黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析

贾会霞¹, 李锡香¹, 宋江萍¹, 林毓娥², 张晓辉¹, 邱杨¹, 阳文龙¹, 娄群峰³, 王海平^1,*()

¹中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081
²广东省农业科学院蔬菜研究所,广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广州510640
³南京农业大学园艺学院,作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京210095

收稿日期:2021-02-22修回日期:2021-04-06出版日期:2021-07-25发布日期:2021-08-10
通讯作者:王海平E-mail:wanghaiping@caas.cn

基金资助:国家“十三五”重点研发计划项目(2016YFD0100204-1);中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(IVF-BRF2021001);农业农村部作物种质资源保护项目;农业农村部作物种质资源安全保存项目;国家园艺种质北京蔬菜分库运行服务项目(NHGRC2021-NH0);国家作物种质资源数据中心观测监测任务项目(ZX01NK-03)

Genome-Wide Association Study of Powdery Mildew Resistance of Cucumber Core Germplasms

JIA Huixia¹, LI Xixiang¹, SONG Jiangping¹, LIN Yu’e², ZHANG Xiaohui¹, QIU Yang¹, YANG Wenlong¹, LOU Qunfeng³, WANG Haiping^1,*()

¹Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Germplasm Creation in the Ministry of Agriculture,Beijing 100081,China
²Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables,Vegetable Research Institute,Guangdong Academy of Agricultural Sciences,Guangzhou 510640,China
³State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement,College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China

Received:2021-02-22Revised:2021-04-06Online:2021-07-25Published:2021-08-10
Contact:WANG Haiping E-mail:wanghaiping@caas.cn

摘要/Abstract

摘要： 以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950 382个SNPs进行全基因组关联分析。结果表明,黄瓜白粉病在广州地区的自然发病率显著高于北京地区,不同种质在两年病情指数（DI）之间存在较高的相关性;基于混合线性模型,共检测到12个显著关联信号,分布于1号、5号和6号染色体上,其中,pm1.1在北京的两年中被重复检测到,pm5.7在广州的两年中被重复检测到;显著关联信号中共有68个超过阈值[-log₁₀(P value) = 6.0]的SNP,包含1个外显子区非同义突变SNP（Chr5：16 676 542）,位于编码异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体蛋白基因XPR（Csa5G471600）上;在与白粉病抗性相关联SNP的LD区段内共检测到63个候选基因,其中7个候选基因的表达量在高抗材料接种白粉病前后出现显著差异。
中图分类号:
S642.2

引用本文

贾会霞, 李锡香, 宋江萍, 林毓娥, 张晓辉, 邱杨, 阳文龙, 娄群峰, 王海平. 黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1371-1385.
JIA Huixia, LI Xixiang, SONG Jiangping, LIN Yu’e, ZHANG Xiaohui, QIU Yang, YANG Wenlong, LOU Qunfeng, WANG Haiping. Genome-Wide Association Study of Powdery Mildew Resistance of Cucumber Core Germplasms[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(7): 1371-1385.





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