福建师范大学数学与计算机科学学院的历史可追溯至1907年建立的福建优级师范学堂的数学专业。建国以后，福建华南女子文理学院、福建协和大学、福建省立师范专科学校、福建省研究院、福建学院等单位经过调整合并成立福建师范学院，保留发展了数学系。1972年改名为福建师范大学数学系。
　　
　　1996年成立计算机科学系，与原有的数学系合并，称为福建师范大学数学系和计算机科学系，2002年12月成立数学与计算机科学学院。1953年以来，数学系先后由王邦珍、王石生、林辰、谢晖春、陈世基、倪守平、薛卫民担任系主任；吴子文教授任院长。现任院长李永青教授、党总支书记吴子文教授。学院已为国家共培养了一万多名本、专科生和一百多名研究生。他们走上工作岗位后，积极工作、奋发向上，对社会作出了应有的贡献。有的成为本省中学工作或基础教育的骨干，有的成为地方的行政领导干部，有的成为各级工商、金融、税务、公司等企事业单位的会计和电脑开发的人才。
　　
　　学院现有数学与应用数学、信息与计算科学、计算机科学与技术、电子信息科学与技术四个全日制本科专业和数学本科、电脑财会、计算机应用、电子商务等5个成人教育本专科。设有函数论、代数、几何、微分方程、概率统计、中数、计算机软件、系统、网络与通信、电子信息、公共计算机等11个教研室和数学、计算机科学、应用数学三个研究所，数学教育研究室，计算机基础、网络、数学、软件、硬件等实验室。主办面向全国的《福建中学数学》杂志。该院的主要任务是培养中等学校数学教育师资、计算机师资和科学研究人员、电脑管理等专门人才。1983年建立了基础数学、概率论与数理统计2个硕士点，2000年获应用数学硕士学位授权点，招收16个研究方向的硕士研究生。2002-2003学年全院各类在校生近4000余人。
　　
　　学院现有教职工119人，专任教师95人其中教授11人，副教授、副研究员、高级工程师、高级实验师等计34人，占专任教师总数的38%，其中有博士后经历4人，具有博士学位12人，在读博士13人，硕士研究生导师23人。中青年教师42人，占教师总数的一半。有7人入选百千万人才工程，有7人被评为校优秀中青年教师，1人为省优秀中青年骨干教师，有13人先后获政府特殊津贴。
　　
　　概率统计为1个省重点学科，基础数学为省重点扶持学科。至今已获国家科技进步二等奖1项，省部级科技进步一等奖1项，二等奖9项，三等奖6项。函授教研室被评为省成人教育先进单位。近年来，学院共出版专著教材39部，发表论文近1000篇，其中在国家一级学术刊物上发表的168篇。