枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析

李继东*，倪 静*，叶 霞，陈 鹏，谭 彬，张梦洋，郑先波，张 玉，冯建灿**

河南农业大学，河南省果树瓜类生物学重点实验室，郑州 450002

出版日期:2020-08-25发布日期:2020-08-25


基金资助:河南省重大科技专项（151100110900）；河南省现代农业产业体系大宗水果产业技术创新团队项目（S2014-11-G02）

Genomic Identification of Jujube AP2/ERF Transcription Factors and Their Expression Pattern During Jujube Witches’ Broom Pathogenesis Process

LI Jidong*，NI Jing*，YE Xia，CHEN Peng，TAN Bin，ZHANG Mengyang，ZHENG Xianbo，ZHANG Yu，and FENG Jiancan**

Henan Agricultural University，Henan Key Laboratory of Fruit and Cucurbit Biology，Zhengzhou 450002，China

Online:2020-08-25Published:2020-08-25

摘要/Abstract

摘要： 利用生物信息学方法，从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列，使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列，采用SMART软件预测蛋白结构域发现，枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因，其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个，另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111 ~ 692之间，分子量在12 446.87 ~ 76 154.10之间，pI在4.31 ~ 10.11之间。鉴定出的145个AP2/ERF转录因子，105个分别定位到12条染色体上，40个未能定位。在此基础上，利用嫁接病芽方法将枣疯病植原体转至健康枣植株，通过转录组测序和qRT-PCR手段，分析了AP2/ERF转录因子对枣植原体侵染的响应，在植原体侵染枣的6个不同时期，枣AP2/ERF表达数量和表达量均不相同，共有48个差异表达基因，其中ZjAP2*9、ZjERF49和ZjERF91是响应枣疯病植原体最为重要的AP2/ERF转录因子。
中图分类号:
S 665.1

引用本文

李继东*，倪 静*，叶 霞，陈 鹏，谭 彬，张梦洋，郑先波，张 玉，冯建灿**. 枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(8): 1463-1474.
LI Jidong*，NI Jing*，YE Xia，CHEN Peng，TAN Bin，ZHANG Mengyang，ZHENG Xianbo，ZHANG Yu，and FENG Jiancan**. Genomic Identification of Jujube AP2/ERF Transcription Factors and Their Expression Pattern During Jujube Witches’ Broom Pathogenesis Process[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(8): 1463-1474.





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