辣椒PEBP基因家族的全基因组鉴定、比较进化与组织表达分析
牛西强1, 罗潇云1, 康凯程2, 黄先忠1,2,*(
), 胡能兵1, 隋益虎1, 艾昊1 1安徽科技学院农学院,安徽凤阳 233100
2石河子大学生命科学学院,植物基因组学实验室,新疆石河子 832003
收稿日期:2020-12-07修回日期:2021-03-21出版日期:2021-05-25发布日期:2021-06-07通讯作者:黄先忠E-mail:huangxz@ahstu.edu.cn基金资助:国家自然科学基金项目(31860393);安徽省科技攻关面上项目(1704g07020111);安徽科技学院学科带头人引进人才启动经费项目(NXYJ202001);安徽省大学生创新创业训练计划项目(S202010879303)Genome-wide Identification,Comparative Evolution and Expression Analysis of PEBP Gene Family from Capsicum annuum
NIU Xiqaing1, LUO Xiaoyun1, KANG Kaicheng2, HUANG Xianzhong1,2,*(), HU Nengbing1, SUI Yihu1, AI Hao1 1College of Agriculture,Anhui Science and Technology University,Fengyang,Anhui 233100,China
2Plant Genomics Laboratory,College of Life Sciences,Shihezi University,Shihezi,Xinjiang 832003,China
Received:2020-12-07Revised:2021-03-21Online:2021-05-25Published:2021-06-07Contact:HUANG Xianzhong E-mail:huangxz@ahstu.edu.cn摘要/Abstract
摘要： 植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(Phosphatidyl ethanolamine-binding protein,PEBP)分为MFT、FT和TFL1共3个亚家族,其中FT和TFL1亚家族蛋白构成了植物的成花激素—抗成花激素系统,调控开花时间和株形结构。基于辣椒(Capsicum annuum)全基因组数据,对辣椒PEBP基因家族进行鉴定,并对基因和蛋白结构、比较进化、共线性和组织表达特征等进行了分析。结果表明,辣椒基因组包含9个PEBP成员,并且9个基因均含有4个外显子和3个内含子,定位在6条染色体上,其编码蛋白质定位在细胞质和细胞核中。与番茄PEBP同源基因的比较进化分析表明,辣椒的PEBP基因受纯化选择,其中CaFT2和CaFT4在进化中较稳定,辣椒和番茄之间存在8对共线性基因。qRT-PCR分析表明CaPEBP基因在所检测的组织中明显差异表达,如CaMFT/CaTFL1-1在果实中高表达,CaFT1在叶片中相对表达量最高,CaFT3在顶端分生组织和花中表达量最高,CaTFL1-4在根中特异表达。
中图分类号:
S641.3
引用本文
牛西强, 罗潇云, 康凯程, 黄先忠, 胡能兵, 隋益虎, 艾昊. 辣椒PEBP基因家族的全基因组鉴定、比较进化与组织表达分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 947-959.
NIU Xiqaing, LUO Xiaoyun, KANG Kaicheng, HUANG Xianzhong, HU Nengbing, SUI Yihu, AI Hao. Genome-wide Identification,Comparative Evolution and Expression Analysis of PEBP Gene Family from Capsicum annuum[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(5): 947-959.
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