植物Gly-RLK基因家族鉴定及其在苹果中的表达分析
朵 虎1,赵兴刚2,吕前前1,王东东1,冒 霞1,刘 河1,赵 丹1,左存武1,*1甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070;2永靖县园林绿化中心,甘肃临夏731600
出版日期:
2020-10-25发布日期:
2020-11-10基金资助:
甘肃省大学生创新创业训练计划项目(201810733016);国家级大学生创新创业训练计划项目(201810733011);甘肃省高等学校产业支撑引导项目(2019C-11);甘肃农业大学青年导师基金项目(GAU-QDFC-2019-06)Identification of Plant Gly-RLK Gene Family and Expressional Analysis in Apple
DUO Hu1,Zhao Xinggang2,Lü Qianqian1,WANG Dongdong1,MAO Xia1,LIU He1,ZHAO Dan1,and ZUO Cunwu1,*1College of Horticulture,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;2Yongjing Landscaping Center,Linxia,Gansu 731600,China
Online:
2020-10-25Published:
2020-11-10摘要/Abstract
摘要: 类受体激酶(receptor like kinase,RLK)在植物生长发育和环境适应中起重要作用。前期研究发现苹果(Malus ? domestica)中存在一类具有Glyco_18胞外结构域(SM000636或SM000704)的RLK,命名为Glyco_18-RLK(Gly-RLK)。本试验中以Glyco_18和Pkinase(SM000220)保守域全蛋白序列为种子序列,对53种被子植物基因组中的Gly-RLK进行鉴定,并分析其进化特征;明确苹果Gly-RLK(MdGly-RLK)的理化性状、亚细胞定位,基因在染色体上的分布、启动子区域的顺式作用元件和表达模式。结果表明,仅19种植物中存在Gly-RLK,家族成员数介于1 ~ 20,单子叶植物中均未发现该家族成员。根据进化分析将其分为8个亚组,亚组Ⅲ、Ⅶ和Ⅷ分布基因数较多。共发现6个MdGly-RLK,其编码的氨基酸序列大小、分子量和等电点分别介于451 ~ 776、50.99 ~ 87.33 kD和5.95 ~ 8.21,主要位于质膜,4个为串联重复。MdGly-RLK在苹果各组织和品种间存在不同的表达模式;接种苹果腐烂病菌(Valsa mali)后,6个MdGly-RLK均差异表达,MdGly-RLK6(MD15G1156900)可上调至对照的16.33倍。综上,Gly-RLK仅在部分双子叶植物中存在,家族成员的扩增速度较快。MdGly-RLK响应苹果生长发育和黑腐皮壳菌信号,MdGly-RLK6可作为苹果抗腐烂病研究的候选基因。
中图分类号:
S 661.1
引用本文
朵 虎, 赵兴刚, 吕前前, 王东东, 冒 霞, 刘 河, 赵 丹, 左存武, . 植物Gly-RLK基因家族鉴定及其在苹果中的表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(10): 1883-1894.
DUO Hu, Zhao Xinggang, Lü Qianqian, WANG Dongdong, MAO Xia, LIU He, ZHAO Dan, and ZUO Cunwu, . Identification of Plant Gly-RLK Gene Family and Expressional Analysis in Apple[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(10): 1883-1894.
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