辣椒碱基–抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析
黄志楠,段伟科*,白雪滢,周 怡,祝梦全,刘思勤,鞠 佳,潘国庆淮阴工学院生命科学与食品工程学院,江苏淮安 223003
出版日期:
2020-11-25发布日期:
2020-12-07基金资助:
国家自然科学基金青年科学基金项目(31902021,31701931);江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20170462)Identification,Phylogenetic Evolution and Expression Analysis of NAT Gene Family in Pepper
HUANG Zhinan,DUAN Weike*,BAI Xueying,ZHOU Yi,ZHU Mengquan,LIU Siqin,JU Jia,and PAN GuoqingCollege of Life Sciences and Food Engineering,Huaiyin Institute of Technology,Huaian,Jiangsu 223003,China
Online:
2020-11-25Published:
2020-12-07摘要/Abstract
摘要: 利用生物信息学手段,在辣椒‘遵辣1号’中鉴定到12个碱基–抗坏血酸转运蛋白(NAT)基因,命名为CaNAT01 ~ CaNAT12,它们不均等的分布在7条染色体上,片段复制和串联复制是其扩增的原因。CaNATs包含多个跨膜结构域,等电点主要集中在8.39 ~ 10.15。系统进化分析发现植物中的NAT起源于D亚组基因,后经过分化,在双子叶植物中稳定存在4个亚组,C亚组基因间的核苷酸差异最小,在进化过程中最保守,CaNATs在这4个亚组均有不同分布。辣椒NAT家族基因具有明显的组织表达差异性,部分基因在根、茎以及果实发育过程中具有重要的调控作用。在低温、高温、干旱和盐胁迫下通过qRT-PCR分析发现CaNATs具有不同程度的响应,对低温和高温具有较强的响应。
中图分类号:
S 641.3
引用本文
黄志楠, 段伟科, 白雪滢, 周 怡, 祝梦全, 刘思勤, 鞠 佳, 潘国庆. 辣椒碱基–抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(11): 2132-2144.
HUANG Zhinan, DUAN Weike, BAI Xueying, ZHOU Yi, ZHU Mengquan, LIU Siqin, JU Jia, and PAN Guoqing. Identification,Phylogenetic Evolution and Expression Analysis of NAT Gene Family in Pepper[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(11): 2132-2144.
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