番茄不规则裂果性状的QTL定位及候选基因分析

陈斌, 吴震, 文军琴, 林昊维, 于璐, 薛灵姿, 周蓉, 蒋芳玲^*()

南京农业大学园艺学院,农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室,南京 210095

收稿日期:2021-02-07修回日期:2021-05-25出版日期:2021-07-25发布日期:2021-08-10
通讯作者:蒋芳玲E-mail:jfl@njau.edu.cn

基金资助:国家重点研发计划项目(2019YFD100190200);国家重点研发计划项目(2016YFD0100204);国家自然科学基金项目(32072581);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX（20）3101);中央高校基本科研业务费项目(KYZZ201909)

QTL Mapping and Candidate Genes Analysis of Irregular Fruit Cracking in Tomato

CHEN Bin, WU Zhen, WEN Junqin, LIN Haowei, YU Lu, XUE Lingzi, ZHOU Rong, JIANG Fangling^*()

College of Horticulture,Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China

Received:2021-02-07Revised:2021-05-25Online:2021-07-25Published:2021-08-10
Contact:JIANG Fangling E-mail:jfl@njau.edu.cn

摘要/Abstract

摘要： 为挖掘调控番茄不规则裂果性状的关键基因,利用番茄易发生不规则裂果的种质‘S189’和耐裂果的种质‘R91’杂交获得F₁代,之后F₁自交构建F₂群体。以F₂群体中挑选出的20株易裂果单株和20株耐裂果单株的DNA分别等量混合,构成易裂池和耐裂池,进行QTL-seq分析。共检测到2个调控番茄不规则裂果性状的QTL,分别位于2号染色体的38.75 ~ 42.14 Mb区域和5号染色体的49.07 ~ 49.48 Mb区域,暂命名为qCR2和qCR5。在qCR5的区域内仅检测到2个基因,利用2个亲本的红熟期果皮进行基因表达量分析,发现其差异均不显著。qCR2的区域较大,为快速有效地挖掘候选基因,利用43个多态性标记构建2号染色体标记连锁图,并结合F₂群体裂果率进行遗传连锁分析,在多态性标记sli2734和Bin3371之间检测到1个主效QTL,其LOD值为3.05,贡献率为7.05%,且其对应的物理位置与qCR2的区域相重合。联合QTL-seq分析和遗传连锁分析将候选区域缩小至39.55 ~ 39.94 Mb,记为qCR2.1。在qCR2.1的区域内共有53个基因,利用亲本红熟期果皮进行基因表达量分析,获得3个表达量差异显著的基因Solyc02g072400、Solyc02g072470和Solyc02g076780。其中Solyc02g076780表达量差异极显著,其与乙烯调控相关,推测其为控制番茄不规则裂果性状的关键候选基因。
中图分类号:
S641.2

引用本文

陈斌, 吴震, 文军琴, 林昊维, 于璐, 薛灵姿, 周蓉, 蒋芳玲. 番茄不规则裂果性状的QTL定位及候选基因分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1329-1339.
CHEN Bin, WU Zhen, WEN Junqin, LIN Haowei, YU Lu, XUE Lingzi, ZHOU Rong, JIANG Fangling. QTL Mapping and Candidate Genes Analysis of Irregular Fruit Cracking in Tomato[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(7): 1329-1339.





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