柑橘4CL基因家族的结构及其功能分析
申晚霞,王志彬,薛 杨,赵婉彤,朱世平,赵晓春*中国农业科学院/西南大学柑桔研究所,国家柑桔工程技术研究中心,重庆 400712
出版日期:
2019-06-25发布日期:
2019-06-25基金资助:
中央高校基本业务费项目(XDJK2016C143);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26);重庆市社会事业与民生保障科技创新专项项目(cstc2016shms-ztzx80002,cstc2016shms-ztzx80004);重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目;国家重点研发计划项目(2018YFD1000101);西南大学双一流学科建设项目Characterization of 4-coumarate:CoA Ligase(4CL)Gene Family in Citrus
SHEN Wanxia,WANG Zhibin,XUE Yang,ZHAO Wantong,ZHU Shiping,and ZHAO Xiaochun*Citrus Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Southwest University,National Citrus Engineering Research Center,Chongqing 400712,China
Online:
2019-06-25Published:
2019-06-25摘要/Abstract
摘要: 植物中编码类黄酮和木质素生物合成关键酶,4–香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)的基因通常是家族基因。通过生物信息分析,从克里曼丁橘(Citrus clementina)基因组数据库中筛选出若干条拟为4CL基因的序列。通过对其蛋白结构进行分析,发现其中仅有3个基因具有典型的4CL家族基因的特性。聚类分析结果表明柑橘Cit4CL1聚到ClassⅠ,Cit4CL2和Cit4CL3聚到ClassⅡ。利用荧光定量PCR(qPCR)对北京柠檬不同组织和发育过程中的果实Cit4CL的表达进行分析,发现各成员的表达存在明显的差异,其中Cit4CL1的表达水平与类黄酮含量呈显著正相关,说明该基因对调控柑橘类黄酮的生物合成具有重要作用。Cit4CL2和CitCL3的表达与类黄酮的含量相关性不显著,但其表达的组织特异性和木质素生物合成较为活跃的组织明显相关,表明这两个基因是与木质素生物合成相关的基因。
中图分类号:
S 666
引用本文
申晚霞,王志彬,薛 杨,赵婉彤,朱世平,赵晓春*. 柑橘4CL基因家族的结构及其功能分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(6): 1068-1078.
SHEN Wanxia,WANG Zhibin,XUE Yang,ZHAO Wantong,ZHU Shiping,and ZHAO Xiaochun*. Characterization of 4-coumarate:CoA Ligase(4CL)Gene Family in Citrus[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(6): 1068-1078.
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