3种色型仿刺参线粒体和核糖体序列片段遗传结构比较研究

郭战胜¹(),王振²,侯旭光¹,张海涛^1,*()

1. 山东大学海洋学院, 山东 威海 264209
2. 滨州市科学技术情报研究所, 山东 滨州 256600

收稿日期:2020-05-19出版日期:2020-11-20发布日期:2020-11-17
通讯作者:张海涛E-mail:guomarine@163.com;zhanghaitao201208@163.com
作者简介:郭战胜(1987—)，男，博士研究生，研究方向为海洋经济动物遗传育种. E-mail:guomarine@163.com
基金资助:威海市“十三五”海洋经济创新发展示范城市项目

Comparative study on genetic structure of three color variants of the sea cucumber (Apostichopus japonicus) based on mitochondrial and ribosomal genes

Zhan-sheng GUO¹(),Zhen WANG²,Xu-guang HOU¹,Hai-tao ZHANG^1,*()

1. Marine College, Shandong University, Weihai 264209, Shandong, China
2. Binzhou Institute of Scientific and Technical Information, Binzhou 256600, Shandong, China

Received:2020-05-19Online:2020-11-20Published:2020-11-17
Contact:Hai-tao ZHANG E-mail:guomarine@163.com;zhanghaitao201208@163.com

Supported by:威海市“十三五”海洋经济创新发展示范城市项目

摘要/Abstract

摘要： 仿刺参作为我国重要的海水养殖物种,良种选育是目前研究的重点,其中体色是重要的考虑因素之一。为了比较3种不同体色仿刺参的遗传结构,采用PCR扩增与测序技术对我国3种体色(青色、白色和紫色)仿刺参线粒体16S rRNA和COⅠ与核糖体18S rRNA-ITS-28S rRNA序列片段进行分析,揭示其遗传结构差异及系统发育关系。结果表明, 16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列长度分别为812~830 bp、877~915 bp、1 536~1 572 bp。16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列在青色、紫色和白色仿刺参中分别检测到单倍型个数分别为4/5/5、5/3/4和4/4/3, COⅠ序列多态性位点数目所比例最大, 16S rRNA序列最小。3种色型仿刺参16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列遗传距离数值均比较小,范围分别为0~0.014 7、0~0.021 2和0~0.010 3,没有达到种的分化水平。以紫海胆为外群,基于COⅠ序列构建系统发育树,结果表明白刺参单独聚为一支,但是紫色和青色仿刺参不同个体间相互交叉聚集,无法通过发育树区分。


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