方向东(XiangdongFANG)
博士生导师，“百人计划”研究员
E-Mail：fangxd@big.ac.cn
研究领域：基因组学遗传学
导师简介：学习经历：
1986年-1992年第一军医大学(现南方医科大学)六年制临床医学本科1992年-1995年第一军医大学免疫学硕士研究生导师王小宁教授、戚正武院士1996年-1999年第一军医大学人体解剖学和组织胚胎学博士研究生导师李进教授、戚正武院士
工作经历：
1993-1995中科院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室访问学者
1995-1996第一军医大学分子免疫学研究所助教
1997-1999中科院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室访问学者
1999-2000上海医科大学基因研究中心暨卫生部糖复合物重点实验室博士后
2000-2003美国华盛顿大学医学院博士后
2003-2007美国华盛顿大学医学院讲师
2007-2009美国华盛顿大学医学院助理研究员
2009-至今中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员
学术兼职：
2002SigmaXi,theScientificResearchSociety2003AmericanAssociationfortheAdvancementofScience(AAAS)2004AmericanSocietyofGeneTherapy(ASGT)2005TheHistochemicalSociety(HCS)2009中国遗传学会会员2010AssociateEditors-in-Chief，GenomicsProteomicsBioinformatics2011《遗传》编委2012《发育医学》(网络版)副主编
获奖及荣誉：
2003年上海市科技进步三等奖(033101)《重组基因工程药物凝血因子VIII的研制与开发》
2000年广东省科技进步二等奖(2000-J-2-R02-X058)《重组蛋白质表达、复性、纯化新工艺及人G-CSF新药研制》
1998年国家II类新药证书((98)卫药证字S-09)《重组人粒细胞集落刺激因子(rhG-CSF)的研制》
1998年中国人民解放军科技进步三等奖(1998-3-93-3)《IL-2/GM-CSF融合基因的构建，克隆及高效表达》
2004年中国专利(CN1361178)《产生凝血因子VIII的生产方法和宿主细胞》
2002年中国专利(CN1334084)《含吡咯并喹啉醌的治疗铅中毒的药物组合物》
2001年中国专利(CN1324821)《新的人促神经营养因子及其编码序列，及制法和用途》1998年中国专利(CN1169998)《重组蛋白提取纯化方法》
干细胞、遗传性血液病和恶性肿瘤的组学数据挖掘与转化医学研究
近期主要学术成果：
1.WangY#,ZhangZ#,XuF,ZhangQ,YangZ,ChiY,MengL,YangS,YanS,MaoA,ZhangJ,YangY,WangS,CuiJ,LiangL,JiY,HanZB*,FangX*,HanZ*.Long-termculturedmesenchymalstemcellsfrequentlydevelopgenomicmutationsbutdonotundergomalignanttransformation.CellDeathDis2013;Accepted
2.YangY#,WangH#,ChangKH#,QuH,ZhangZ,XiongQ,QiH,CuiP,LinQ,RuanX,YangY,LiY,ShuC,LiQ,WakelandEK,YanJ,HuS*,FangX*.Dynamictranscriptomesduringhumanerythroiddifferentiationanddevelopment.Genomics2013;[Epubaheadofprint]PMID:24121002
3.ChangKH#,FangX#,WangH,HuangA,CaoH,YangY,BonigH,StamatoyannopoulosJA,PapayannopoulouT*.Epigeneticmodificationsandchromosomeconformationsofthebeta-globinlocusthroughoutdevelopment.StemCellRev2013;9(4):397-407
4.XiongQ#,ZhangZ#,ChangKH#,QuH,WangH,QiH,LiY,RuanX,YangY,YangY,LiY,SandstromR,SaboPJ,LiQ,StamatoyannopoulosG,StamatoyannopoulosJA*,FangX*.Comprehensivecharacterizationoferythroid-specificenhancersinthegenomicregionsofhumanKrüppel-likefactors.BMCGenomics2013;14(1):587
5.WangH#,HuH#,ZhangQ,YangY,HuY,RuanX,YangY,ZhangZ,ShuC,YanJ,WakelandEK,LiQ,HuS*,FangX*.Dynamictranscriptomesofhumanmyeloidleukemiacells.Genomics2013;102(4):250-6
6.QuH,FangX*.AbriefreviewonthehumanencyclopediaofDNAelements(ENCODE)project.GenomicsProteomicsBioinformatics2013;11(3):135-41
7.SuRJ#,YangY#,NeisesA,PayneKJ,WangJ,WakelandEK,ViswanathanK,FangX*,ZhangXB*.Fewdenovosinglenucleotidevariationsinexomesofhumancordbloodinducedpluripotentstemcells.PLoSOne2013;8(4):e59908
8.LiY#,WangH#,YangB#,YangJ,RuanX,YangY,WakelandEK,LiQ*,FangX*.Influenceofcarbonmonoxideongrowthandapoptosisofhumanumbilicalarterysmoothmusclecellsandveinendothelialcells.IntJBiolSci2012;8(10):1431-46
9.FangX,YinW,XiangP,HanH,StamatoyannopoulosG*,LiQ*.ThehigherstructureofchromatinintheLCRofthebeta-globinlocuschangesduringdevelopment.JMolBiol2009;394(2):197-208
10.FangX,XiangP,YinW,StamatoyannopoulosG,LiQ*.Cooperativenessofthehigherchromatinstructureofthebeta-globinlocusrevealedbythedeletionmutationsofHS3oftheLCR.JMolBiol2007;365(1):31-7
11.FangX,SunJ,XiangP,YuM,NavasPA,PetersonKR,StamatoyannopoulosG,LiQ*.Synergisticandadditivepropertiesofthebeta-globinLCRrevealedby5'HS3deletionmutations:ImplicationforLCRchromatinarchitecture.MolCellBiol2005;25(16):7033-41
12.LiQ*,FangX,HanH,andStamatoyannopoulosG.Theminimalpromoterdeterminessilencingofthegalagogamma-globingeneinadulterythropoiesis.ProcNatlAcadSciUSA.2004;101(21):8096-101
13.FangX,HanH,StamatoyannopoulosG,LiQ*.DevelopmentallyspecificroleoftheCCAATboxinregulationofhumangamma-globingeneexpression.JBiolChem2004;279(7):5444-9
14.FangX,PetersonKR,LiQ,StamatoyannopoulosG*.Locuscontrolregions.In:MakridesSC,ed.GeneTransferAndExpressionInMammalianCells.St.Louis:ElsevierScienceB.V.;2003.pp.397-409
15.DuanZJ#,FangX#,RohdeA,HanH,StamatoyannopoulosG,LiQ*.DevelopmentalspecificityofrecruitmentofTBPtotheTATAboxofthehumangamma-globingene.ProcNatlAcadSciUSA2002;99(8):5509-14
16.FangX,ChenC,WangQ,GuJ,ChiC*.Theinteractionofthecalcium-andintegrin-bindingprotein(CIBP)withthecoagulationfactorVIII.ThrombRes2001;102(2):177-85
17.方向东,高基民,林来兴妹,马骊,王小宁*.人G-CSF新型高效表达克隆的构建与鉴定.中国免疫学杂志,1998;14(5):375-7
18.方向东,马骊,高基民,黄树其,王小宁*.人粒细胞集落刺激因子基因重组及在E.coli中的表达和鉴定.中国生化药物杂志,1998;19(1):1-5
19.方向东,林来兴妹,高基民,黄树其,马骊,周峻岭,王小宁*.重组人G-CSF大肠杆菌表达产物的纯化与鉴定.中国生物制品学杂志,1997;10(1):1-4
20.方向东,黄洪莲,曹钧,黄建生,张明军,黄春媚,王小宁*.以菌体作载体制备伤寒杆菌脂多糖抗血清.细胞和分子免疫学杂志(单克隆抗体通讯),1994;10(1):61-2
1、中科院干细胞与再生医学战略性先导科技专项重点项目子课题“利用高通量组学平台和系统生物学分析技术筛选肿瘤干细胞的特异性标记物和治疗靶点”；
2、国家重大科学仪器设备开发专项分课题“高通量细胞分选多模式检测仪器在血液干细胞分化研究中的应用”；
3、国家“十二五”科技支撑计划分课题“干细胞用于血液系统恶性疾病诊断和治疗的研究”；
4、国家“十二五”863计划分课题“肿瘤的个体化RNA干扰治疗”；
5、国家外专局高端外国专家项目、国家自然科学基金、教育部回国人员科研启动基金、中科院/诺和诺德专项研究合作项目等。
.TRS_EditorP{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorDIV{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorTD{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorTH{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorSPAN{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorFONT{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorUL{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorLI{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}.TRS_EditorA{LINE-HEIGHT:1.8;MARGIN-TOP:0px;FONT-FAMILY:宋体;MARGIN-BOTTOM:12px;FONT-SIZE:10.5pt}利用建立在新一代测序平台的转录组、全外显子组、甲基化DNA作图、DNaseI作图、ChIP、3C等高通量组学技术，以人类干细胞和各种血液病、恶性肿瘤为主要研究对象，在DNA、RNA、蛋白质、以及染色质等不同调控层次上筛选与细胞发育和分化、以及肿瘤发生和转移等重要生物学事件相关的分子标记、重要信号转导通路、关键调控单元和调控网络，并探讨其分子机制和生物学功能，建立针对重要疾病发病机制与靶向干预的分子基础与技术指标，为临床制定更加高效、特异的分子干预策略、并开展其规范化研究提供理论基础和实验依据。
工作经历：
1993-1995中科院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室访问学者
1995-1996第一军医大学分子免疫学研究所助教
1997-1999中科院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室访问学者
1999-2000上海医科大学基因研究中心暨卫生部糖复合物重点实验室博士后
2000-2003美国华盛顿大学医学院博士后
2003-2007美国华盛顿大学医学院讲师
2007-2009美国华盛顿大学医学院助理研究员
2009-至今中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员
主要研究领域：
干细胞、遗传性血液病和恶性肿瘤的组学数据挖掘与转化医学研究
承担科研项目情况：
1、中科院干细胞与再生医学战略性先导科技专项重点项目子课题“利用高通量组学平台和系统生物学分析技术筛选肿瘤干细胞的特异性标记物和治疗靶点”；
2、国家重大科学仪器设备开发专项分课题“高通量细胞分选多模式检测仪器在血液干细胞分化研究中的应用”；
3、国家“十二五”科技支撑计划分课题“干细胞用于血液系统恶性疾病诊断和治疗的研究”；
4、国家“十二五”863计划分课题“肿瘤的个体化RNA干扰治疗”；
5、国家外专局高端外国专家项目、国家自然科学基金、教育部回国人员科研启动基金、中科院/诺和诺德专项研究合作项目等。
代表论著：
1.WangY#,ZhangZ#,XuF,ZhangQ,YangZ,ChiY,MengL,YangS,YanS,MaoA,ZhangJ,YangY,WangS,CuiJ,LiangL,JiY,HanZB*,FangX*,HanZ*.Long-termculturedmesenchymalstemcellsfrequentlydevelopgenomicmutationsbutdonotundergomalignanttransformation.CellDeathDis2013;Accepted
2.YangY#,WangH#,ChangKH#,QuH,ZhangZ,XiongQ,QiH,CuiP,LinQ,RuanX,YangY,LiY,ShuC,LiQ,WakelandEK,YanJ,HuS*,FangX*.Dynamictranscriptomesduringhumanerythroiddifferentiationanddevelopment.Genomics2013;[Epubaheadofprint]PMID:24121002
3.ChangKH#,FangX#,WangH,HuangA,CaoH,YangY,BonigH,StamatoyannopoulosJA,PapayannopoulouT*.Epigeneticmodificationsandchromosomeconformationsofthebeta-globinlocusthroughoutdevelopment.StemCellRev2013;9(4):397-407
4.XiongQ#,ZhangZ#,ChangKH#,QuH,WangH,QiH,LiY,RuanX,YangY,YangY,LiY,SandstromR,SaboPJ,LiQ,StamatoyannopoulosG,StamatoyannopoulosJA*,FangX*.Comprehensivecharacterizationoferythroid-specificenhancersinthegenomicregionsofhumanKrüppel-likefactors.BMCGenomics2013;14(1):587
5.WangH#,HuH#,ZhangQ,YangY,HuY,RuanX,YangY,ZhangZ,ShuC,YanJ,WakelandEK,LiQ,HuS*,FangX*.Dynamictranscriptomesofhumanmyeloidleukemiacells.Genomics2013;102(4):250-6
6.QuH,FangX*.AbriefreviewonthehumanencyclopediaofDNAelements(ENCODE)project.GenomicsProteomicsBioinformatics2013;11(3):135-41
7.SuRJ#,YangY#,NeisesA,PayneKJ,WangJ,WakelandEK,ViswanathanK,FangX*,ZhangXB*.Fewdenovosinglenucleotidevariationsinexomesofhumancordbloodinducedpluripotentstemcells.PLoSOne2013;8(4):e59908
8.LiY#,WangH#,YangB#,YangJ,RuanX,YangY,WakelandEK,LiQ*,FangX*.Influenceofcarbonmonoxideongrowthandapoptosisofhumanumbilicalarterysmoothmusclecellsandveinendothelialcells.IntJBiolSci2012;8(10):1431-46
9.FangX,YinW,XiangP,HanH,StamatoyannopoulosG*,LiQ*.ThehigherstructureofchromatinintheLCRofthebeta-globinlocuschangesduringdevelopment.JMolBiol2009;394(2):197-208
10.FangX,XiangP,YinW,StamatoyannopoulosG,LiQ*.Cooperativenessofthehigherchromatinstructureofthebeta-globinlocusrevealedbythedeletionmutationsofHS3oftheLCR.JMolBiol2007;365(1):31-7
11.FangX,SunJ,XiangP,YuM,NavasPA,PetersonKR,StamatoyannopoulosG,LiQ*.Synergisticandadditivepropertiesofthebeta-globinLCRrevealedby5'HS3deletionmutations:ImplicationforLCRchromatinarchitecture.MolCellBiol2005;25(16):7033-41
12.LiQ*,FangX,HanH,andStamatoyannopoulosG.Theminimalpromoterdeterminessilencingofthegalagogamma-globingeneinadulterythropoiesis.ProcNatlAcadSciUSA.2004;101(21):8096-101
13.FangX,HanH,StamatoyannopoulosG,LiQ*.DevelopmentallyspecificroleoftheCCAATboxinregulationofhumangamma-globingeneexpression.JBiolChem2004;279(7):5444-9
14.FangX,PetersonKR,LiQ,StamatoyannopoulosG*.Locuscontrolregions.In:MakridesSC,ed.GeneTransferAndExpressionInMammalianCells.St.Louis:ElsevierScienceB.V.;2003.pp.397-409
15.DuanZJ#,FangX#,RohdeA,HanH,StamatoyannopoulosG,LiQ*.DevelopmentalspecificityofrecruitmentofTBPtotheTATAboxofthehumangamma-globingene.ProcNatlAcadSciUSA2002;99(8):5509-14
16.FangX,ChenC,WangQ,GuJ,ChiC*.Theinteractionofthecalcium-andintegrin-bindingprotein(CIBP)withthecoagulationfactorVIII.ThrombRes2001;102(2):177-85
17.方向东,高基民,林来兴妹,马骊,王小宁*.人G-CSF新型高效表达克隆的构建与鉴定.中国免疫学杂志,1998;14(5):375-7
18.方向东,马骊,高基民,黄树其,王小宁*.人粒细胞集落刺激因子基因重组及在E.coli中的表达和鉴定.中国生化药物杂志,1998;19(1):1-5
19.方向东,林来兴妹,高基民,黄树其,马骊,周峻岭,王小宁*.重组人G-CSF大肠杆菌表达产物的纯化与鉴定.中国生物制品学杂志,1997;10(1):1-4
20.方向东,黄洪莲,曹钧,黄建生,张明军,黄春媚,王小宁*.以菌体作载体制备伤寒杆菌脂多糖抗血清.细胞和分子免疫学杂志(单克隆抗体通讯),1994;10(1):61-2
社会任职：
2002SigmaXi,theScientificResearchSociety2003AmericanAssociationfortheAdvancementofScience(AAAS)2004AmericanSocietyofGeneTherapy(ASGT)2005TheHistochemicalSociety(HCS)2009中国遗传学会会员2010AssociateEditors-in-Chief，GenomicsProteomicsBioinformatics2011《遗传》编委2012《发育医学》(网络版)副主编
获奖及荣誉：
2003年上海市科技进步三等奖(033101)《重组基因工程药物凝血因子VIII的研制与开发》
2000年广东省科技进步二等奖(2000-J-2-R02-X058)《重组蛋白质表达、复性、纯化新工艺及人G-CSF新药研制》
1998年国家II类新药证书((98)卫药证字S-09)《重组人粒细胞集落刺激因子(rhG-CSF)的研制》
1998年中国人民解放军科技进步三等奖(1998-3-93-3)《IL-2/GM-CSF融合基因的构建，克隆及高效表达》
2004年中国专利(CN1361178)《产生凝血因子VIII的生产方法和宿主细胞》
2002年中国专利(CN1334084)《含吡咯并喹啉醌的治疗铅中毒的药物组合物》
2001年中国专利(CN1324821)《新的人促神经营养因子及其编码序列，及制法和用途》1998年中国专利(CN1169998)《重组蛋白提取纯化方法》
