葡萄LIM家族基因特征及表达模式分析
毛 娟，卢世雄，王 萍，马宗桓，刘 涛，何红红，乃国洁，张志强，陈佰鸿*甘肃农业大学园艺学院，兰州 730070
出版日期:2020-07-25发布日期:2020-07-25基金资助:甘肃农业大学青年导师基金项目（GAU-QDFC-2019-05）；甘肃省陇原创新团队项目（LQ20180918-1）；甘肃省葡萄酒产业发展专项；甘肃省科技重大专项（18ZD2NA006）Analysis of Gene Characteristic and Expression Pattern of LIM Family in Grape
MAO Juan，LU Shixiong，WANG Ping，MA Zonghuan，LIU Tao，HE Honghong，NAI Guojie，ZHANG Zhiqiang，and CHEN Baihong*College of Horticulture，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China
Online:2020-07-25Published:2020-07-25摘要/Abstract
摘要： 为了明确LIM家族基因在葡萄非生物胁迫下的表达特性，在生物信息分析的基础上，以‘黑比诺’葡萄（Vitis vinifera‘Pinot Noir’）试管苗为试验材料，利用qRT-PCR技术检测了不同逆境处理对葡萄LIM家族基因成员表达的影响。结果显示，葡萄LIM基因家族有14个成员，可分为4个亚族，各亚族编码蛋白氨基酸数量差异较大，但亚族内差异较小；分析葡萄基因和拟南芥基因间的选择压发现，二者存在钝化选择关系；多序列比对发现，该家族基因成员含有1或2个锌指结构的保守结构域；保守基序分析结果表明，所有基因均包含motif2；基因结构显示VvLIM含有4 ~ 15个外显子；14个基因中有11个编码蛋白存在互作关系。该家族基因存在大量的光诱导元件和水杨酸等逆境胁迫相关元件。基因芯片表达数据表明，高表达的基因主要存在生长旺盛的组织中。qRT-PCR分析发现，VvLIM1在100 mmol ? L-1 NaCl、10% PEG和50 mg ? L-1 SA胁迫下表达量与对照相比显著上调，且随处理时间的延长表达量显著增加。
中图分类号:
S 663.1
引用本文
毛 娟，卢世雄，王 萍，马宗桓，刘 涛，何红红，乃国洁，张志强，陈佰鸿*. 葡萄LIM家族基因特征及表达模式分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(7): 1277-1288.
MAO Juan，LU Shixiong，WANG Ping，MA Zonghuan，LIU Tao，HE Honghong，NAI Guojie，ZHANG Zhiqiang，and CHEN Baihong*. Analysis of Gene Characteristic and Expression Pattern of LIM Family in Grape[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(7): 1277-1288.
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