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中国科学院北京基因组研究所研究生导师简介-曾长青

北京基因组研究所 免费考研网/2013-11-30

    简介研究方向发表论著承担科研项目项目组情况招生信息

曾长青(ChangqingZen)
博士生导师,杰出青年;“百人计划”研究员
E-Mail:czeng(AT)big.ac.cn
研究领域:遗传学、基因组学、生物信息学
导师简介:学习经历:
1978-1982北京师范大学生物学系学士学位1982-1985北京师范大学生物学系硕士学位1987-1993美国阿拉巴马大学伯明翰校区博士学位
工作经历:
1985-1987北京师范大学生物学系讲师
1994-2000美国贝勒医学院生化与分子生物学系ResearchAssociate博士后
2000-2002美国德克萨斯大学休斯敦医学院综合生物学与药理学系助理教授
2002-2006北京华大基因研究中心研究员科研部部长
2003-2006北京师范大学特聘讲座教授
2003-中科院北京基因组研究所研究员
2010-中科院北京基因组研究所重大疾病和个体化医疗重点实验室主任

学术兼职:
2013-,TheGlobalAllianceinthefieldofhumangenomics,theRepresentativeoftheChineseAcademyofSciences(人类基因组全球联盟中科院代表);2012-,中国细胞生物学会染色体基因组和蛋白组学分会,副会长;2010-,第二届中国人类遗传资源管理专家组,成员;2002-06,TheInternationalHapMapConsortium,SteeringCommitteemember,RepresentativeoftheChineseHapMapConsortium;2002-06,中华单体型图协作组,负责和召集人"
获奖及荣誉:
1987获得CUSBEA奖学金
2002入选中国科学院“百人计划”
2002获得“国家杰出青年科学基金”
2003获ExcellenceinCreativity,LiFoundationHeritagePrize,theUnitedStates,美国李氏基金会“杰出成就奖”(个人)
2004入选“首批新世纪百千万人才工程国家级人选”
2007中国基础研究十大新闻“证实CASP8基因启动子的一个六核苷酸插入缺失多态与多种癌症易感性相关”(林东昕,曾长青)
2009朱李月华优秀教师奖
2011教育部自然科学奖一等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用”(排名4/16)
2012北京市科学技术奖二等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用”(排名4/16)"
1)肿瘤基因组学和疾病基因组研究。包括应用高通量基因组学手段研究癌组织的基因突变和肿瘤基因表达,复杂性疾病的易感基因研究和单基因病的突变定位,乙肝病毒基因组突变等,同时进行相关的转化医学探索
2)藏族高原适应性的遗传基础和重要功能基因的功能研究。包括人群遗传多态研究,选择信号的发现和验证,低氧应答和细胞周期相关基因或基因产物的功能和调控研究等。
近期主要学术成果:
10篇代表性论文
1、YangJ,ChenY,LiX,WeiX,ChenX,ZhangL,ZhangY,XuQ,WangH,LiY,LuC,ChenW,ZengC*,YinT*(2013).InfluenceofCYP2C9andVKORC1genotypesontheriskofhemorrhagiccomplicationsinwarfarin-treatedpatients:asystematicreviewandmeta-analysis.IntJCardiol.168:4234–4243.(*corresponding)
2、ChengF,ZhangX,ZhangY,LiC,ZengC.Haplo2Ped:atoolusinghaplotypesasmarkersforlinkageanalysis(2011).BMCBioinformatics,12:350(Highlyaccessed).
3、BeallCM,CavalleriGL,DengL,ElstonRC,GaoY,KnightJ,LiC,LiJC,LiangY,McCormackM,MontgomeryHE,PanH,RobbinsRA*,ShiannaKV,TamSC,TseringN,VeeramahK,WangW,WangduiP,WealeME,XuY,XuZ,YangL,ZamanMJ,ZengC*,ZhangL,ZhangX,ZhaxiP,andZhengYT(2010).NaturalselectiononEPAS1(HIF2α)associatedwithlowhemoglobinconcentrationinTibetanhighlanders.PNAS,107(25):11459-11464.(*corresponding)
4、ZhangD,MaS,ZhangX,ZhaoH,DingH,andZengC(2010).PrevalentHBVpointmutationsandmutationcombinationsatBCP/preCregionandtheirassociationwithliverdiseaseprogression.BMCInfectDiseases,10:271(Highlyaccessed).
5、ChengF,ChenW,RichardsE,DengL,ZengC(2009).SNP@Evolution:ahierarchicaldatabaseofpositiveselectiononthehumangenome.BMCEvolBiol,9:221(Highlyaccessed).
6、DengL,ZhangY,KangJ,LiuT,ZhaoH,GaoY,LiC,PanH,TangX,WangD,NiuT,YangH,ZengC.(2008).CharacterizationofAnUnusualHaplotypeStructureonHumanChromosome8p23DerivedfromtheInversionPolymorphism.HumanMutat.,29(10):1209-16.
7、SunT,GaoY,TanW,MaS,ShiY,YaoJ,GuoY,YangM,ZhangX,ZhangQ,ZengC*&LinD*(2007).A6-nucleotideinsertion/deletionpolymorphisminthepromoterofCASPASE-8geneandsusceptibilitytomultipletypesofcancer.NatGenetics,39(5):605-613.(*corresponding)
8、ZengC.asoneprincipalinvestigatoroftheInternationalHapMapConsortium(2007).Asecondgenerationhumanhaplotypemapofover3.1millionSNPs.Nature,449:851-861.
9、ZengC.asoneprincipalinvestigatoroftheInternationalHapMapConsortium(2007).Genome-widedetectionandcharacterizationofpositiveselectioninhumanpopulations.Nature,449:913-918
10、SunT,GaoY,TanW,MaS,ZhangX,WangY,ZhangQ,Guo1Y,ZhaoD,ZengC*,LinD*(2006).HaplotypesinMatrixMetalloproteinaseGeneClusteronChromosome11q22ContributetotheRiskofLungCancerDevelopmentandProgression.Clin.CancerRes.,12:7009-7017(*corresponding)"

近5年(2009-13)承担科研项目:
1、科技部863课题,肿瘤的个体化RNA干扰治疗(2012AA022502),2012-2015,在研,主持。
2、科技部973课题,近视发生相关视觉信息处理异常的遗传因素研究(2011CB504604),2011-2015,398.3/697万,在研,主持。
3、科技部973课题,心脏间隔缺损发生中遗传机制研究(2010CB529502),在研,参加。
4、自然科学基金重点项目,全球不同高原人群低氧适应与进化的机制研究(91131905),2012-2015,在研,主持。
5、自然科学基金面上项目,应用改良染色体构象捕获策略确定HBV增强子在肝癌细胞对宿主基因的调节(81071649),2011-2013,在研,主持。
6、中科院重点部署项目,以通路分析和基因干扰等手段解析肿瘤的调控网络及其关键节点(KJZD-EW-L06-2),2013-2015,在研,主持。
7、自然科学基金重大专项,项目名称:中国人群若干群体的基因组多态性研究,课题名称:中国人遗传背景的基因组多态性组成研究(30890031),2009-2012,结题,主持项目及课题1。
8、科技部863课题,致病功能位点精细定位等全基因组关联分析扩展技术开发(2009AA022701),2009-2011,结题,子课题负责人。
9、科技部重大传染病专项课题,针对重要传染病原的突变图谱分析和个体内基因组多态或准种的检测(2009ZX10004-109),2009-2010,结题,参加。
10、科技部国际合作项目,藏族高血氧饱和度的遗传机制研究(2006DFA31850),2006-2009,结题,主持。
11、自然科学基金面上项目,有丝分裂器和胞质分裂环特异的新蛋白的鉴定及其功能研究(30671057),2007-2009,结题,主持。
12、中科院知识创新工程项目,通过致病基因的定位研究构建和验证‘中国型’的全基因组连锁分析的SNP标记位点(KSCX2-YW-R-72),2006-2009,结题,主持。"

研究组前身是国际HapMap计划中国卷的主要团队,负责HapMap计划具10%贡献的中国部分的实施和协调。2006年以来在完成HapMap的基础上,致力于用基因组和生物信息学手段回答生物学问题,特别是健康和疾病相关性状的遗传与表观遗传因素及其调控机制(见主要研究方向和最新成果)。研究组承担和完成了多个国家和中科院研究项目,包括科技部973和863课题,国家自然基金委重点项目等(见承担科研项目情况)。此外,研究组鼓励青年成员根据个人兴趣特长选取课题和进行项目申报。研究组已毕业博士和硕士研究生20余人,多名青年才俊在国内外研究和企业单位发挥着重要骨干作用。
研究组目前有科研人员9人,博后2名,研究生多名。除了常规分子、细胞生物学研究设备,还拥有荧光显微镜和扫描仪,低氧细胞培养工作站,IlluminaSNP分型设备和IonTorrent测序体系等先进仪器。同时,研究组收集和保存了大量细胞系和人群DNA样本。"

招收生物学、生物信息学、应用数学、医学或其他与遗传和基因组学相关专业的本科毕业生。原则上通过英语6级考试。



工作经历:
1985-1987北京师范大学生物学系讲师
1994-2000美国贝勒医学院生化与分子生物学系ResearchAssociate博士后
2000-2002美国德克萨斯大学休斯敦医学院综合生物学与药理学系助理教授
2002-2006北京华大基因研究中心研究员科研部部长
2003-2006北京师范大学特聘讲座教授
2003-中科院北京基因组研究所研究员
2010-中科院北京基因组研究所重大疾病和个体化医疗重点实验室主任


主要研究领域:
1)肿瘤基因组学和疾病基因组研究。包括应用高通量基因组学手段研究癌组织的基因突变和肿瘤基因表达,复杂性疾病的易感基因研究和单基因病的突变定位,乙肝病毒基因组突变等,同时进行相关的转化医学探索
2)藏族高原适应性的遗传基础和重要功能基因的功能研究。包括人群遗传多态研究,选择信号的发现和验证,低氧应答和细胞周期相关基因或基因产物的功能和调控研究等。


承担科研项目情况:
近5年(2009-13)承担科研项目:
1、科技部863课题,肿瘤的个体化RNA干扰治疗(2012AA022502),2012-2015,在研,主持。
2、科技部973课题,近视发生相关视觉信息处理异常的遗传因素研究(2011CB504604),2011-2015,398.3/697万,在研,主持。
3、科技部973课题,心脏间隔缺损发生中遗传机制研究(2010CB529502),在研,参加。
4、自然科学基金重点项目,全球不同高原人群低氧适应与进化的机制研究(91131905),2012-2015,在研,主持。
5、自然科学基金面上项目,应用改良染色体构象捕获策略确定HBV增强子在肝癌细胞对宿主基因的调节(81071649),2011-2013,在研,主持。
6、中科院重点部署项目,以通路分析和基因干扰等手段解析肿瘤的调控网络及其关键节点(KJZD-EW-L06-2),2013-2015,在研,主持。
7、自然科学基金重大专项,项目名称:中国人群若干群体的基因组多态性研究,课题名称:中国人遗传背景的基因组多态性组成研究(30890031),2009-2012,结题,主持项目及课题1。
8、科技部863课题,致病功能位点精细定位等全基因组关联分析扩展技术开发(2009AA022701),2009-2011,结题,子课题负责人。
9、科技部重大传染病专项课题,针对重要传染病原的突变图谱分析和个体内基因组多态或准种的检测(2009ZX10004-109),2009-2010,结题,参加。
10、科技部国际合作项目,藏族高血氧饱和度的遗传机制研究(2006DFA31850),2006-2009,结题,主持。
11、自然科学基金面上项目,有丝分裂器和胞质分裂环特异的新蛋白的鉴定及其功能研究(30671057),2007-2009,结题,主持。
12、中科院知识创新工程项目,通过致病基因的定位研究构建和验证‘中国型’的全基因组连锁分析的SNP标记位点(KSCX2-YW-R-72),2006-2009,结题,主持。"


代表论著:
10篇代表性论文
1、YangJ,ChenY,LiX,WeiX,ChenX,ZhangL,ZhangY,XuQ,WangH,LiY,LuC,ChenW,ZengC*,YinT*(2013).InfluenceofCYP2C9andVKORC1genotypesontheriskofhemorrhagiccomplicationsinwarfarin-treatedpatients:asystematicreviewandmeta-analysis.IntJCardiol.168:4234–4243.(*corresponding)
2、ChengF,ZhangX,ZhangY,LiC,ZengC.Haplo2Ped:atoolusinghaplotypesasmarkersforlinkageanalysis(2011).BMCBioinformatics,12:350(Highlyaccessed).
3、BeallCM,CavalleriGL,DengL,ElstonRC,GaoY,KnightJ,LiC,LiJC,LiangY,McCormackM,MontgomeryHE,PanH,RobbinsRA*,ShiannaKV,TamSC,TseringN,VeeramahK,WangW,WangduiP,WealeME,XuY,XuZ,YangL,ZamanMJ,ZengC*,ZhangL,ZhangX,ZhaxiP,andZhengYT(2010).NaturalselectiononEPAS1(HIF2α)associatedwithlowhemoglobinconcentrationinTibetanhighlanders.PNAS,107(25):11459-11464.(*corresponding)
4、ZhangD,MaS,ZhangX,ZhaoH,DingH,andZengC(2010).PrevalentHBVpointmutationsandmutationcombinationsatBCP/preCregionandtheirassociationwithliverdiseaseprogression.BMCInfectDiseases,10:271(Highlyaccessed).
5、ChengF,ChenW,RichardsE,DengL,ZengC(2009).SNP@Evolution:ahierarchicaldatabaseofpositiveselectiononthehumangenome.BMCEvolBiol,9:221(Highlyaccessed).
6、DengL,ZhangY,KangJ,LiuT,ZhaoH,GaoY,LiC,PanH,TangX,WangD,NiuT,YangH,ZengC.(2008).CharacterizationofAnUnusualHaplotypeStructureonHumanChromosome8p23DerivedfromtheInversionPolymorphism.HumanMutat.,29(10):1209-16.
7、SunT,GaoY,TanW,MaS,ShiY,YaoJ,GuoY,YangM,ZhangX,ZhangQ,ZengC*&LinD*(2007).A6-nucleotideinsertion/deletionpolymorphisminthepromoterofCASPASE-8geneandsusceptibilitytomultipletypesofcancer.NatGenetics,39(5):605-613.(*corresponding)
8、ZengC.asoneprincipalinvestigatoroftheInternationalHapMapConsortium(2007).Asecondgenerationhumanhaplotypemapofover3.1millionSNPs.Nature,449:851-861.
9、ZengC.asoneprincipalinvestigatoroftheInternationalHapMapConsortium(2007).Genome-widedetectionandcharacterizationofpositiveselectioninhumanpopulations.Nature,449:913-918
10、SunT,GaoY,TanW,MaS,ZhangX,WangY,ZhangQ,Guo1Y,ZhaoD,ZengC*,LinD*(2006).HaplotypesinMatrixMetalloproteinaseGeneClusteronChromosome11q22ContributetotheRiskofLungCancerDevelopmentandProgression.Clin.CancerRes.,12:7009-7017(*corresponding)"


社会任职:
2013-,TheGlobalAllianceinthefieldofhumangenomics,theRepresentativeoftheChineseAcademyofSciences(人类基因组全球联盟中科院代表);2012-,中国细胞生物学会染色体基因组和蛋白组学分会,副会长;2010-,第二届中国人类遗传资源管理专家组,成员;2002-06,TheInternationalHapMapConsortium,SteeringCommitteemember,RepresentativeoftheChineseHapMapConsortium;2002-06,中华单体型图协作组,负责和召集人"

获奖及荣誉:
1987获得CUSBEA奖学金
2002入选中国科学院“百人计划”
2002获得“国家杰出青年科学基金”
2003获ExcellenceinCreativity,LiFoundationHeritagePrize,theUnitedStates,美国李氏基金会“杰出成就奖”(个人)
2004入选“首批新世纪百千万人才工程国家级人选”
2007中国基础研究十大新闻“证实CASP8基因启动子的一个六核苷酸插入缺失多态与多种癌症易感性相关”(林东昕,曾长青)
2009朱李月华优秀教师奖
2011教育部自然科学奖一等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用”(排名4/16)
2012北京市科学技术奖二等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用”(排名4/16)"

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