基本信息科学研究教育教学论文专著
基本信息


张治洲 男，1967年生，哈工大化工学院-海洋科学与技术学院教授，博士生导师，哈工大BIO-X海洋生物技术研究中心主任，山东省船舶海洋防污工程技术研究中心主任（筹)。2006教育部新世纪优秀人才。曾任海洋学院院长、上海市及天津市科技咨询专家。本科毕业于中国科技大学分子生物学专业，博士毕业于美国俄亥俄医学院（MCO）生化与分子生物学专业。美国克利夫兰临床医学研究中心（CCF）博士后。高三加入中国共产党。在中科院微生物所工作期间曾任党支部宣传委员；曾任上海交通大学BIOX中心支部书记和BIOX中心主任助理。曾任天津科技大学海河学者特聘教授和天津市科技咨询专家。天津市131第一层次人选. 第九届天津青年科技奖（2006）。天津市河西区十大杰出青年（2006）。中国科协高层次人才在册专家；上海交通大学BIO-X生命科学研究中心兼职教授。首届中国微生物学会海洋微生物专业委员会委员。中国生物工程杂志理事；Interdisciplinary Sciences和Journal of Biomedical Science and Engineering编委；Nanotechnology等国际杂志审稿人。2006教育部新世纪优秀人才计划。主持教育部归国留学人员项目、教育部基础研究重点项目、教育部新世纪优秀人才项目，上海市科委基础研究重大项目、国家自然基金项目、863项目等课题，发表各类学术论文近百篇,包括36篇SCI(至2014年他引约700次)，25篇EI, 影响因子3--11 有8篇，H因子为10，参编著作3部；申请发明专利29项(其中国际专利2项)，已授权15项，实际转让10项。在过去10年中实际支配科研经费超过1100万。

以通讯作者身份与合作者在国际上首次报道纳米基因扩增技术和完全由DNA分子组成的通用逻辑门。与合作者从分子实验上实现国内首台DNA计算雏形。在国内外较早倡导利用系统生物学研究手段把配伍西药作为中药现代化的一个核心战略目标，可望对生物制药技术领域和个体化营养健康技术领域逐步产生重要影响。近来又大力发展基因网络技术来研究多基因之间的定性定量关系及相关基因网络操作技术，该技术平台是一个通用的疾病基因发现平台和新药物靶点（或保健因子）发现平台。另已建立一个初步的纳米材料安全定量检测技术平台。近年来带领实验室进军海洋科学与技术研发。主要研究领域为①基因操作新技术研究及其在海洋（生物、环境）工程中的应用/②纳米材料与基因（组）的相互作用研究/③纳米材料的环境安全定量检测技术研究。

荣誉称号
2006教育部新世纪优秀人才计划，天津市131第一层次人选. 第九届天津青年科技奖（2006）. 中国科技大学实验科学奖（1990）。天津市河西区十大杰出青年。中国科协高层次人才在册专家；山东省海外专业人士创新创业成就奖（2011）。

教育经历
1985.9----1990.7 中国科技大学生物系，合肥，分子生物学学士

1994.9----1999.12 美国俄亥俄医学院生物化学与分子生物学系博士

2000.1----2000.7 美国俄亥俄医学院生物化学与分子生物学系博士后

2000.8----2001.12 美国克立夫兰临床医学研究中心细胞生物学系博士后

主要任职
哈工大BIO-X海洋生物技术研究中心主任，山东省船舶海洋防污工程技术研究中心主任（筹)。

工作经历
时间工作经历
2009-至今哈工大化工学院-海洋学院BIO-X海洋生物技术研究中心,教授，博导，学科带头人。个体化营养与海洋食品安全研究室。纳米生物技术。
2005--2009天津泰达BIO-X系统生物技术研究中心,特聘教授，学科带头人. 组织多学科交叉(纳米材料化学生物学等)开展基因操作新技术研究. 营养基因组学与功能食品研究所创始人。
2002--2005(基因组学，蛋白组学和功能生物信息学)上海交通大学生命科学技术学院BIO-X生命科学研究中心多学科交叉研究。DNA计算系列研究等多学科交叉研究课题组长，BIO-X生命科学研究中心主任助理。
2000--2001(细胞分子生物学/分子病理的研究) The Cleveland Clinic, Department of Cell Biology, Cleveland, OH, USA. 研究上皮细胞极性建立/维持之机理；肿瘤细胞失去极性的病理。胞内蛋白输运错误所对应的人类疾病。
1994--1999(大范围的基因表达调控研究))美国俄亥俄医学院生物化学与分子生物学系，研究酵母中蛋白复合物Cyc8/Tup1的转录抑制机理。
1990--1994(基因工程技术/蛋白质工程下游技术) 在中国科学院微生物研究所863蛋白质工程实验室完成了一系列工作.
1988--1990(蛋白质纯化和蛋白质工程) 在中国科技大学生物系遗传工程实验室作为项目枯草杆菌碱性蛋白酶的蛋白质工程中后期任务的主要完成者


专利
专利patent



序号

专利名称

发明人

专利(申请)号
1

基于DNA切割过程的双链DNA序列测定的方法【已授权】

张治洲;胡钧;贺林

CN**5.2
2

核酸聚合酶链式反应扩增的优化方法【已授权】

李海阔;黄洁欢;吕军鸿;张晓东;张治洲;胡钧

CN**6.7
3

核酸聚合酶链式反应扩增的优化方法【已授权】

李海阔;黄洁欢;张晓东;胡钧;樊春海;张治洲

CN**0.2
4

Method of optimizing amplification in PCR



Li, Haikuo Huang, Jiehuan
Lv, Junhong Zhang, Xiaodong
Hu, Jun Zhang, Zhizhou
Fan, Chunhai

US**
5

THE OPTIMUM METHOD OF AMPLIFICATION ON POLYMERASE CHAIN REACTION

FAN CHUNBAI; ZHANG ZHIZHOU; HU JUN; ZHANG XIAODONG; LV JUNHONG; HUANG JIEHUAN; LI HAIKUO

EP**
6

用于DNA计算芯片的寡核苷酸序列【已授权】

张晓东，吕鸣，胡钧，贺林，张治洲

ZL **8.X
7

检测含鸟嘌呤的DNA的电化学方法及利用其的防伪认证方法【已授权】

樊春海 张治洲

**7.8
8

与计算机杂合的DNA表面计算用寡核苷酸芯片的制备方法

张晓东，吴凝，潘加奎，张素，胡钧，张治洲

**4.8

CN**
9

基于纳米金属颗粒的长片断核酸聚合酶链式反应扩增的优化方法

张治洲, 汪名春,王群,曹小红

**0.0
10

基于碳纳米管的核酸聚合酶链式反应优化扩增的方法

张治洲, 汪名春

**1.5
11

纳米碳粉提高聚合酶链式反应（PCR）扩增效果的优化方法

张治洲, 汪名春

**2.X
12

基于纳米金属银的核酸聚合酶链式反应扩增的优化方法【已授权】

张治洲, 王群, 汪名春, 胡钧, 曹小红

CN **B
13

一种核酸聚合酶链式反应扩增的方法【已授权】

张治洲，汪名春，刘常金，任远

**3.8
14

基于纳米金属合金的核酸聚合酶链式反应扩增的优化方法【已授权】

张治洲，王群, 汪名春, 曹小红，贺林

**9.8
15

用于DNA计算的芯片复制方法

欧阳振乾，张治州，胡钧，孙洁林

**3.3
16

一种利用限制性内切酶处理DNA模板增进DNA扩增效率的方法

孟良玉，李静，阎大伟，张治洲

**6.4
17

浓缩果汁中耐热耐酸菌的快速纳米PCR检测方法【已授权】

张治洲，沈涔超，刘常金

**0.7
18

利用分子生物学技术定量检测纳米材料生物安全性的方法【已授权】

张治洲，沈涔超，刘清岱，杨文娟，贺林

**1.5
19

有机试剂增强高GC含量DNA片段扩增效率的方法

张治洲，杨霞，刘芳，孟良玉

**6.4
20

利用碳纳米材料提高微生物温度耐受性的方法

刘清岱，安红杰，王金菊，张婷，张治洲

**1.5
21

组合纳米材料优化PCR的方法

张治洲

**1.9
22

一种利用尿苷提高聚合酶链式反应扩增效果的方法

张治洲;郑嘉祺;徐仲;吕志伟;王有志

**1.1
23

一种利用异亮氨酸提高聚合酶链式反应扩增效果的方法

张治洲;赵鹤翔;张会敏;吕志伟;王有志

**2.6
24

一种利用肌苷提高聚合酶链式反应扩增效果的方法

张治洲;赵鑫;张会敏;吕志伟;王有志

**3.0
25

L-甲硫氨酸增进聚合酶链式反应（PCR）扩增效果的方法及用途

张治洲 赵鹤翔 张会敏 王有志 吕志伟

**8.2
26

L-亮氨酸增进聚合酶链式反应（PCR）扩增效果的方法及用途

桑付明 张治洲 赵鹤翔 吕志伟 王有志

**5.9
27

L-缬氨酸增进聚合酶链式反应（PCR）扩增效果的方法及用途

张治洲 赵鹤翔 桑付明 王有志 徐仲

**5.0


科研项目

项目名称可程序自律性DNA计算机的研制

项目来源863

开始时间2003-06-01

结束时间2005-06-01

项目经费112

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称DNA计算机的基础理论与研制基础的研究

项目来源上海市科委

开始时间2003-06-01

结束时间2006-06-01

项目经费800

担任角色参与
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的新方法

项目来源国家自然基金

开始时间2005-06-01

结束时间2008-06-01

项目经费20

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称基因网络操作技术

项目来源教育部新世纪人才

开始时间2006-06-01

结束时间2009-06-01

项目经费50

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称蛋白组学新方法研究

项目来源教育部基础研究重点项目

开始时间2002-06-01

结束时间2006-06-01

项目经费12

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称DNA分子在计算学科中的应用研究

项目来源上海市科委

开始时间2002-06-01

结束时间2004-06-01

项目经费40

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称血液蛋白组学

项目来源教育部归国留学人员

开始时间2002-06-01

结束时间2005-06-01

项目经费3

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称纳米材料用于基因扩增技术研究

项目来源天津科技大学特聘教授基金

开始时间2005-06-01

结束时间2008-06-01

项目经费40

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态完成


项目名称低钠盐和低热量糖对三高人群血液基因表达模式的影响

项目来源企业合作

开始时间2006-06-01

结束时间2007-06-01

项目经费65

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态进行中


项目名称利用生物信息分析和基因网络技术研制创新酵母风味

项目来源企业合作

开始时间2008-06-01

结束时间2009-06-01

项目经费40

担任角色负责
项目类别纵向项目
项目状态进行中


项目名称哈工大BIO-X海洋生物技术研究中心建设启动经费

项目来源哈工大启动经费

开始时间2009-06-01

结束时间2012-06-01

项目经费80

担任角色负责
项目类别横向项目
项目状态完成


项目名称纳米基因扩增技术的研制

项目来源企业合作

开始时间2010-06-01

结束时间2012-06-01

项目经费40

担任角色负责
项目类别横向项目
项目状态进行中


项目名称超长DNA序列体外简易高效扩增技术的研制

项目来源国家自然基金

开始时间2011-06-01

结束时间2013-06-01

项目经费36

担任角色负责
项目类别横向项目
项目状态完成


项目名称古窖泥微生物群落的分子鉴定及动力过程研究

项目来源企业合作

开始时间2012-06-01

结束时间2012-06-01

项目经费30

担任角色负责
项目类别横向项目
项目状态进行中


研究领域
研究方向：

基因网络技术：基因网络技术基础；个体化营养健康长寿的基因网络基础和非药物调节技术研究；

纳米生物技术：纳米材料与基因组的相互作用及其在（海洋）生物技术中的应用；纳米材料的食品安全研究；基于纳米流体系统的基因操作技术；海洋污损早期微生物群落分子过程研究。

功能生物信息学：细胞分子网络与控制；

团队成员
基因网络技术：郭长禄（博士，副教授），王俊沪（博士，副教授），雷振环（博士，副教授）

纳米生物技术：桑付明（博士，讲师），徐仲（副教授）

功能生物信息学：徐永东（博士，副教授）

海洋科学：王媛媛（博士，讲师），马梅荣（副教授）

讲授课程
功能生物信息学, 自编教材,上海交通大学,高年级本科生.2003-2005人类遗传学(章节: 大规模功能基因组学研究方法案例分析, 自编教材). 上海交通大学,硕博生.2004功能生物信息学, 自编教材,天津科技大学,哈尔滨工业大学, 研究生和高年级本科生.2005-至今生物技术专业英语, 自编教材,天津科技大学, 高年级本科生.2006蛋白质组学与系统生物学技术, 自编教材,天津科技大学,研究生,2007-2009Systems Biotechnology. Tianjin University of Science and Technology, foreign PhD Students,2005-2006.蛋白质化学与组学, 自编教材,天津科技大学,研究生,2009系统生物学技术，自编教材,哈尔滨工业大学, 研究生和高年级本科生.2010开始


招生信息
硕士招生:
海洋科学

生物学


博士招生:
化学工程与技术

论文期刊

论文标题Construction of Molecular Logic Gates with a DNA-Cleaving Deoxyribozyme

作者Xi Chen,Yifei Wang, Zhizhou Zhang*, Chunhai, Fan* and Lin He*

期刊名称Angew. Chem. Int. Ed

期卷Vol.118( 1



论文标题Nanoparticle PCR: Nanogold-assisted PCR with enhanced specificity

作者Haikuo Li, Jiehuan Huang, Xiaodong Zhang, Zhizhou Zhang*, Chunhai Fan* and Jun Hu*

期刊名称Angew. Chem. Int. Ed

期卷44(32):510



论文标题Development of nano-scale DNA computing devices

作者Zhizhou Zhang* ，Chunhai Fan, Lin He

期刊名称Current Nanoscience

期卷1(1):91-95



论文标题Electrochemical interrogation of DNA monolayers on gold surfaces

作者 Ruojun Lao, Shiping Song, Haiping Wu, Lihua Wang, Zhizhou Zhang*, Lin He, Chunhai Fan*

期刊名称Anal. Chem

期卷77,6475-64



论文标题NanoPCR Observation: Different levels of DNA replication fidelity in nanoparticles-enhanced polymerase chain reactions

作者 Cenchao Shen, Wenjuan Yang, Qiaoli Ji, Hisaji Maki, Anjie Dong, Zhizhou Zhang*

期刊名称Nanotechnology

期卷20 (2009)



论文标题Food storage material silver nanoparticles interfere with DNA replication fidelity and bind with DNA

作者Wenjuan Yang , Cenchao Shen , Qiaoli Ji , Hongjie An , Jinju Wang , Qingdai Liu , Zhizhou Zhang*

期刊名称Nanotechnology

期卷20 (2009)



论文标题Differential dependence on DNA ligase of type II restriction enzymes

作者Peng Chen , Jing Li , Jian Zhao , Lin He , Zhizhou Zhang*

期刊名称Biochem. Biophys. Res. Commun

期卷353(3),7



论文标题Enhanced amplification of GC-rich DNA with two organic reagents

作者Zhizhou Zhang*,Xia Yang, Fang Liu, Liangyu Meng, Cenchao Shen, Wenjuan Yang

期刊名称Biotechniques

期卷47(3):775-



论文标题Functional dissection of the global repressor Tup1 in yeast: dominant role of the C-terminal repression domain overlapping the f

作者Zhizhou Zhang, Usha Varanasi, and Robert Trumbly

期刊名称Genetics

期卷161:957-96



论文标题Aqueous suspension of carbon nanotubes enhances the efficiency of long PCR

作者Zhizhou Zhang*, Cencao Shen, Mingchun Wang and Xiaohong Cao

期刊名称Biotechniques

期卷44(4):537-



论文标题Engineered internal noise stochastic resonator in gene network: A model study

作者Zhiwei Wang, Zhonghuai Hou, Houwen Xin, Zhizhou Zhang*

期刊名称Biophysical Chemistry

期卷125 (2007)



论文标题Quantum dots induce hot-start effects for Taq-based polymerase chain reaction

作者Fuming Sang, Yang Yang, Hongyuan Wang, Xiaolei Ju, Zhizhou Zhang*

期刊名称Journal of Biomedical Science and Engineering

期卷Issue Date



论文标题CdTe Quantum Dots Enhance Feasibility of EvaGreen-Based Real-Time PCR with Decent Amplification Fidelity

作者Sang F, Zhang Z*, Xu Z, Ju X, Wang H, Zhang S, Guo C

期刊名称Mol Biotechnol.

期卷54(3):969-



论文标题QPCR Quantification Strategy of Minor Species in A Complex Microbial Community Using Species-specific Primers

作者Huimin Zhang, Changlu Guo, Hongkui He, Kaiqiang Li, Yanhe Lang and Qingwu Zhou ,Zhizhou Zhang*

期刊名称J PURE APPL MICROBIOl



论文标题Quantum dots accelerate the speed of Pfu-based polymerase chain reaction

作者Fuming Sang, Yang Yang, Hexiang Zhao, Meirong Ma, Zhizhou Zhang*

期刊名称Journal of Experimental Nanoscience



论文标题Quantum dots trigger hot-start effects for pfu-based polymerase chain reaction

作者Fuming Sang, Yang Yang, Jinjie Wang, Xiangyi Huang, Jicun Renb & Zhizhou Zhang*

期刊名称Journal of Experimental Nanoscience



论文标题Seven Potential Nucleic Chemicals Facilitate In Vitro Replication of DNA

作者Xu, Zhong; Zhao, Hexiang; Sang, Fuming; Zhao, Xin; Zhang, Zhizhou*

期刊名称RESEARCH JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY



论文标题A hot start alternative for high-fidelity DNA polymerase amplification mediated by quantum dots

作者Fuming Sang, Yang Yang, Ying Lin, and Zhizhou Zhang*

期刊名称ABBS



论文标题Phylum-specific primer design and implication in quantification of the microbial community structure in GuJingGong pit mud

作者 Ximei Luo, Zhilei Gao, Huimin Zhang, Anjun Li, Hongkui He, Changlu Guo, and Zhizhou Zhang*

期刊名称Advanced Materials Research



论文标题Differential Early Dynamic Process of Marine Eukaryotic Microbial Community on Anti-biofouling and Biofouling-enhancing Micro/Na

作者YuanSun, Zhizhou Zhang*

期刊名称J Chemical Pharmaceutical Research



论文标题Investigation of the interference of carbon nanomaterials with SYBR Green I-based real-time PCR

作者 Fuming Sang, Yuan Sun, Xu Zhong, Yushi Wang, Zhizhou Zhang*

期刊名称Advanced Materials Research



论文标题Long-Range Heterogeneous Electron Transfer of Ferrocene Functionalized Gold Nanoparticles Through Alkanethiol Bridges at Gold E

作者JIONG ZHANG, LIHUA WANG, YING WAN, XIAOLEI ZUO,SHIPING SONG*, ZHIZHOU ZHANG* and CHUNHAI FAN*

期刊名称Asian Journal of Chemistry



论文标题Application of Pseudo Amino Acid Composition for Predicting Protein Subcellular Location

作者Yu-Xi Pan, Zhi-Zhou Zhang, Zong-Ming Guo, Guo-Yin Feng, Zhen-De Huang,and Lin He

期刊名称Journal of Protein Chemistry



论文标题Aqueous suspension of carbon nanopowder enhances the efficiency of polymerase chain reaction

作者Zhizhou Zhang*, Mingchun Wang and Hongjie An

期刊名称Nanotechnology



论文标题Interactions between Cytochrome c and DNA Strands Self-Assembled at Gold Electrode

作者Ruojun Lao, Lihua Wang, Shiping Song*, Zhizhou Zhang*, Chunhai Fan, Lin He

期刊名称Int. J. Mol. Sci



论文标题DNA Add Using Linear Self-Assembly

作者Lulu Qian, Jian Zhao, Qiang Liu*, Zhizhou Zhang* and Lin He*

期刊名称Chinese Science Bulletin



论文标题Mutations of the WD repeats that compromise Tup1 repression function maintain structural integrity of the WD domain trypsin-resi

作者Zhizhou Zhang, Usha Varanasi, Pauline Carrico, and Robert J. Trumbly

期刊名称Archives of Biochemistry and Biophysics



论文标题Linearly programmed DNA-based molecular computer operated on magnetic particle surface in test-tube

作者Jian Zhao#, Zhizhou Zhang#*, Yongyong Shi, Jixia Liu and Lin He*

期刊名称Chinese Science Bulletin



论文标题 Effects of heating modes and sources on nanostructure of gelatinized starch molecules using atomic force microscopy

作者Hongjie An, Hongshun Yang, Zhongdong Liu, Zhizhou Zhang

期刊名称LWT-Food Sci and Technol



论文标题Transmission disequilibrium test provides evidence of association between promoter polymorphisms in 22q11 gene DGCR14 and schizo

作者Hongsheng Wang, Shiwei Duan, Jing Du, Xingwang Li, Yifeng Xu, Zhizhou Zhang et al

期刊名称Journal of Neural Transmission



论文标题Procedures for a dynamical system on {0,1}n with DNA molecules

作者Dongmei Xiao, Wenxia Li, Jiang Yu, Xiaodong Zhang, Zhizhou Zhang and Lin He

期刊名称Biosystems



论文标题An association study of the N-methyl-D-aspartate receptor NR1 subunit gene (GRIN1) and NR2B subunit gene (GRIN2B) in schizophren

作者Shengying Qin, Xu Zhao, Yuxi Pan, Jianhua Liu, Guoyin Feng , Jingchun Fu, Jiying Bao, Zhizhou Zhang and Lin He

期刊名称Euro. J Hum Genet



论文标题Predicting Protein Subcellular Location Using Digital Signal Processing Approach

作者Pan Yu-Xi, Li Da-Wei, Duan Yun, Zhang Zhi-Zhou, Xu Ming-Qing, Feng Guo-Yin, He Lin

期刊名称ACTA BIOCHIM BIOPHYS SIN



论文标题Highly sensitive biosensors based on water-soluble conjugated polymers

作者XU Hui, WU Haiping, FAN Chunhai*, LI Wenxin, ZHANG Zhizhou, HE Lin

期刊名称Chinese Science Bulletin



论文标题Solving maximum cut problems in the Adleman-Lipton model

作者Dongmei Xiao,Wenxia Li, Zhizhou Zhang and Lin He

期刊名称BioSystems



论文标题92.Association study between NPY and YWHAH gene polymorphism and schizophrenia

作者Wang Hongsheng, Duan Shiwei, Xing Qinghe, Li Xingwang, Xu Yifeng, Zhang Zhizhou, Wang Yujiong, Feng Guoyin, He Lin

期刊名称Acta Genetica Sinica



论文标题Convergence Analysis of Genetic Regulatory Networks based on Nonlinear Measures

作者Hongtao Lu, Zhizhou Zhang and Lin He

期刊名称Lecture Notes in Computer Science



论文标题Typing Aberrance in Signal Transduction

作者Zhang Min, Li Guoqiang, Fu Yuxi*, Zhang Zhizhou*, He Lin*

期刊名称Lecture Notes in Computer Science



论文标题An Implementation for Mapping SBML to BioSPI

作者Dong Zhupeng, Dong Xiaoju, Xu Xian, Fu Yuxi*, Zhang Zhizhou*, He Lin*

期刊名称Lecture Notes in Computer Science



论文标题Representation of the Signal Transduction with Aberrance Using Ipi Calculus

作者Zhang, M., Li, G., Fu, Y.*, Zhang, Z*., and He, L*

期刊名称Lecture Notes in Computer Science