龙眼DRB家族全基因组鉴定及其表达分析

蔡柔荻, 厉雪, 陈燕, 徐小萍, 陈晓慧, 赖钟雄^*(), 林玉玲^*()

福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州 350002

收稿日期:2020-12-23修回日期:2021-03-22出版日期:2021-05-25发布日期:2021-06-07
通讯作者:赖钟雄,林玉玲E-mail:Laizx01@163.com;buliang84@163.com

基金资助:国家自然科学基金项目(31672127);福建省高原学科建设经费项目(102/71201801101);福建省自然科学基金项目(2020J01543);福建农林大学创新基金项目(CXZX2018078);福建农林大学创新基金项目(CXZX2018076);福建农林大学创新基金项目(CXZX2019033S)

Genome-wide Identification and Expression Analysis of DRB Gene Family in Dimocarpus longan

CAI Roudi, LI Xue, CHEN Yan, XU Xiaoping, CHEN Xiaohui, LAI Zhongxiong^*(), LIN Yuling^*()

Institute of Horticultural Biotechnology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China

Received:2020-12-23Revised:2021-03-22Online:2021-05-25Published:2021-06-07
Contact:LAI Zhongxiong,LIN Yuling E-mail:Laizx01@163.com;buliang84@163.com

摘要/Abstract

摘要： 为了解龙眼中双链RNA结合蛋白家族(DRB)的潜在功能,采用生物信息学方法鉴定龙眼DRB基因家族成员,并分析其在龙眼体胚发生早期、不同组织部位和外源脱落酸、水杨酸、茉莉酸甲酯处理下的表达模式。结果显示:龙眼DRB家族的8个成员分布在5个亚组中,并且都具有2 ~ 3个双链RNA结合结构域,内含子数1 ~ 7;龙眼DRB家族含有6种motif;启动子中含有大量光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件;龙眼DRB家族成员在体胚发生的各个阶段、各器官中均有表达,但表达量差异较大;外源脱落酸、水杨酸及茉莉酸甲酯处理显著抑制龙眼DRB家族成员的表达。本研究结果表明,龙眼DRB家族成员高度保守,该家族成员可能参与龙眼体胚及各器官各阶段的生长发育过程,且参与脱落酸、水杨酸及茉莉酸甲酯响应过程。
中图分类号:
S667.2

引用本文

蔡柔荻, 厉雪, 陈燕, 徐小萍, 陈晓慧, 赖钟雄, 林玉玲. 龙眼DRB家族全基因组鉴定及其表达分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 921-933.
CAI Roudi, LI Xue, CHEN Yan, XU Xiaoping, CHEN Xiaohui, LAI Zhongxiong, LIN Yuling. Genome-wide Identification and Expression Analysis of DRB Gene Family in Dimocarpus longan[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(5): 921-933.





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