梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析
韩文龙1, 朱振1, 李君茹1, 陈天哲1, 李国辉1, 苏雪强1, 金青1,2, 程曦1,2, 蔡永萍1,2,*()1安徽农业大学生命科学学院,合肥 230036
2地方特色植物资源开发与利用安徽省工程技术中心,合肥 230036
收稿日期:
2020-09-28出版日期:
2021-03-25发布日期:
2021-04-02通讯作者:
蔡永萍E-mail:swkx12@ahau.edu.cn基金资助:
安徽省自然科学基金项目(2008085QC100);安徽农业大学青年基金项目(2019zd01);安徽农业大学稳定和引进人才项目(yj2019-17);安徽省级大学生创新基金项目(201910364156)Indentification and Expression Analysis of Trihelix Transcription Factor Family in Pear
HAN Wenlong1, ZHU Zhen1, LI Junru1, CHEN Tianzhe1, LI Guohui1, SU Xueqiang1, JIN Qin1,2, CHENG Xi1,2, CAI Yongping1,2,*()1School of Life Science,Anhui Agricultural University,Hefei 230036,China
2Anhui Provincial Engineering Technology Center for Development & Utilization of Regional Characteristic Plants,Hefei 230036,China
Received:
2020-09-28Online:
2021-03-25Published:
2021-04-02Contact:
CAI Yongping E-mail:swkx12@ahau.edu.cn摘要/Abstract
摘要: Trihelix转录因子可以和光应答相关的GT元件结合,因此又称GT转录因子。本研究从梨基因组中鉴定出16个Trihelix家族基因,依次命名为PbGT1 ~ PbGT16,从同属于蔷薇科的草莓和桃基因组中分别鉴定出11和16个Trihelix家族基因。染色体定位与基因复制事件分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分别分布在12、6和8条染色体上,且梨Trihelix家族存在片段复制事件。种间系统进化树分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分为6个亚族,梨家族成员(PbGT)属于GT-2、Subfamily O和SIP1亚族。结合进化关系及qRT-PCR验证,筛选出PbGT15可能参与调控梨果实石细胞团木质化。
中图分类号:
S661.2
引用本文
韩文龙, 朱振, 李君茹, 陈天哲, 李国辉, 苏雪强, 金青, 程曦, 蔡永萍. 梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(3): 439-455.
HAN Wenlong, ZHU Zhen, LI Junru, CHEN Tianzhe, LI Guohui, SU Xueqiang, JIN Qin, CHENG Xi, CAI Yongping. Indentification and Expression Analysis of Trihelix Transcription Factor Family in Pear[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(3): 439-455.
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