利用SSRseq分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究
赵青, 都真真, 李锡香, 宋江萍, 张晓辉, 阳文龙, 贾会霞, 王海平*(
) 中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业农村部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京 100081
收稿日期:2021-02-23修回日期:2021-04-07出版日期:2021-07-25发布日期:2021-08-10通讯作者:王海平E-mail:wanghaiping@caas.cn基金资助:国家自然科学基金项目(31872946);国家重点研发计划项目(2016YFD0100204);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-24-A-01);中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2017-IVFCAAS);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(IVF-BRF2018001);农业农村部作物种质资源保护项目;农业农村部作物种质资源安全保存项目;国家园艺种质北京蔬菜分库运行服务项目(NHGRC2021-NH01);国家作物种质资源数据中心观测监测任务项目(ZX01NK-03)Genetic Diversity of Garlic Germplasm Resources Based on SSRseq Molecular Markers
ZHAO Qing, DU Zhenzhen, LI Xixiang, SONG Jiangping, ZHANG Xiaohui, YANG Wenlong, JIA Huixia, WANG Haiping*() Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Germplasm Creation in the Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Beijing 100081,China
Received:2021-02-23Revised:2021-04-07Online:2021-07-25Published:2021-08-10Contact:WANG Haiping E-mail:wanghaiping@caas.cn摘要/Abstract
摘要： 利用筛选出的24对SSRseq引物对来自世界各地的676份大蒜种质进行遗传多样性、主坐标和群体遗传结构分析。结果表明：24对SSRseq标记在676份种质中共检测到124个多态性位点,平均等位位点数为5.17个,Nei’s多样性指数平均为1.77,Shannon’s 信息指数平均为0.62,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.33和0.34。用邻近法将676份资源划分为4类,其中第Ⅰ类包括以来源于亚洲中高纬度为主的186份种质,第Ⅱ类包括以来源于欧洲、中亚和北美洲为主的205份种质,第Ⅲ类包括以亚洲半抽薹类型的资源为主的132份种质,第Ⅳ类包括以来源于亚洲低纬度为主的153份种质。主坐标分析表明,亚洲低纬度地区的种质聚集在第Ⅰ类与第Ⅲ类,亚洲中高纬地区、欧洲、北美洲地区的种质聚集在第Ⅱ类。群体遗传结构分析将种质资源划分为4类,与邻近法聚类分析相似,以来自欧洲、中亚、北美洲为主的种质资源群体基因多样性和Shannon’s多样性信息指数最大,分别为0.3213与0.5933。用邻近法聚类分析与群体遗传结构分析均将382份中国资源划分为4类,分别以华北、华南、蒙新、西南地区种质为主。主坐标分析表明,中国华北、华南地区的种质分布在PC1的两端,表现出较远的亲缘关系。研究结果将为后期大蒜资源的深入评价和品种选育提供重要参考。
中图分类号:
S633.4
引用本文
赵青, 都真真, 李锡香, 宋江萍, 张晓辉, 阳文龙, 贾会霞, 王海平. 利用SSRseq分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1397-1408.
ZHAO Qing, DU Zhenzhen, LI Xixiang, SONG Jiangping, ZHANG Xiaohui, YANG Wenlong, JIA Huixia, WANG Haiping. Genetic Diversity of Garlic Germplasm Resources Based on SSRseq Molecular Markers[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(7): 1397-1408.
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