丹参DHAR家族基因的鉴定及表达模式分析

陈 尘1，韩立敏2，化文平2,*，杨晓潼2

1陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心，陕西省西安植物园，陕西省植物研究所，西安710061；2陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院，西安710100

出版日期:2020-11-25发布日期:2020-12-07


基金资助:国家自然科学基金项目（31800259）；陕西省自然科学基础项目（2019JQ-917）

Identification and Expression Analysis of Dehydroascorbate Reductase （DHAR）Gene Family in Salvia miltiorrhiza

CHEN Chen1，HAN Limin2，HUA Wenping2,*，and YANG Xiaotong2

1Shaanxi Engineering Research Centre for Conservation and Utilization of Botanical Resources，Institute of Botany of Shaanxi Province，Xi’an Botanical Garden of Shaanxi Province，Xi’an 710061，China；2College of Life Sciences and Food Engineering，Shaanxi Xueqian Normal University，Xi’an 710100，China

Online:2020-11-25Published:2020-12-07

摘要/Abstract

摘要： 运用生物信息学方法，从丹参（Salvia miltiorrhiza）基因组数据库中鉴定得到5个脱氢抗坏血酸还原酶（Dehydroascorbate reductase，DHAR）家族成员SmDHAR1 ~ SmDHAR5，分析了基因结构特征、编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、高级结构、系统进化关系以及启动子顺式作用元件，并考察了其在不同组织及胁迫下的表达模式。结果表明，SmDHAR基因家族成员长度在724 ~ 3 296 bp之间，含有1 ~ 5个外显子不等，编码218 ~ 470个氨基酸；其编码蛋白多为亲水性蛋白，且多不含跨膜结构域。SmDHAR家族成员分布在叶绿体和胞质外。系统进化分析结果显示丹参SmDHAR基因分为2个亚类。上游启动子区域分析发现SmDHAR基因家族成员均含有与植物发育、激素及胁迫响应相关的顺式作用元件。表达模式分析结果显示，SmDHAR5在丹参根中显著高表达，而在其余组织中表达量较低；SmDHAR1、SmDHAR3与SmDHAR4在根、茎、叶中表达量较高，在花组织中表达最低；SmDHAR2表现为组成型高表达。SmDHAR在茉莉酸甲酯、酵母提取物、脱落酸、赤霉素、水杨酸等处理时也表现出不同的响应模式。本研究的结果为深入探索丹参DHAR基因家族在抵抗逆境过程中的功能提供了参考。
中图分类号:
S 567.53

引用本文

陈 尘, 韩立敏, 化文平, 杨晓潼. 丹参DHAR家族基因的鉴定及表达模式分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(11): 2181-2193.
CHEN Chen, HAN Limin, HUA Wenping, and YANG Xiaotong. Identification and Expression Analysis of Dehydroascorbate Reductase （DHAR）Gene Family in Salvia miltiorrhiza[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(11): 2181-2193.





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