黄瓜SAUR基因家族的鉴定与表达分析

王红飞，尚庆茂*

中国农业科学院蔬菜花卉研究所，农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100081

出版日期:2019-06-25发布日期:2019-06-25


基金资助:国家自然科学基金项目（31172001）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-25）；公益性行业（农业）科研专项（201303014）；中国农业科学院科技创新工程项目（CAAS-ASTIP IVFCAAS）

Genome-wide Identification and Expression Analysis of the SAUR Gene Family in Cucumis sativus

WANG Hongfei and SHANG Qingmao*

Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops，Ministry of Agriculture，Beijing 100081，China

Online:2019-06-25Published:2019-06-25

摘要/Abstract

摘要： SAUR（Small auxin-up RNA）是生长素早期响应基因。基于黄瓜（Cucumis sativus L.）基因组数据，对CsaSAUR进行鉴定以及染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件分析，并通过qRT-PCR技术检测基因组织表达模式和对弱光、高温及高水势的响应。结果表明，在黄瓜基因组中共鉴定到73个SAUR，这些基因非随机地分布在7条染色体上，60%成簇分布；系统进化分析显示，CsaSAURs可分为8个进化群，各群基因数量不等；进一步分析家族成员的启动子序列，鉴定到IAA、ABA、GA、JA、SA及干旱、低温和机械损伤等信号响应的顺式作用元件；该家族成员具有不同的表达模式，弱光、高温和高水势可激活或抑制部分家族成员的表达，在下胚轴特异表达的18个CsaSAUR基因中，仅CsaSAUR15同时受弱光、高温、高水势3种信号诱导，表达上调。
中图分类号:
S 642.2

引用本文

王红飞，尚庆茂*. 黄瓜SAUR基因家族的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(6): 1093-1111.
WANG Hongfei and SHANG Qingmao*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of the SAUR Gene Family in Cucumis sativus[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(6): 1093-1111.





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