哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析
赵艳青1，杜建厂2，王盼乔1，秦晓东1，陈劲枫1,*1南京农业大学园艺学院，南京 210095；2江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所，南京 210014
出版日期:2019-07-25发布日期:2019-07-25基金资助:国家自然科学基金重点项目（3140075）；国家重点研发计划项目（2016YFD0100203-25）；江苏省重大品种创制项目（PZCZ201719）Identification and Expression Analysis of NAC Transcription Factor Gene Family Under Low Temperature in Cucumis sativus var. hardwickii
ZHAO Yanqing1，DU Jianchang2，WANG Panqiao1，QIN Xiaodong1，and CHEN Jinfeng1,*1College of Horticulture，Nanjing Agricultural University，Nanjing 210095，China；2Institute of Crop Germplasm and Biotechnology，Jiangsu Academy of Agricultural Science，Nanjing 210014，China
Online:2019-07-25Published:2019-07-25摘要/Abstract
摘要： 以哈氏黄瓜（Cucumis sativus var. hardwickii）为试验材料，基于全基因组测序结果，利用生物信息学分析方法，鉴定获得77个NAC转录因子，其结构高度保守，序列长度在151 ~ 653个氨基酸之间，在7条染色体中呈非均匀分布；理论等电点在4.54 ~ 9.10之间；大部分转录因子定位在细胞核和细胞质膜上；系统发生分析显示所有NAC转录因子聚类为6个亚家族，其中亚家族Ⅲ序列结构较为多样性；进化分析发现NAC转录因子存在片段重复和串联重复等复制模式，没有发生近代的全基因组复制事件，并在进化过程中受到纯化选择作用；NAC转录因子基因在哈氏黄瓜幼苗根中表达量最高，其次为雌花和叶片；荧光定量分析发现，低温处理下，检测的15个NAC基因中有12个显著上调表达，3个下调表达，并存在一组表达量差异明显的HdNAC32–HdANC47片段复制基因对。由此可知NAC转录因子在受低温胁迫的哈氏黄瓜中发挥重要的转录调控作用。
中图分类号:
S 642.2
引用本文
赵艳青1，杜建厂2，王盼乔1，秦晓东1，陈劲枫1,*. 哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(7): 1303-1319.
ZHAO Yanqing1，DU Jianchang2，WANG Panqiao1，QIN Xiaodong1，and CHEN Jinfeng1,*. Identification and Expression Analysis of NAC Transcription Factor Gene Family Under Low Temperature in Cucumis sativus var. hardwickii[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(7): 1303-1319.
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