吴仲义(CHUNG-IWU)
所长,博士生导师，“****”研究员；台湾中研院院士
E-Mail：wuci(AT)big.ac.cn
研究领域：遗传学基因组学生物信息学
导师简介：学习经历：
1972年-1976年台湾东海大学生物学学士1977年-1982年加拿大英属哥伦比亚大学遗传学博士
工作经历：
.TRS_EditorP{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorDIV{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorTD{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorTH{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorSPAN{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorFONT{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorUL{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorLI{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorA{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorP{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorDIV{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorTD{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorTH{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorSPAN{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorFONT{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorUL{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorLI{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;}.TRS_EditorA{margin-top:0px;margin-bottom:12px;line-height:1.8;font-family:宋体;font-size:10.5pt;} 1976年9月-1977年8月台湾东海大学助教
1982年6月-1984年12月美国德克萨斯大学休斯顿健康中心博士后
1985年1月-1986年7月美国威斯康辛大学麦迪逊分校博士后
1986年8月-1990年8月美国罗彻斯特大学助理教授
1990年9月-1991年6月美国罗彻斯特大学副教授
1991年7月-1998年6月美国芝加哥大学副教授
1998年7月-2006年6月美国芝加哥大学生态与进化系系主任
1998年7月-2008年5月美国芝加哥大学教授
2004年7月-2008年5月中山大学****
2008年6月-至今中国科学院北京基因组研究所所长
学术兼职：
美国科学促进会委员，美国遗传学学术委员会、进化生物学学术委员会常委，中山大学****。曾任和现任PNAS、MolecularPhylogenyandEvolution、Genetics、GenomeBiologyandEvolution、GeneandGeneticsystem等期刊副主编。
获奖及荣誉：
1990-1995年获得NIH研究职业发展奖
1989-1991获得全国唐氏综合症协会奖
2004年获得台湾东海大学优秀毕业生奖
2004年被评为中研院院士
2004年美国自然科学进步协会会员
肿瘤基因组学遗传与进化基因组学计算生物学
近期主要学术成果：
1.LanJiang,JingZhang,Jing-JingWang,LuWang,LiZhang,XiaodanYang,XinMa,XinSun,JunCai,XingxuHuang,MiaoYu,ChuanHe,FengLiu,Chung-IWu,BoZhang,WeiminCi,JiangLiu（2013）Sperm,butnotoocyte,DNAmethylomeisinheritedbyzebrafishearlyembryos.Cell153(4):773-84
2.XuJ,ZhangR,ShenY,LiuG,LuX,WuCI*.(2013)TheevolutionofevolvabilityinmicroRNAtargetsitesinvertebrates.Genomeresearch.[Epubaheadofprint]
3.ZhengC,MiaoX,LiY,HuangY,RuanJ,MaX,WangL,WuCI,CaiJ.（2013）Determinationofgenomiccopynumberalterationemphasizingarestrictionsite-basedstrategyofgenomere-sequencing.Bioinformatics.[Epubaheadofprint]
4.YangShena,YangLva,LeiHuanga,WenshengLiua,MingWena,TianTanga,RuiZhangb,EricHungatec,SuhuaShia,andChung-IWu*（2011）,TestinghypothesesontherateofmolecularevolutioninrelationtogeneexpressionusingmicroRNAs.ProcNatlAcadSciUSA,108(38):p.15942-7
5.TaoY,RuanJ,YehSH,LuX,WangY,ZhaiW,CaiJ,LingS,GongQ,ChongZ,QuZ,LiQ,LiuJ,YangJ,ZhengC,ZengC,WangHY,ZhangJ,WangSH,HaoL,DongL,LiW,SunM,ZouW,YuC,LiC,LiuG,JiangL,XuJ,HuangH,LiC,MiS,ZhangB,ChenB,ZhaoW,HuS,ZhuangSM,ShenY,ShiS,BrownC,WhiteKP,ChenDS,ChenPJ,WuCI*（2011）Rapidgrowthofahepatocellularcarcinomaandthedrivingmutationsrevealedbyacell-populationgeneticanalysisofwhole-genomedata.Proc.Natl.Acad.Sci.108(29):12042-7
6.ShenY,LvY,HuangL,LiuW,WenM,TangT,ZhangR,HungateE,ShiS,WuCI*（2011）.Rateofmolecularevolutioninrelationtoexpressionlevel–AtestusingmicroRNAsinDrosophila.Proc.Natl.Acad.Sci108(38)15942-15947
7.TangT,KumarS,ShenY,LuJ,WuML,ShiS,LiWH,WuCI*（2010）.Adverseinteractionsbetweenmicro-RNAsandtargetgenesfromdifferentspecies.Proc.Natl.Acad.Sci,107,no.29:12935-40
8.ShapiroJA,HuangW,ZhangC,HubiszMJ,LuJ,TurissiniDA,FangS,WangHY,HudsonRR,NielsenR,ChenZ,WuCI*.（2007）.AdaptiveGenicevolutionintheDrosophilagenomes.Proc.Natl.Acad.Sci104:2271-2276
9.ShapiroJA,HuangW,ZhangC,HubiszMJ,LuJ,TurissiniDA,FangS,WangHY,HudsonRR,NielsenR,ChenZ,WuCI*.（2007）.AdaptivegenicevolutionintheDrosophilagenomes.Proc.Natl.Acad.Sci104:2271
10.Sun,S,C.Ting,andC.-IWu*（2004）Thenormalfunctionofaspeciationgene,Odysseus,anditshybridsterilityeffect.Science305:81-83.
11.He,Jetal.(51authors)（2004）.MolecuarevolutionoftheSARS-conronavirusduringthecourseofSARS-epidemicinChina.Science303:1666-1669(C.-IWuisacommunicatingauthorforthedataanalysissection).
12.Greenberg,A.J.,J.R.Moran,J.A.Coyne,andChung-IWu*（2003）Ecologicaladaptationduringincipientspeciationasrevealedbyprecisegenereplacement.Science302:1754-1757.
13.Lu,J.,W.-H.LiandC.-IWu*.（2003）Chromosomalspeciationandgeneflow.Science302:988c.
14.Fay,J.C.,G.J.WyckoffandC.-IWu*,（2002）Testingtheneutraltheoryofmolecularevolutionwithgenomicdata.Nature415:1024-1026.
15.Ting,C.-T.,S.-C.Tsaur,M.-L.WuandC.-IWu*,（1998）Arapidlyevolvinghomeoboxatthesiteofahybridsterilitygene.Science282:1501-1504.
16.Wu,C.-I,H.Hollocher,D.Begun,C.F.Aquadro,Y.XuandM.-L.Wu.（1995）SexualisolationinDrosophilamelanogaster:Apossiblecaseofincipientspeciation.Proc.Natl.Acad.Sci.92:2519-2523.
17.Johnson,N.A.,D.E.Perez,E.L.Cabot,H.HollocherandC.-IWu.（1992）.AtestofreciprocalX-YinteractionsasacauseofhybridsterilityinDrosophila.Nature358:751-753.
18.Wu,C.-I,J.R.TrueandN.Johnson.（1989）.FitnessreductionassociatedwiththedeletionofasatelliteDNAarray.Nature.341:248-251.
19.Wu,C.-I,T.W.Lyttle,M.-L.WuandG.Lin.（1988）.AssociationbetweenasatelliteDNAsequenceandtheResponderofSegregationDistorterinD.melanogaster.Cell54:179-189.
20.Wu,C.-IandN.Maeda（1987）.InequalityinmutationratesofthetwostrandsofDNA.Nature327:169-170.
1、国家自然科学基金委主任基金30950006""适应性进化的基因组学—通过第二代测序技术检测基因组变异""项目资金2010年1月-2010年12月已完成项目负责人
2、中国科学院知识创新工程重大项目课题KSCX1-YW-22“癌症重大科学问题及防治新策略的研究”，课题“癌症基因组和蛋白质组研究”2009年6月-2012年12月
已完成课题主持人
3、农业部转基因专项2009ZX08010-017B“基于microRNA干涉的转基因新技术的开发与应用”2009年6月-2012年12月已完成项目负责人
4、国家自然科学基金重点项目31130069“MicroRNAs的功能进化分析与全基因组表达稳定性的渠化调控”2012年1月-2016年12月正在进行项目负责人
5、****配套经费中国科学院2010-2012
已完成项目负责人
6、中国科学院重点部署项目KJZD-EW-L06“肿瘤微进化和第二代肿瘤基因组学”201年1月-2015年12月
正在进行项目负责人
7、科技部973课题2014CB542006“肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究”2014年1月-2018年12月正在进行课题主持人
课题组目前的主要研究方向：癌症基因组学研究、miRNA的进化及其与目的基因的共进化研究。吴仲义开创性地将进化和系统生物的研究策略引入肿瘤基因组学和肿瘤生物学研究中，用群体遗传学理论和高通量测序手段分析肿瘤发生发展的历史，鉴别癌细胞群体增殖、分化及转移过程中的关键突变和基因组结构变异，为研究癌症起源、开发早期检测和肿瘤个体化治疗开拓了全新的研究思路和方向。同时，运用系统生物学的手段，揭示了miRNA很可能在调控系统中具有缓冲作用和维持转录组的稳定，并说明了miRNA在肿瘤非正常调控系统中的作用。
招收具有生物学、数学和计算机学相关背景的学生
工作经历：
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1982年6月-1984年12月美国德克萨斯大学休斯顿健康中心博士后
1985年1月-1986年7月美国威斯康辛大学麦迪逊分校博士后
1986年8月-1990年8月美国罗彻斯特大学助理教授
1990年9月-1991年6月美国罗彻斯特大学副教授
1991年7月-1998年6月美国芝加哥大学副教授
1998年7月-2006年6月美国芝加哥大学生态与进化系系主任
1998年7月-2008年5月美国芝加哥大学教授
2004年7月-2008年5月中山大学****
2008年6月-至今中国科学院北京基因组研究所所长
主要研究领域：
肿瘤基因组学遗传与进化基因组学计算生物学
承担科研项目情况：
1、国家自然科学基金委主任基金30950006""适应性进化的基因组学—通过第二代测序技术检测基因组变异""项目资金2010年1月-2010年12月已完成项目负责人
2、中国科学院知识创新工程重大项目课题KSCX1-YW-22“癌症重大科学问题及防治新策略的研究”，课题“癌症基因组和蛋白质组研究”2009年6月-2012年12月
已完成课题主持人
3、农业部转基因专项2009ZX08010-017B“基于microRNA干涉的转基因新技术的开发与应用”2009年6月-2012年12月已完成项目负责人
4、国家自然科学基金重点项目31130069“MicroRNAs的功能进化分析与全基因组表达稳定性的渠化调控”2012年1月-2016年12月正在进行项目负责人
5、****配套经费中国科学院2010-2012
已完成项目负责人
6、中国科学院重点部署项目KJZD-EW-L06“肿瘤微进化和第二代肿瘤基因组学”201年1月-2015年12月
正在进行项目负责人
7、科技部973课题2014CB542006“肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究”2014年1月-2018年12月正在进行课题主持人
代表论著：
1.LanJiang,JingZhang,Jing-JingWang,LuWang,LiZhang,XiaodanYang,XinMa,XinSun,JunCai,XingxuHuang,MiaoYu,ChuanHe,FengLiu,Chung-IWu,BoZhang,WeiminCi,JiangLiu（2013）Sperm,butnotoocyte,DNAmethylomeisinheritedbyzebrafishearlyembryos.Cell153(4):773-84
2.XuJ,ZhangR,ShenY,LiuG,LuX,WuCI*.(2013)TheevolutionofevolvabilityinmicroRNAtargetsitesinvertebrates.Genomeresearch.[Epubaheadofprint]
3.ZhengC,MiaoX,LiY,HuangY,RuanJ,MaX,WangL,WuCI,CaiJ.（2013）Determinationofgenomiccopynumberalterationemphasizingarestrictionsite-basedstrategyofgenomere-sequencing.Bioinformatics.[Epubaheadofprint]
4.YangShena,YangLva,LeiHuanga,WenshengLiua,MingWena,TianTanga,RuiZhangb,EricHungatec,SuhuaShia,andChung-IWu*（2011）,TestinghypothesesontherateofmolecularevolutioninrelationtogeneexpressionusingmicroRNAs.ProcNatlAcadSciUSA,108(38):p.15942-7
5.TaoY,RuanJ,YehSH,LuX,WangY,ZhaiW,CaiJ,LingS,GongQ,ChongZ,QuZ,LiQ,LiuJ,YangJ,ZhengC,ZengC,WangHY,ZhangJ,WangSH,HaoL,DongL,LiW,SunM,ZouW,YuC,LiC,LiuG,JiangL,XuJ,HuangH,LiC,MiS,ZhangB,ChenB,ZhaoW,HuS,ZhuangSM,ShenY,ShiS,BrownC,WhiteKP,ChenDS,ChenPJ,WuCI*（2011）Rapidgrowthofahepatocellularcarcinomaandthedrivingmutationsrevealedbyacell-populationgeneticanalysisofwhole-genomedata.Proc.Natl.Acad.Sci.108(29):12042-7
6.ShenY,LvY,HuangL,LiuW,WenM,TangT,ZhangR,HungateE,ShiS,WuCI*（2011）.Rateofmolecularevolutioninrelationtoexpressionlevel–AtestusingmicroRNAsinDrosophila.Proc.Natl.Acad.Sci108(38)15942-15947
7.TangT,KumarS,ShenY,LuJ,WuML,ShiS,LiWH,WuCI*（2010）.Adverseinteractionsbetweenmicro-RNAsandtargetgenesfromdifferentspecies.Proc.Natl.Acad.Sci,107,no.29:12935-40
8.ShapiroJA,HuangW,ZhangC,HubiszMJ,LuJ,TurissiniDA,FangS,WangHY,HudsonRR,NielsenR,ChenZ,WuCI*.（2007）.AdaptiveGenicevolutionintheDrosophilagenomes.Proc.Natl.Acad.Sci104:2271-2276
9.ShapiroJA,HuangW,ZhangC,HubiszMJ,LuJ,TurissiniDA,FangS,WangHY,HudsonRR,NielsenR,ChenZ,WuCI*.（2007）.AdaptivegenicevolutionintheDrosophilagenomes.Proc.Natl.Acad.Sci104:2271
10.Sun,S,C.Ting,andC.-IWu*（2004）Thenormalfunctionofaspeciationgene,Odysseus,anditshybridsterilityeffect.Science305:81-83.
11.He,Jetal.(51authors)（2004）.MolecuarevolutionoftheSARS-conronavirusduringthecourseofSARS-epidemicinChina.Science303:1666-1669(C.-IWuisacommunicatingauthorforthedataanalysissection).
12.Greenberg,A.J.,J.R.Moran,J.A.Coyne,andChung-IWu*（2003）Ecologicaladaptationduringincipientspeciationasrevealedbyprecisegenereplacement.Science302:1754-1757.
13.Lu,J.,W.-H.LiandC.-IWu*.（2003）Chromosomalspeciationandgeneflow.Science302:988c.
14.Fay,J.C.,G.J.WyckoffandC.-IWu*,（2002）Testingtheneutraltheoryofmolecularevolutionwithgenomicdata.Nature415:1024-1026.
15.Ting,C.-T.,S.-C.Tsaur,M.-L.WuandC.-IWu*,（1998）Arapidlyevolvinghomeoboxatthesiteofahybridsterilitygene.Science282:1501-1504.
16.Wu,C.-I,H.Hollocher,D.Begun,C.F.Aquadro,Y.XuandM.-L.Wu.（1995）SexualisolationinDrosophilamelanogaster:Apossiblecaseofincipientspeciation.Proc.Natl.Acad.Sci.92:2519-2523.
17.Johnson,N.A.,D.E.Perez,E.L.Cabot,H.HollocherandC.-IWu.（1992）.AtestofreciprocalX-YinteractionsasacauseofhybridsterilityinDrosophila.Nature358:751-753.
18.Wu,C.-I,J.R.TrueandN.Johnson.（1989）.FitnessreductionassociatedwiththedeletionofasatelliteDNAarray.Nature.341:248-251.
19.Wu,C.-I,T.W.Lyttle,M.-L.WuandG.Lin.（1988）.AssociationbetweenasatelliteDNAsequenceandtheResponderofSegregationDistorterinD.melanogaster.Cell54:179-189.
20.Wu,C.-IandN.Maeda（1987）.InequalityinmutationratesofthetwostrandsofDNA.Nature327:169-170.
社会任职：
美国科学促进会委员，美国遗传学学术委员会、进化生物学学术委员会常委，中山大学****。曾任和现任PNAS、MolecularPhylogenyandEvolution、Genetics、GenomeBiologyandEvolution、GeneandGeneticsystem等期刊副主编。
获奖及荣誉：
1990-1995年获得NIH研究职业发展奖
1989-1991获得全国唐氏综合症协会奖
2004年获得台湾东海大学优秀毕业生奖
2004年被评为中研院院士
2004年美国自然科学进步协会会员
