利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因
刘梦雨，刘小丰，江 东，朱世平，申晚霞，余 歆，薛 杨，赵晓春*西南大学柑桔研究所，中国农业科学院柑桔研究所，国家柑桔工程技术研究中心，重庆 400712
出版日期:2019-05-25发布日期:2019-05-25基金资助:国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-27）；重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目；西南大学双一流学科建设项目Identification of Genes Related to Oil Gland Development in Kumquat by Using BSA-Seq
LIU Mengyu，LIU Xiaofeng，JIANG Dong，ZHU Shiping，SHEN Wanxia，YU Xin，XUE Yang，and ZHAO Xiaochun*Citrus Research Institute，Southwest University，Chinese Academy of Agricultural Sciences，National Citrus Engineering Research Center，Chongqing 400712，China
Online:2019-05-25Published:2019-05-25摘要/Abstract
摘要： 为了鉴定与金柑油胞发育相关的基因，用多油胞的罗纹金柑[Fortunella japonica（Thunb.）Swingle，母本]和少油胞的滑皮金柑（Fortunella crassifolia Swingle‘Huapi’，父本）进行杂交构建了F1代分离群体，从159个F1代单株中挑选出高油胞密度和低油胞密度的单株各30株，分别构建两个极端性状的DNA混池用于基因组重测序。利用重测序数据结合混合分组分析法（Bulked Segregant Analysis，BSA）进行遗传关联性分析，将控制油胞数量性状的位点定位在第9条染色体的25 980 001 ~ 29 160 001 bp的区域内。该区域包含511个有效的SNP，分布在301个基因位点上。同源性功能分析后获得11个与细胞程序性死亡、细胞壁功能和结构及细胞伸长和膨大等生理过程相关的候选基因（Ciclev10005243m.g、Ciclev10005288m.g、Ciclev10005338m.g、Ciclev10005441m.g、Ciclev10006448m.g、Ciclev10005804m.g、Ciclev10004719m.g、Ciclev10005888m.g、Ciclev10006502m.g、Ciclev10005197m.g和Ciclev10004431m.g），这些基因可能在柑橘油胞的发育过程中起重要作用。
中图分类号:
S 666
引用本文
刘梦雨，刘小丰，江 东，朱世平，申晚霞，余 歆，薛 杨，赵晓春*. 利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因[J]. 园艺学报, 2019, 46(5): 841-854.
LIU Mengyu，LIU Xiaofeng，JIANG Dong，ZHU Shiping，SHEN Wanxia，YU Xin，XUE Yang，and ZHAO Xiaochun*. Identification of Genes Related to Oil Gland Development in Kumquat by Using BSA-Seq[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(5): 841-854.
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