苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析
王楚堃1,韩朋良1,王咏梅2,王鹏飞2,*,胡大刚1,*1山东农业大学园艺科学与工程学院,作物生物学国家重点实验室,农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,山东泰安 271018;2山东省葡萄研究院,济南 250100
出版日期:
2019-06-25发布日期:
2019-06-25基金资助:
国家自然科学基金项目(31601728);山东省自然科学基金项目(ZR2016CQ13);山东农业大学****基金项目(564024,24024)Genome-wide Identification and Analysis of Apple WUSCHEL-related homeobox(WOX)Family Genes
WANG Chukun1,HAN Pengliang1,WANG Yongmei2,WANG Pengfei2,*,and HU Dagang1,*1State Key Laboratory of Crop Biology,Ministry of Agriculture Key Laboratory of Horticultural Crop Biology (Huanghuai Region)and Germplasm Innovation,College of Horticulture Science and Engineering,Shandong Agricultural University,Tai’an,Shandong 271018,China;2Shandong Academy of Grape,Jinan 250100,China
Online:
2019-06-25Published:
2019-06-25摘要/Abstract
摘要: 利用生物信息学方法和苹果基因组数据库,鉴定并分析了12个苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因。系统进化树分析表明,苹果WOX家族和拟南芥WOX家族可被分为现代分支(WUS分支)、中间分支和祖先分支;苹果WOX家族成员均含有1个motif-1,不同分支的成员含有其分支特异的motif;基因结构分析显示,苹果WOX家族基因含有2 ~ 4个外显子,染色体定位发现11个基因分别定位在苹果的7条染色体上,1个基因无准确定位。基因表达模式分析表明,12个基因在苹果各组织中均有表达,且在果实中的表达量较高;密码子偏好性分析显示,苹果WOX家族基因的偏好性较弱。
中图分类号:
S 661.1
引用本文
王楚堃1,韩朋良1,王咏梅2,王鹏飞2,*,胡大刚1,*. 苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(6): 1021-1032.
WANG Chukun1,HAN Pengliang1,WANG Yongmei2,WANG Pengfei2,*,and HU Dagang1,*. Genome-wide Identification and Analysis of Apple WUSCHEL-related homeobox(WOX)Family Genes[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(6): 1021-1032.
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