栗杂交F1代SSR标记遗传多样性分析
江锡兵1, 章平生1, 徐阳1, 吴聪连2, 张东北2, 龚榜初1,*(), 吴开云1, 赖俊声21中国林业科学研究院亚热带林业研究所,杭州 311400
2庆元县自然资源和规划局,浙江丽水 323800
收稿日期:
2020-09-03修回日期:
2020-11-17出版日期:
2021-05-25发布日期:
2021-06-07通讯作者:
龚榜初E-mail:gongbc@126.com基金资助:
浙江省农业(林木)新品种选育重大科技专项(2016C02056-6);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金重点项目(CAFYBB2017ZA004-6)Genetic Diversity of F1 Hybrids of Chestnut Based on SSR Markers
JIANG Xibing1, ZHANG Pingsheng1, XU Yang1, WU Conglian2, ZHANG Dongbei2, GONG Bangchu1,*(), WU Kaiyun1, LAI Junsheng21Research Institute of Subtropical Forestry,Chinese Academy of Forestry,Hangzhou 311400,China
2Qingyuan Bureau of Natural Resources and Planning,Lishui,Zhejiang 323800,China
Received:
2020-09-03Revised:
2020-11-17Online:
2021-05-25Published:
2021-06-07Contact:
GONG Bangchu E-mail:gongbc@126.com摘要/Abstract
摘要: 为深入了解栗属植物种内、种间杂交F1代群体遗传多样性和变异规律,以及不同亲本遗传效应和配置方式对杂交F1代的影响,以锥栗种内、锥栗和板栗种间9个杂交组合235份F1代单株及其亲本为材料,利用32对高多态性栗属SSR标记对其基因组DNA进行PCR扩增和毛细管电泳,统计数据并进行遗传参数、分子方差、UPGMA聚类和PCA分析。结果表明:32对SSR引物在235个子代中共扩增出278个多态性位点,平均观测等位基因数8.69个,Shannon’s多样性指数(I)、基因遗传多样性(Hs)和基因流(Nm)平均值分别为1.3707、0.6574和1.5951,遗传分化系数(Fst)显示杂交F1代85.18%的变异存在于组合内;不同组合Shannon’s 多样性指数范围为0.8816 ~ 1.1317,显示其子代均存在丰富的遗传多样性,且子代遗传多样性水平受不同父、母本遗传效应以及亲本配置影响;分子方差分析表明栗杂交F1代群体遗传变异主要来源于组合内(78.06%),与遗传分化系数结果较为一致;不同杂交组合遗传距离和UPGMA聚类显示,具有相同亲本的正反交组合C3和C5遗传距离最近,最先聚到一起,其次是具有相同母本或相同父本的组合,分别聚到一起;杂交子代PCA散点图进一步验证了杂交组合聚类分析结果,同一组合内或遗传距离较近的组合多数子代能聚到一起,同时,不同组合子代又存在交叉重叠现象,说明存在较为广泛的基因交流,且子代分离现象明显。
中图分类号:
S664.2
引用本文
江锡兵, 章平生, 徐阳, 吴聪连, 张东北, 龚榜初, 吴开云, 赖俊声. 栗杂交F1代SSR标记遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 897-907.
JIANG Xibing, ZHANG Pingsheng, XU Yang, WU Conglian, ZHANG Dongbei, GONG Bangchu, WU Kaiyun, LAI Junsheng. Genetic Diversity of F1 Hybrids of Chestnut Based on SSR Markers[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(5): 897-907.
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