基本信息科学研究教学研究论文著作
基本信息


多年来一直从事生物信息学、肿瘤信息学以及计算表观遗传学领域的科研工作。致力于表生物医学领域的高通量数据挖掘的算法和软件开发，可视化网络平台及数据库构建。科研成果在《Nucleic Acids Research》，《Science Reports》、《Development》、《Database》、《Briefings in Bioinformatics》等有国际影响的杂志上发表了多篇论文。研究方向涉及到肿瘤生物学、发育生物学、比较基因组学等领域的基因组、表观基因组、转录组和代谢组学的数据分析、功能挖掘以及生物标记物的识别。

工作经历

标题工作经历

职位,职务,职称教授，博士生导师

工作地点,工作单位 哈尔滨工业大学，生命科学与技术学院

起讫时间 2018/04- 至今



标题工作经历

职位,职务,职称教授，博士生导师

工作地点,工作单位哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院

起讫时间2006/05- 2018/04



教育经历

标题学习经历

起讫时间2003/04- 2006/03

所学专业计算生物学

学习机构日本国立新泻大学，自然科学研究科

学历博士



标题学习经历

起讫时间2001/04- 2003/03

所学专业计算生物学

学习机构日本国立新泻大学，理学院

学历硕士



标题学习经历

起讫时间1987/09- 1992/07

所学专业临床医学

学习机构哈尔滨医科大学

学历本科



主要任职

名称中国细胞生物学会功能基因组学与系统生物学专委会理事

任职时间2018.10



名称中国计算机学会生物信息学专委会委员

任职时间2017.10



名称中国细胞生物学会生物数据挖掘与计算专业组委员



名称中国细胞生物学会功能基因组与系统生物学分会转化医学与生物信息学专委会委员



名称黑龙江生物医学工程学会理事



名称《基因组学与应用生物学》编委



名称《Plos One》学术编辑


研究领域
研究方向：表观基因组变异分析技术、基于生物信息学挖掘肿瘤的基因组特征、基于机器学习的癌症诊断和预后评估体系构建


科研项目

项目名称乳腺癌瘤内微环境表观遗传异质性的系统分析及新型分子特征挖掘

项目来源国家自然科学基金

开始时间2016.01

结束时间2019.01

项目经费60

担任角色负责

项目类别纵向项目

项目状态进行中



奖项成果

奖项名称黑龙江省人民政府科学技术奖，二等奖（自然）

获奖时间2017.06

完成人张岩

所获奖项癌症中异常DNA甲基化标记提取技术


讲授课程
所讲的主要课程

《生物信息学》

《功能基因组信息学》

《生物信息挖掘技术》

《了解生物医学大数据》


招生信息
本课题组招收生物医学工程（生物信息学、生物信息技术方向）的硕士、博士研究生。

欢迎数学、生物信息学、计算机科学、软件工程专业的本科、硕士毕业生攻读硕士、博士学位。

课题组广聘英才，欢迎数学、生物信息学、计算机科学、软件工程专业的博士毕业生来课题组从事教学科研工作或博士后研究工作。



发表的论文

论文标题DiseaseMeth version 2.0

作者Xiong Y, Wei Y, Gu Y, Zhang S, Lyu J, Zhang B, Chen C, Zhu J, Wang Y, Liu H, Zhang Y*

期刊名称《Nucleic Acids Research》

期卷4;45(D1):D888-D895



论文标题DNA methylation dynamics: identification and functional annotation

作者Liu H, Li S, Wang X, Zhu J, Wei Y, Wang Y, Wen Y, Wang L, Huang Y, Zhang B, Shang S, Zhang Y*

期刊名称《Brief Funct Genomics》

期卷15(6):470-484.



论文标题Cell subpopulation deconvolution reveals breast cancer heterogeneity based on DNA methylation signature

作者Wen Y, Wei Y, Zhang S, Li S, Liu H, Wang F, Zhao Y, Zhang D,Zhang Y*

期刊名称《Briefing in Bioinformatics》

期卷18(3):426-440



论文标题The identification of age-associated cancer markers by an integrative analysis of dynamic DNA methylation changes

作者Wang Y, Zhang J, Xiao X, Liu H, Wang F, Li S, Wen Y, Wei Y, Su J, Zhang Y, Zhang Y*

期刊名称《Sci Rep》

期卷7;6:22723



论文标题SEA: a comprehensive SuperEnhancer Archive

作者Wei Y, Zhang S, Shang S, Zhang B, Wang X, Li S, Liu H, Zhang Y*

期刊名称《Nucleic Acids Research》

期卷4;44(D1):D172-9



论文标题Systematic identificationand annotation of human methylation marks based on bisulfite sequencing methylomes revealsdistinct roles of cell-type-specific hypomethylation in regulation of cell identify genes

作者Liu H, Liu X, Zhang S, Lv J, Li S, Shang S, Jia S, Wei Y, Wang F, Su J , Zhang Y*

期刊名称《Nucleic Acids Research》

期卷8;44(1):75-94



出版物

出版物名称《生物医学信息学》

作者张岩

出版时间,完成时间2018

出版社人民卫生出版社



出版物名称《医学生物学》

作者张岩

出版时间,完成时间2018

出版社人民卫生出版社



出版物名称《生物信息学》

作者张岩

出版时间,完成时间2010

出版社人民卫生出版社



出版物名称《生物信息学与医学实践》

作者张岩

出版时间,完成时间2012

出版社人民卫生出版社