森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
徐 昇,张 鑫,刘德才,顾婷婷*南京农业大学园艺学院,南京 210095
出版日期:
2020-11-25发布日期:
2020-12-07基金资助:
国家自然科学基金项目(31672123):江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015B156)Identification and Functional Analysis of N6-Adenine Methylation(6mA)Methyltransferase Genes in Fragaria vesca
XU Sheng,ZHANG Xin,LIU Decai,and GU Tingting*College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China
Online:
2020-11-25Published:
2020-12-07摘要/Abstract
摘要: 通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个基因在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下各基因表达量变化显著不同。由此推测6mA甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。
中图分类号:
S 668.4
引用本文
徐 昇, 张 鑫, 刘德才, 顾婷婷. 森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(11): 2194-2206.
XU Sheng, ZHANG Xin, LIU Decai, and GU Tingting. Identification and Functional Analysis of N6-Adenine Methylation(6mA)Methyltransferase Genes in Fragaria vesca [J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(11): 2194-2206.
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