鲁兴萌, 邵勇奇
浙江大学动物科学学院, 家蚕病理学与病害控制研究室, 浙江 杭州 310058
收稿日期：2017-10-08；修回日期：2017-12-06；网络出版日期：2018-01-24
基金项目：国家自然科学基金（31601906）；中央高校基本科研业务费专项资金（2017QNA6024）；浙江大学-****
作者简介：邵勇奇, 博士, 浙江大学动物科学学院研究员。主要以鳞翅目昆虫家蚕、斜纹夜蛾等为模型来进行农业昆虫与微生物相互作用的应用基础研究, 多学科交叉, 特别是在昆虫肠道菌群的分布及功能、生物防治、微生物资源利用等领域发展新的研究方法(Pyro-SIP), 进行深入探索, 从分子、细胞和整体水平上系统揭示共生微生物与宿主昆虫相互作用的机理。这些工作先后在微生物学、昆虫学领域重要学术刊物ISME Journal、Cell Chemical Biology、Applied Microbiology and Biotechnology、Insect Biochemistry and Molecular Biology等发表
*通信作者：邵勇奇, Tel:+86-571-88982757, E-mail:yshao@zju.edu.cn
摘要：微孢子虫广泛存在于鳞翅目昆虫中，是一类重要的病原微生物。微孢子虫病一方面影响野外昆虫种群的自然平衡，另一方面对家蚕、柞蚕等经济和资源昆虫造成了严重的危害。微孢子虫分子生物学研究基础相对薄弱，再加上微孢子虫表面坚厚的孢壁，无疑增加了研究难度。随着核酸、蛋白质等生物大分子分离制备方法和高通量测序技术的不断更新发展，基于各种组学（Omics）研究微孢子虫的工作方兴未艾，并且有了一些重要的发现。本文综述了微孢子虫与鳞翅目昆虫寄主的相互作用及寄生于鳞翅目昆虫的病原微孢子虫基因组、转录组和蛋白质组进展情况，以期为微孢子虫的深入研究提供参考。这些昆虫微生物研究将为鳞翅目害虫生物防治提供新的思路，并对家蚕等经济昆虫微粒子病的诊断、防控及治疗产生积极影响。
关键词： 微孢子虫 鳞翅目 生物大分子 组学
Advances in studies on Lepidoptera microsporidium pathogen
Xili Liang, Xingmeng Lu, Yongqi Shao
Laboratory of Invertebrate Pathology, College of Animal Sciences, Zhejiang University, Hangzhou 310058, Zhejiang Province, China
Received 8 October 2017; Revised 6 December 2017; Published online 24 January 2018
*Corresponding author: Yongqi Shao, Tel:+86-571-88982757, E-mail:yshao@zju.edu.cn
Supported by the National Natural Science Foundation of China (31601906), by the Fundamental Research Funds for the Central Universities (2017QNA6024) and by the "Hundred Talents Program" from Zhejiang University
Abstract: As an important pathogenic microorganism, microsporidia are widely found in Lepidopteran insects. Microsporidia diseases not only affect the natural balance of wild insect populations, but also are detrimental to the economic and resource insects such as Bombyx mori and Antheraea pernyi. The molecular biology of microsporidia is relatively less studied and the microsporidian spore wall is fairly rigid. These disadvantages make the study of microsporidia more difficult. With the rapid development of the sequencing technique and the preparation method of nucleinic acid, protein and other biomacromolecules, various microsporidia researches based on Omicsare now reported, which have significantly contributed to this field. Our review focouses on interactions between microsporidian parasites and their Lepidopteran hosts, and recent progress in microsporidia genome, transcriptome and proteome studies. The further research of insect microsporidia will provide new insights on the biocontrol of lepidopteran pests and improve the diagnosis, prevention and treatment of the microsporidia diseases of economic insects as well.
Key words: microsporidia Lepidoptera biomolecules omics
昆虫是地球上数量最多的动物群体，大量微生物与昆虫共生，直接或间接对宿主发挥着重要的作用[1]。有益共生菌对昆虫自身的生长发育发挥有益作用，如为宿主合成重要的营养成分、参与代谢解毒、免疫健康等[2-3]。反之，病原菌、有害微生物可引起昆虫致病和死亡[4]。微孢子虫(Microsporidia)是一类专性细胞内寄生的单细胞真核生物，其寄主分布十分广泛，能够感染昆虫、鱼类、哺乳动物甚至患有免疫缺陷疾病的人类。早期通过形态学分析曾把微孢子虫归类为原生动物门(Profozoa)，后来随着分子生物学的发展，利用分子标记构建的系统发育树等都表明微孢子虫是从真菌分化而来，更接近于真菌[5]。家蚕微孢子虫Nosema bombycis于19世纪中期在家蚕Bombyx mori (鳞翅目蚕蛾科)中分离并命名，是第一个被人类认识的微孢子虫，由此开启了对微孢子虫研究的大门。由于该病原能够经卵垂直传播和水平传播，家蚕微孢子虫引起的家蚕微粒子病依然是对养蚕业最具威胁的毁灭性病害之一[6-8]。
迄今，已有超过200属的1300–1500种微孢子虫被发现，可侵染以双翅目和鳞翅目为主的400种以上的昆虫[9]。由于鳞翅目中既有严重危害农作物的害虫(如斜纹夜蛾、甜菜夜蛾等植食性害虫)，又有能够授粉(如菜粉蝶、黄蛱蝶和柑橘凤蝶)和产生经济效益的益虫(如家蚕、柞蚕等绢丝昆虫)，很多****对寄生于鳞翅目昆虫的微孢子虫特别是家蚕微孢子虫，进行了大量的实验研究，取得了诸多重要成果，如发现了能够使极管束缚在孢子壁的具有支架作用的孢壁蛋白NbSWP9[10]。家蚕微孢子虫基因组的解析及相关分子生物学的发展也极大地促进了微孢子虫的研究[11]，目前对其他鳞翅目昆虫微孢子虫的组学研究还较少。包括家蚕微孢子虫在内的部分鳞翅目昆虫微孢子虫在交换寄主后对其他目的昆虫仍然具有较强的致病性[12]，而一些微孢子虫仅对鳞翅目昆虫具有致病性[13]。虽然对昆虫微孢子虫的研究和报道已有不少[14-16]，但却鲜有仅针对鳞翅目该类寄生虫进行综述的文章。因此，本文将围绕这些鳞翅目昆虫病原微孢子虫介绍相关研究进展，包括微孢子虫对寄主的侵染及组学研究方法的应用，以期为进一步深入探究病原微孢子虫与寄主相互作用提供参考，以及转化这些知识来防治害虫(如利用微孢子虫生物防治斜纹夜蛾等)并保护益虫(如防控家蚕微粒子病等)。
1 微孢子虫与鳞翅目寄主之间的相互作用 1.1 微孢子虫的侵染过程 在鳞翅目中目前发现约有39种昆虫可被37种微孢子虫侵染，我们利用邻位相连法对其中12种主要微孢子虫构建了系统进化树(图 1)。进化分析表明，一些微孢子虫的寄主并不固定，如N. bombycis和变形孢虫属微孢子虫Vairimorpha necatrix具有相对较广的寄主范围；同样，同一寄主如小菜蛾Plutella xylostella (鳞翅目菜蛾科)也可被几种不同的微孢子虫侵染。病原体-寄主相互作用是物种多样化的主要驱动力，Hu等通过对绿僵菌属(Metarhizium)的7个物种的基因组分析表明，能够广泛寄生的真菌物种是通过具有中间宿主范围的过渡物种演化而来，这种转变与昆虫进化相平衡[17]。微孢子虫作为一种能够广泛寄生的病原真菌从被发现(瑞士植物学家卡尔?威廉?内格里于1857年从家蚕中发现了家蚕微孢子虫N. bombycis)至今已有160年[7]，但一直以来并未发现其过渡物种存在的证据。真菌的专一宿主寄生性与性别保留和现有蛋白质的快速进化有关，而其广泛寄生的特性则与蛋白质家族的扩张、基因组防御机制的缺失、基因组重组和水平基因转移有关[17]。在野外环境中寄主尸体或粪便中的微孢子虫常随着食物链的延伸而变更寄主，微孢子虫本身的多样性和其寄主多样性使包括养蚕业和蜂业在内的经济产业在防治微粒子病方面面临巨大的威胁。
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| 图 1 微孢子虫与其鳞翅目昆虫寄主的系统发育比较 Figure 1 Comparison of phylogenies of Microsporidia and their Lepidoptera hosts. NJ tree based on the sequence of small subunit ribosomal RNA gene and dopa decarboxylase gene. |
| 图选项 |
相比其他病毒性、细菌性疾病，微孢子虫的侵染和发病是一个相对缓慢的过程[18]。鳞翅目昆虫取食混有微孢子虫的食物后，孢子在消化道内强碱性环境(pH > 10)的刺激下发芽，发芽的孢子通过一种爆发性外翻的“注射针”(即极管、极丝或入侵管)等方式将孢原质注射到寄主细胞的细胞质中[19-22]。这种入侵方式是通过微孢子虫后极泡和寄主细胞的质膜发生相互反应，引发极丝的弹出和肌动蛋白介导的孢原质的吞没造成[23]。一些病原性真菌能够通过分泌蛋白酶作用于昆虫的表皮蛋白，以此增强其侵染力[24]。因此有****猜测，孢子的发芽及侵染也可能并不单纯依靠外界的环境，而是由适宜的外界条件激活具有蛋白酶活性的表面蛋白进行侵染[25]，尤其是以吞噬方式建立感染时尤为显著[26]。吞噬方式在其他微孢子虫中已有实证，家蚕微孢子虫传统上也有两种侵染方式，但吞噬方式的实验证据相对较少。
大多数微孢子虫在寄主细胞的细胞质中发育，或者在来源于寄主也可能来源于孢子囊的纳虫空泡内发育[27]。在极少数情况下，它们侵入寄主细胞核[28]，如寄生于檗黃粉蝶Eurema blanda arsakia (鳞翅目粉蝶科)的微孢子虫(Nosema sp.)更倾向于在寄主细胞核中发育[29]。
1.2 微孢子虫的侵染部位及症状 微孢子虫可以通过侵染昆虫的中肠、脂肪体、马氏管、卵巢甚至是神经引起昆虫的流行病[30]。这种侵染主要体现在掠夺寄主的养分、分泌蛋白酶溶解细胞内容物、机械性破坏寄主细胞完整性等方面[14]。例如，棉铃虫微孢子虫Nosema sp.对棉铃虫Helicoverpa armigera (鳞翅目夜蛾科)的寄生能够导致寄主中肠微绒毛的脱落、线粒体的大小和内脊的方向发生变化并最终瓦解[31]。Kermani等通过组织学观察发现Nosema属微孢子虫会优先侵染小菜蛾的脂肪组织和中肠上皮细胞[32]，并在其细胞质中产生含有消化液的空泡，然后再将细胞器微绒毛和形成的空泡破坏[33]。Johny等从斜纹夜蛾Spodoptera litura (鳞翅目夜蛾科)中分离的微孢子虫能够系统性地侵染寄主，并在其中肠、神经组织、肌肉、下唇腺、性腺、气管、上皮、马氏管等组织中产生成熟的孢子，而在脂肪体中成熟的孢子数量最多[13]。相对于N. bombycis在家蚕体内的全身性寄生，从甜菜夜蛾Laphygma exigua (鳞翅目夜蛾科)幼虫分离到的一种微孢子虫在转染家蚕时主要寄生于气管[34]。可见不同种的微孢子虫在不同寄主中显示出了一定组织倾向性，但是这种特异性产生的原因有待于进一步探明。
微孢子虫严重寄生还能导致寄主外观上的变化，例如颜色和体型的改变。大黑点白蠹蛾Ocinara lida Moore (鳞翅目蚕蛾科)在被Vairimorpha ocinarae感染的早期并不出现明显的症状，但在感染的末期幼虫身体从褐色变为浅黄褐色，腹部皮肤透明度增加，肠道肿胀变为浅黄褐色且内部充满液体，而马氏管变为浅粉色、脂肪体萎缩。寄主死亡后，伴随着软组织聚集到身体的后半部分，产生球状外观[35]。斜纹夜蛾幼虫在感染严重时同样出现了体色变为粉色、外型肿胀的现象[13]。
脂肪体是生物合成和储存能量的主要器官[36]，同时也是昆虫生长、发育、变态和生殖等代谢活动的中心组织[37]。值得注意的是，几乎所有种类的微孢子虫都会不同程度地侵染脂肪体，甚至在其中成熟[13]。微孢子虫对鳞翅目昆虫的感染大多是孢子储存于各组织中，脂肪体全部被侵染，不断充满孢子[14]。由于脂肪体组织遍布于昆虫体腔，大部分脂肪体位于腹部与消化道紧密联系[37]，因此脂肪体的严重侵染可能是致使被侵染的寄主体型肿胀变大的重要原因。脂肪体同时也是保幼激素酯酶合成的主要位置[38]。当幼虫的体重或体型达到某一界限时，保幼激素酯酶活性提高，促使其进入蜕皮阶段[39-40]。Karlhofer等利用舞毒蛾Lymantria dispar (鳞翅目毒蛾科)幼虫发现，微孢子虫在脂肪体中侵染繁殖时大量消耗寄主的养分，使寄主处于一种类饥饿的状态，保幼激素酯酶合成活性降低，幼虫不能进行正常的发育蜕皮，从而导致蛹化失败[41]。
2 鳞翅目昆虫病原微孢子虫组学研究 2.1 微孢子虫核酸、蛋白质生物大分子材料获取 任何深入细致的生物学研究都离不开实验对象，实验材料的好坏甚至能够直接影响实验成功与否。微孢子虫胞内寄生的特点及寄主复杂的肠道菌群使获得相对纯净的微孢子虫变得尤为复杂。微孢子虫分离纯化步骤一般是先将携带微孢子虫的感病个体用研钵或组织匀浆器研磨，然后用棉花、纱布、尼龙滤网等过滤除掉大块的杂质，接着用差速离心法除掉相对较小的杂质，最后用超速或高速离心将孢子纯化[42-44]。
核酸、蛋白质等生物大分子物质在生命活动中发挥着广泛而重要的作用，是各种生命现象的基础。同样，对微孢子虫生物大分子的研究是揭示其生命活动机理的核心内容。由于微孢子虫体积小、孢壁厚、专性细胞内寄生，因而对微孢子虫的分子生物学研究在第一步获取核酸、蛋白质等生物大分子材料时便受到了不同程度的限制[7-8]。微孢子虫核酸提取主要包含两部分：破坏孢壁释放孢原质和抽提核酸。目前，破坏孢壁的常用方法有生物学方法(即发芽法)和物理学方法如研磨法、机械破碎法、反复冻融法等(表 1)。发芽法与物理破碎相比，具有纯化条件温和、对微孢子虫DNA损伤小的优势，但是核酸提取效率不高。黄少康等对不同来源的家蚕微孢子虫的比较研究发现，新鲜孢子的发芽率一般在30%–50%，经过冷藏后的孢子发芽率则更低[45]。液氮冻融研磨法对操作人员的技术要求较高，难以准确重复。机械破碎法的优点在于操作简单易行、速度快，把握好破碎的频率与时间是获得最佳破碎效果的关键，破碎过于剧烈使核酸遭到破坏，破碎不足则降低了破碎效率。蔡顺风等发现5500 r/min破碎6×20 s后用酚-氯仿法进行萃取的基因组数量和质量均优于发芽法和液氮研磨法，该方法相较于其他破壁方法具有简单快速的优势[46]。抽提核酸时除传统的手提法，E.Z.N.A Stool DNA Kit (Omega Bio-tek Inc，GA，USA)、MasterPure DNA purification Kit (Illumina，San Diego，CA)和QIAamp DNA Stool Mini Kit (Qiagen，Hilden，Germany)等均是提取效果相对较好的试剂盒。目前第三代基因组测序如Pacbio，具有超长读长、运行时间短、无需模板扩增和边合成边测序等特点。但是对于基因组DNA的质量要求相对较高，至少需要15 μg、长度大于50000 bp的高质量核酸。传统的微孢子虫核酸制备方法均达不到此要求，因此急需发展新的微孢子虫核酸获取方法。
表 1. 微孢子虫核酸制备方法 Table 1. DNA extraction protocol for Microsporidia
| Method | Methods for breaking spore wall | Afterward treatment | DNA extraction method** | Reference | |||
| Reagent* | Treatment & Time | Reagent | Treatment & Time | ||||
| Germination method | TEK buffer | 27 ℃ for 60 min | ? | ? | PCI | [47] | |
| KOH (2.0 mol/L) | 27 ℃ for more than 60 min | TEK buffer | 27 ℃ for 120 min | PCI | [48] | ||
| KOH (0.2 mol/L) | 27 ℃ for 60 min | PBS buffer (pH 7.4) | 25 ℃ for 30 min | PCI or kit | [49] | ||
| KHCO3+K2CO3 | 27 ℃ for 60 min | PBS buffer (pH 7.4) | 25 ℃ for 30 min | PCI | [50] | ||
| K2CO3 (0.2 mol/L) | 25 ℃ for 60 min | PB buffer (pH 7.8) | 25 ℃ for 40 min | PCI | [51] | ||
| Na2CO3+NaCl | Ice bath for 15 min | NaAc (3 mol/L) | 50 ℃ overnight | PCI | [48] | ||
| Freeze-Shaw method | ESS buffer | 50 ℃ for 120 min | ? | ? | PCI | [52] | |
| Microcentrifuge pestle | TECN buffer | Grind adequately | ? | ? | PCI | [53] | |
| Glass beads homogenize | NSET buffer | Vortex vigorously | SDS-Proteinase K method | Potassium acetate precipitation method | [54] | ||
| Cell lysis buffer | 700 g homogenize for 30 s, repeat 3 times | MasterPure DNA purification kit | [55] | ||||
| H2O | Homogenize at 5500 r/min for 20 s, repeat 6 times | Treat with Proteinase K by 240 min | PCI | [46] | |||
| *TEK buffer: 1 mmol/L Tris-HCl, 0.01 mol/L EDTA, 0.17 mol/L KCl, pH 8.0; KHCO3+K2CO3 buffer: 0.1 mol/L KHCO3, 0.1 mol/L K2CO3; Na2CO3+NaCl buffer: 0.1 mol/L Na2CO3, 0.15 mol/L NaCl; ESS buffer: 0.1 mol/L EDTA, 0.2% Sodium deoxycholate, 1% sodium N-lauroylsarcosinate, pH 8.0; TECN buffer: 0.1 mol/L Tris-HCl, 0.02 mol/L EDTA, 2% CTAB, 1.4 mol/L NaCl, pH 8.0; NSET buffer: 0.1 mol/L NaCl, 0.2 mol/L Sucrose, 0.01 mol/L EDTA, 0.03 mol/L Tris-HCl, pH 8.0; ** PCI: Phenol, chloroform and isoamyl alcohol (25:24:1). | |||||||
表选项
微孢子虫蛋白质常用提取方法有SDS法、煮沸法、碱溶法和Brosson法。吴正理等分别用这些方法提取了家蚕微孢子虫孢壁蛋白，并进行了比较研究和优化。在Brosson法中，先将孢子用TEK缓冲液发芽处理，然后将沉淀反复冻融进行Percoll (30000 r/min，30 min)密度梯度离心收集空壳层。结果表明，4种方法处理后的孢子形态均保持完整，从而保证所提取蛋白的含量。SDS处理后孢子为短杆状且明显变得粗壮，煮沸处理后孢子变小呈梭形，其他方法处理的孢子均有膨胀现象。SDS-PAGE检测显示，Brosson法提取的孢壁蛋白条带数明显多于其他方法，表明在分析孢壁蛋白丰富度时该方法可能更具优势[56]。此外，结合发芽法与密度梯度离心法，即0.1 mol/L碳酸钾28 ℃水浴1.5 h后用Percoll梯度密度离心(13000 r/min，40 min)，能够收集到较高纯度的孢壳[57]。蔡顺风等则用发芽法、液氮冻融研磨法和不同破碎频率、破碎时间的玻璃珠破碎法对家蚕微孢子虫的蛋白提取得率与丰度进行比较。分析显示玻璃珠破碎法(5500 r/min，6×20 s)的蛋白得率显著高于发芽法和液氮研磨法，且蛋白丰度也是3种方法中最好的。该方法操作简单、速度快、成本低，不需加入额外试剂，可最大程度地保持核酸和蛋白不被降解或污染[46]。
2.2 微孢子虫基因组、转录组和蛋白质组相关研究 随着高通量测序技术和质谱技术的不断发展与完善，不同层次和类型的生物组学的研究方法也日趋成熟与完善。基于基因组学、转录组学和蛋白质组学研究微孢子虫的工作方兴未艾，对病原微生物自身特性、侵染过程和对寄主的影响等方面都进行了解析。
大部分微孢子虫的基因组高度简化，其中兔脑炎微孢子虫Encephalitozoon cuniculi的基因组仅有2.9 Mb[58]。这是第一个完成全基因组测序的微孢子虫，测序共获得2000个蛋白编码基因，其中60%的基因为未知功能的基因。高度依赖于寄主的细胞内寄生生活方式使微孢子虫在进化过程中丢失了一些非生长繁殖所必需的基因，减少了内含子和非编码区域的数量，所以对微孢子虫基因组方面的研究主要集中在编码蛋白基因的鉴定及其在基因组中的分布情况、在染色体上的定位和不同微孢子虫间的基因组排布分析。潘国庆等利用全基因组霰弹法对N. Bombycis CQ1株进行全基因组测序，获得了家蚕微孢子虫全基因组的框架图。测序结果显示，N. Bombycis CQ1基因组大小15.7 Mb，蛋白质编码序列(coding sequence，CDS)占基因组全长的21%，重复序列占基因组总长的45.2%[11]。与兔脑炎微孢子虫相比，家蚕微孢子虫的偏好性更强，偏向于使用第三位是A/U的最优密码子。这种基因组特征的差异性可能由于两者不同的寄生环境所导致[59]。与柞蚕微孢子虫Nosema pernyi基因组(6.6 Mb)和蜜蜂Apis mellifera (膜翅目蜜蜂科)微孢子虫Nosema apis基因组(7.9 Mb)相比，家蚕微孢子虫基因组扩张程度更高，主要是因为寄主来源的转座子增殖、细菌来源的基因水平转移以及大量的基因复制。由于家蚕微孢子虫具有广泛的寄主范围，基因组的扩张可能有助于病原体提升在寄主内的适应性[11]。例如，与细胞毒性代谢途径相关的几个复制基因受到正向选择，暗示这种适应性进化在提高寄生虫侵染力上的重要作用。Wiredu等也发现Enterospora canceri能够通过转运蛋白家族的扩张增强对胞内寄生的适应性[60]。因此可以考虑将家蚕微孢子虫基因组中被复制的基因作为抵抗微粒子病的靶标。Xu等对菜粉蝶Pieris rapae (鳞翅目粉蝶科)体内分离到的微孢子虫Nosema sp. Isolate YNPr基因组进行Illumina二代测序。该微孢子虫基因组大小为3.36 Mb，GC含量为23.18%，具有2075个蛋白质编码序列。菜粉蝶微孢子虫大部分代谢相关基因数量与蜜蜂微孢子虫的相近，但是关于转录、一般功能和半胱氨酸蛋白酶基因的种类与转座子的数量少于蜜蜂微孢子虫。作者认为可能是自然选择导致了微孢子虫基因组小范围但活跃的改变[61]。
转录组学是研究微孢子虫与寄主相互作用的有利手段，一般通过不同处理方法或不同处理时间分别对微孢子虫和寄主转录组数据进行比较，找出其中差异表达基因并分析其生物学功能。孢子萌发是微孢子虫生活史中向侵染期转变的关键步骤[62]。Liu等利用RNA-Seq分析发芽微孢子虫和未发芽微孢子虫，结果发现在两组不同微孢子虫中有66个差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)，这些差异表达基因涉及糖代谢、孢壁蛋白和蓖麻毒素B凝集素等。其中磷酸酶蛋白相关基因的表达显著上调，表明脱磷酸化作用可能有助于孢子的发芽[63]。Yue等利用数字基因表达分析方法对经口感染家蚕微孢子虫的家蚕幼虫在感染后的6、12、18、24、48、72、96 h进行转录图谱分析，结果发现在这7个时间点内有80到773个DEGs。KEGG通路分析进一步发现这些差异表达基因主要与叶酸的生物合成、剪接体、烟酸和烟酰胺代谢、溶酶体的蛋白加工、核糖体的生物合成和RNA的降解有关[64]。
病原体对寄主的影响主要体现在扰乱寄主自身基础代谢和产生强烈的免疫反应。比如被微孢子虫寄生的家蚕其嘧啶、氨基酸、辅因子、维生素的代谢以及遗传信息的转录和外源性生物转化等基因在感染过程中均出现了显著的表达上调[65]。营养代谢的加速为寄主增强体质抵抗病原提供了保障，但无疑也被孢子利用进行繁殖。通常情况下，病原微生物的入侵能够刺激无脊椎动物模式识别受体(pattern recognition receptors，PRRs)，触发细胞免疫信号通路引发下游的防御反应，产生抗菌肽(antimicrobial peptides，AMPs)或者与微生物结合通过吞噬或包被作用直接将其杀死[66]。如柞蚕受到柞蚕微孢子虫侵染时，通过ApGNBP、ApSPZ、ApMyD88和ApCACT等基因表达的上调，激活体内的Toll通路，启动先天免疫系统[67]。而当家蚕受到N. bombycis侵染时，寄主可以通过肽聚糖识别蛋白(peptidoglycan recognition proteins，PGRPs)和革兰氏阴性菌结合蛋白(Gram-negative binding proteins，GNBPs)等PRRs识别微孢子虫，并激活Toll通路和JAK/STAT通路，产生包括gloverins、lebocins和moricins在内的AMPs。Ma等利用芯片技术对感染N. bombycis的家蚕在不同时间段取样进行全基因组表达谱测序。结果发现感染N. bombycis的家蚕幼虫保幼激素合成相关基因表达量上调，而代谢相关的基因下调[65]。保幼激素的积累有助于刺激寄主的免疫系统产生更多的抗菌肽[68]，因此提高保幼激素分泌水平可能是家蚕抵抗微孢子虫侵入的方法之一。但另一方面，保幼激素的产生延长了幼虫的发育周期，增强了寄主的能量代谢，为孢子的增殖提供了充足时间与能量。然而，在另外一些研究中发现，少数微孢子虫在侵染寄主后会造成其抗菌肽表达量的下调，例如，蜜蜂被东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae侵染时抗菌肽基因下调，寄主的免疫反应受到抑制[69]，使得孢子更容易侵入。这种相反的作用效果可能与微孢子虫及其寄主种属密切相关。家蚕还可以通过释放细胞免疫因子如溶菌酶和免疫相关蛋白等抵抗微孢子虫的入侵。针对寄主复杂而强烈的免疫反应，家蚕微孢子虫能够诱导几种细胞免疫因子，如参与孢子识别和免疫信号转导的CTL11上调、分泌丝氨酸蛋白酶抑制剂抑制家蚕血淋巴中丝氨酸蛋白酶级联黑化反应等[65]。
基因是遗传信息的携带者，但是蛋白质却是生命活动的执行者，必须要了解其如何行使功能，才能深入探索生命活动的规律。蛋白质组学的发展加快了研究者对孢子虫生命活动的深入了解。微孢子虫的孢壁具有保护孢子抵抗外界环境刺激、参与孢子侵染传播等重要作用，因而吸引了大量研究者的目光。对孢壁蛋白的研究主要包括组分、分子量、抗原性以及黏附与感染的作用机制。黄少康等利用二维凝胶电泳(2D-PAGE)蛋白质组学，比较家蚕微孢子虫和转寄主连续侵染24次的微孢子虫孢壁蛋白，发现有5个差异蛋白可能与侵染变异有关[70]。吴晓霞等利用激光共聚焦显微镜和一维聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)证实了经0.2 mol/L KOH预处理的家蚕微孢子虫能够被粉纹夜蛾Trichoplusia ni培养细胞所吞噬，且孢壁蛋白条带出现了缺失和弱化，推测可能是KOH使孢壁蛋白被分解或构象改变[71]。Li等利用单抗2B10与孢壁蛋白EOB13320免疫共沉淀，发现纯化后的抗原在家蚕微孢子虫的整个生命周期中均被表达，尤其在孢子内壁形成时，表明该蛋白可能对孢子壳的形成和微孢子虫的修复具有重要作用[72]。唐旭东等用二维凝胶电泳技术对家蚕微孢子虫和内网孢虫属Endoreiculatus微孢子虫镇江株的总蛋白进行分离，随后利用质谱鉴定差异蛋白。发现这些差异蛋白的功能主要涉及侵染、能量代谢、孢壁组成和遗传信息加工等方面[73]。高永珍等对家蚕微孢子虫、蓝萤叶甲(鞘翅目叶甲科)微孢子虫、桑尺蠖(鳞翅目尺蛾科)微孢子虫、菜粉蝶(鳞翅目粉蝶科)微孢子虫、丝棉木金星尺蠖(鳞翅目尺蛾科)微孢子虫和从家蚕体内分离出的异型微孢子虫的总蛋白进行一维凝胶电泳和氨基酸组成分析，发现各种孢子总蛋白均含有16种氨基酸，但每种氨基酸的相对含量不同。蓝萤叶甲微孢子虫总蛋白中甘氨酸含量最高，其余微孢子虫谷氨酸含量最高，且谷氨酸、天冬氨酸和赖氨酸约占总蛋白中总氨基酸含量的40%。在分子量约为89 kDa的蛋白条带中，蓝萤叶甲微孢子虫的脯氨酸含量最高，并且出现了其他微孢子虫所没有的组氨酸和牛磺酸[74]。这些结果表明与寄生在鳞翅目昆虫的微孢子虫相比，蓝萤叶甲微孢子虫蛋白质化学性质差异较大，可能与微孢子虫的大小或对不同寄主的侵染力有关。
3 总结和展望 微孢子虫分子生物学研究基础相对薄弱，再加上微孢子虫表面坚厚的孢壁，无疑增加了研究难度。然而，随着测序技术的不断更新发展使得越来越多的微孢子虫基因组被高质量地成功测序，这将大大推动微孢子虫转录组、蛋白质组等后基因组时代的深入研究。
此外，生命体是一个复杂的调控系统，利用单一组学数据分析病原体-寄主相互作用的局限性愈发显著。因此通过对多种层次和来源的高通量组学的整合分析，系统地研究微孢子虫的侵染机制，确定垂直传播的关键因子以及病害流行因素，已经成为昆虫病原微孢子研究的重要发展方向，将为鳞翅目害虫生物防治提供新的思路，并对家蚕等经济昆虫微粒子病的诊断、防控及治疗等提供新的理论依据。
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