王前飞(QianfeiWang)
博士生导师，“百人计划”研究员
E-Mail：wangqf@big.ac.cn
研究领域：基因组学生物信息学
导师简介：学习经历：
1988年9月-1993年7月山东医科大学临床医学专业医学学士学位1997年9月-2002年7月约翰斯霍普金斯大学细胞和分子医学专业理学博士学位
工作经历：
2002年9月-2006年12月加州大学伯克利分校博士后研究
2007年1月-2009年6月芝加哥大学研究助理教授
2009年7月-至今中国科学院北京基因组研究所研究员博士生导师
学术兼职：
中国医学科学院实验血液学国家重点实验室客座研究员；国家自然科学基金委员会第十三届和第十四届医学科学部血液系统专家评审组成员；
获奖及荣誉：
1997年TheAmericanAcademyofAllergy,AsthmaandImmunologyTravelAward2005年AmericanHeartAssociation:YoungInvestigatorForum大会发言荣誉奖
2008年CancerResearchFoundationYoungInvestigatorAward
血液学和肿瘤基因组学
近期主要学术成果：
1.WangQF*,LiYJ,DongJF,LiB,KaberleinJJ,ZhangL,ArimuraFE,LuoRT,NiJ,HeFH,WuJ,MattisonR,ZhouJ,WangCZ,PrabhakarS,NobregaMAandThirmanMJ.*RegulationofMEIS1bydistalenhancerelementsinacuteleukemia.Leukemia.Acceptedarticlepreview11September2013;doi:10.1038/leu.2013.260(Correspondingauthors)
2.PingChen,JichengZhao,WangY,WangM,LongHZ,LiangD,HuangL,WenZQ,LiW,LiX,FengHL,ZhaoHY,ZhuP,LiM,WangQFandLiGH.H3.3activelymarksenhancersandprimesgenetranscriptionviaopeninghigher-orderedchromatin.GenesDevelopment.publishedonlineSeptember24,2013
3.XingCH,ChenQ,LiGL,ZhangLY,ZhengM,ZouZY,HouLF,WangQF,LiuXandGuoXB.MicrosomalEpoxideHydrolase(EPHX1)PolymorphismsareAssociatedwithAberrantPromoterMethylationofERCC3andHematotoxicityinBenzene-ExposedWorkers.EnvironmentalandMolecularMutagenesis.54:397-405,2013
4.JiHK,LiX,WangQFandNingY.DifferentialprincipalcomponentanalysisofCHIP-seq.PNAS.110(17)：6789-6794，2013
5.WeiYY,LiX,WangQFandJiHK.iASeq:integrativeanalysisofallele-specificityofprotein-DNAinteractionsinmultipleChIP-seqdatasets.BMCGenomics.13:681,2012
6.ZhangY,YanXM,SashidaG,ZhaoXH,RaoYL,GoyamaS,WhitmanSP,ZorkoN,BernotK,ConwayR,WitteD,WangQF,TenenDG,XiaoZJ,MarcucciG,MulloyJ,GrimesHL,CaligiuriMA,HuangG..Stresshematopoiesisrevealsabnormalcontrolofself-renewal,lineagebias,andmyeloiddifferentiationinMllpartialtandemduplication(Mll-PTD)hematopoieticstem/progenitorcells.Blood.120(5):1118-1129,2012
7.WangQF,WuG,MiSL,HeFH,WuJ,DongJF,LuoRT,MattisonR,KaberleinJJ,PrabhakarS,JiHK,ThirmanMJ.MLLFusionProteinsPreferentiallyRegulateaSubsetofWildTypeMLLTargetGenesintheLeukemicGenome.Blood.2011Jun23;117(25):6895-905.Epub2011Apr25.
8.XingC*,WangQF*,LiB,TianH,NiY,YinS,LiG.Methylationandexpressionanalysisoftumorsuppressorgenesp15andp16inbenzenepoisoning.Chemico-BiologicalInteractions,184:306-9,2010(Correspondingauthors)
9.LiXM,WangQF,SchofieldB,LinJ,HuangSK,WangQ.Modulationofantigen-inducedanaphylaxisinmicebyatraditionalChinesemedicineformula,guominkang.AmJChinMed,37(1):113-25,2009
10.WangCZ,LiXL,WangQF,MehendaleSR,FishbeinAB,HanAH,SunS,YuanCS.ThemitochondrialpathwayisinvolvedinAmericanginseng-inducedapoptosisofSW-480coloncancercells.OncologyReports,21(3):577-84,2009
11.WangQF*,PrabhakarS,ChananS,ChengJF,RubinEM,BoffelliD*.DetectionofWeaklyConservedAncestralMammalianRegulatorySequencesbyPrimateComparisons.GenomeBiology.8(1):R1,2007(Correspondingauthors)
12.WangQF,PrabhakarS,WangQ,MosesA,ChananS,BrownM,EisenM,ChengJF,RubinE,BoffelliD.Primate-SpecificEvolutionofanLDLREnhancer.GenomeBiology.7(8):R68,2006
13.WangQF,Liu,X.,O’nell,J.,Peng,Z.,Krauss,R.,RainwaterD.L,VandebergJ.L,Rubin,E.M.,Cheng,J.F.,andPennacchio,L.A.HaplotypesintheAPOA1-C3-A4-A5GeneClusteraffectPlasmaLipidsinbothHumansandBaboons.HumanMolecularGenetics.13(10):149-1056,2004
14.R.G.Cleaves,WangQF,andA.D.Friedman.C/EBPalphap30,amyeloidleukemiaoncoprotein,limitsG-CSFreceptorexpressionbutnotterminalgranulopoiesisviasite-selectiveinhibitionofC/EBPDNA-binding.Oncogene,23(3):716-725,2004
15.FriedmanAD,KeeferJR,KummalueT,LiuH,WangQF,CleavesR.RegulationofgranulocyteandmonocytedifferentiationbyCCAAT/enhancerbindingproteinalpha.BloodCellsMolDis.31(3):338-41,2003
16.WangQF,R.G.Cleaves,andA.D.Friedman.CellcycleinhibitionmediatedbytheoutersurfaceoftheC/EBPalphabasicregionisrequiredbutnotsufficientforgranulopoiesis.Oncogene,22(17):2548-57,2003
17.H.T.Liu,J.R.Keefer,WangQF,andA.D.Friedman.ReciprocaleffectsofC/EBPαandPKCδonJunBexpressionandmonocyticdifferentiationdependupontheC/EBPαbasicregion.Blood,101(10):3885-92,2003
18.WangQF,A.D.Friedman.C/EBPsarerequiredforgranulopoiesisindependentoftheirinductionofthegranulocyte-colonystimulatingfactorreceptor.Blood,99(8):2776-85,2002
19.WangQF,J.Lauring,andM.S.Schlissel.c-MybbindstoasequenceintheproximalregionoftheRAG-2promoterandisessentialforpromoteractivityinT-lineagecells.MolecularandCellularBiology.20:9203-11,2000
20.XM.Li,BH.Schofield,WangQF,KH.Kim,SK.Huang.Inductionofpulmonaryallergicresponsesbyantigen-specificTh2cells.JournalofImmunology.160(3):1378-84,1998
1、中科院，中科院“百人择优”，2010年1月-2013年12月，在研，负责人；
2、国家自然科学基金，项目号81070442，急性白血病中远程增强子介导的MEIS1基因的转录调控，2011年1月-2013年12月，在研，负责人；
3、中国科学院战略性先导科技专项，项目号XDA01010305，血液细胞谱系建立的转录调控研究，2011年1月-2015年12月，在研，子课题负责人；
4、国家自然科学基金，项目号91331111，药物干预下选择肿瘤细胞增殖的基因组变异与进化规律，2014年1月-2016年12月，负责人；
5、973计划，项目号2014CB542000，肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究，2014年1月-2018年12月，课题负责人。
急性白血病是常见的血液恶性肿瘤。由于白血病细胞分化受阻增殖失控,致使恶性细胞在体内积累。儿童和20岁以下的成人中，急性白血病的死亡率超过其他任何一种癌症。急性白血病的发病率大约为2176/10万人，其中急性髓系细胞白血病占全部急性白血病的70％左右。尽管白血病治疗在近20年来已经取得很大进展，各种化疗以及干细胞移植等治疗方案已经取得疗效，但是急性髓系细胞白血病总存活率仍然低于30%。基因表达紊乱不仅是人类急性白血病的重要特征之一，也是该病发生发展的必要因素。然而，目前对血癌基因组中异常的基因控制通路还知之甚少。本项目组主要致力于血细胞发育的遗传学和表观遗传学分子机理的研究，探讨基因转录调控网络对血细胞发育和白血病发生发展的决定性作用。研究组综合运用生物化学、细胞和分子生物学技术，以及强大的基因组学技术平台，解读基因组学海量的原始数据，并由此加深对人类癌症的理论认识，为设计分子手段治疗血癌提供可能的靶点。
目前的研究工作主要有三个方面：
（1）造血干祖细胞的生成和分化的调控机理；
（2）急性白血病发生的转录调控和表观遗传学机理；
（3）基因组的遗传变异诱发急性白血病的机理。 研究组与美国辛辛那提儿童医院医学研究中心黄刚实验室（http://www.cincinnatichildrens.org/research/div/exp-hematology/fs/fac/greg-huang.htm）以及约翰霍普金斯大学公共卫生学院生物统计学系计宏凯博士（http://www.biostat.jhsph.edu/~hji/）领导的小组合作，综合运用遗传学、细胞分子生物学以及基因组学、生物信息学、数学和统计学的方法手段开展癌症致病机理研究。通过对ChIP-chip、ChIP-seq、转录组等大规模数据分析结合小鼠模型的体内功能实验，探讨急性白血病的发病机制和分子遗传基础。与国际实验室的合作不仅可以充分利用专业的优势互补进行科学研究，而且更有利于研究生受到国内、外两种培养模式的双重教育，为以后的个人发展做好铺垫。
招收生物学、医学、计算机学、数学背景学生
工作经历：
2002年9月-2006年12月加州大学伯克利分校博士后研究
2007年1月-2009年6月芝加哥大学研究助理教授
2009年7月-至今中国科学院北京基因组研究所研究员博士生导师
主要研究领域：
血液学和肿瘤基因组学
承担科研项目情况：
1、中科院，中科院“百人择优”，2010年1月-2013年12月，在研，负责人；
2、国家自然科学基金，项目号81070442，急性白血病中远程增强子介导的MEIS1基因的转录调控，2011年1月-2013年12月，在研，负责人；
3、中国科学院战略性先导科技专项，项目号XDA01010305，血液细胞谱系建立的转录调控研究，2011年1月-2015年12月，在研，子课题负责人；
4、国家自然科学基金，项目号91331111，药物干预下选择肿瘤细胞增殖的基因组变异与进化规律，2014年1月-2016年12月，负责人；
5、973计划，项目号2014CB542000，肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究，2014年1月-2018年12月，课题负责人。
代表论著：
1.WangQF*,LiYJ,DongJF,LiB,KaberleinJJ,ZhangL,ArimuraFE,LuoRT,NiJ,HeFH,WuJ,MattisonR,ZhouJ,WangCZ,PrabhakarS,NobregaMAandThirmanMJ.*RegulationofMEIS1bydistalenhancerelementsinacuteleukemia.Leukemia.Acceptedarticlepreview11September2013;doi:10.1038/leu.2013.260(Correspondingauthors)
2.PingChen,JichengZhao,WangY,WangM,LongHZ,LiangD,HuangL,WenZQ,LiW,LiX,FengHL,ZhaoHY,ZhuP,LiM,WangQFandLiGH.H3.3activelymarksenhancersandprimesgenetranscriptionviaopeninghigher-orderedchromatin.GenesDevelopment.publishedonlineSeptember24,2013
3.XingCH,ChenQ,LiGL,ZhangLY,ZhengM,ZouZY,HouLF,WangQF,LiuXandGuoXB.MicrosomalEpoxideHydrolase(EPHX1)PolymorphismsareAssociatedwithAberrantPromoterMethylationofERCC3andHematotoxicityinBenzene-ExposedWorkers.EnvironmentalandMolecularMutagenesis.54:397-405,2013
4.JiHK,LiX,WangQFandNingY.DifferentialprincipalcomponentanalysisofCHIP-seq.PNAS.110(17)：6789-6794，2013
5.WeiYY,LiX,WangQFandJiHK.iASeq:integrativeanalysisofallele-specificityofprotein-DNAinteractionsinmultipleChIP-seqdatasets.BMCGenomics.13:681,2012
6.ZhangY,YanXM,SashidaG,ZhaoXH,RaoYL,GoyamaS,WhitmanSP,ZorkoN,BernotK,ConwayR,WitteD,WangQF,TenenDG,XiaoZJ,MarcucciG,MulloyJ,GrimesHL,CaligiuriMA,HuangG..Stresshematopoiesisrevealsabnormalcontrolofself-renewal,lineagebias,andmyeloiddifferentiationinMllpartialtandemduplication(Mll-PTD)hematopoieticstem/progenitorcells.Blood.120(5):1118-1129,2012
7.WangQF,WuG,MiSL,HeFH,WuJ,DongJF,LuoRT,MattisonR,KaberleinJJ,PrabhakarS,JiHK,ThirmanMJ.MLLFusionProteinsPreferentiallyRegulateaSubsetofWildTypeMLLTargetGenesintheLeukemicGenome.Blood.2011Jun23;117(25):6895-905.Epub2011Apr25.
8.XingC*,WangQF*,LiB,TianH,NiY,YinS,LiG.Methylationandexpressionanalysisoftumorsuppressorgenesp15andp16inbenzenepoisoning.Chemico-BiologicalInteractions,184:306-9,2010(Correspondingauthors)
9.LiXM,WangQF,SchofieldB,LinJ,HuangSK,WangQ.Modulationofantigen-inducedanaphylaxisinmicebyatraditionalChinesemedicineformula,guominkang.AmJChinMed,37(1):113-25,2009
10.WangCZ,LiXL,WangQF,MehendaleSR,FishbeinAB,HanAH,SunS,YuanCS.ThemitochondrialpathwayisinvolvedinAmericanginseng-inducedapoptosisofSW-480coloncancercells.OncologyReports,21(3):577-84,2009
11.WangQF*,PrabhakarS,ChananS,ChengJF,RubinEM,BoffelliD*.DetectionofWeaklyConservedAncestralMammalianRegulatorySequencesbyPrimateComparisons.GenomeBiology.8(1):R1,2007(Correspondingauthors)
12.WangQF,PrabhakarS,WangQ,MosesA,ChananS,BrownM,EisenM,ChengJF,RubinE,BoffelliD.Primate-SpecificEvolutionofanLDLREnhancer.GenomeBiology.7(8):R68,2006
13.WangQF,Liu,X.,O’nell,J.,Peng,Z.,Krauss,R.,RainwaterD.L,VandebergJ.L,Rubin,E.M.,Cheng,J.F.,andPennacchio,L.A.HaplotypesintheAPOA1-C3-A4-A5GeneClusteraffectPlasmaLipidsinbothHumansandBaboons.HumanMolecularGenetics.13(10):149-1056,2004
14.R.G.Cleaves,WangQF,andA.D.Friedman.C/EBPalphap30,amyeloidleukemiaoncoprotein,limitsG-CSFreceptorexpressionbutnotterminalgranulopoiesisviasite-selectiveinhibitionofC/EBPDNA-binding.Oncogene,23(3):716-725,2004
15.FriedmanAD,KeeferJR,KummalueT,LiuH,WangQF,CleavesR.RegulationofgranulocyteandmonocytedifferentiationbyCCAAT/enhancerbindingproteinalpha.BloodCellsMolDis.31(3):338-41,2003
16.WangQF,R.G.Cleaves,andA.D.Friedman.CellcycleinhibitionmediatedbytheoutersurfaceoftheC/EBPalphabasicregionisrequiredbutnotsufficientforgranulopoiesis.Oncogene,22(17):2548-57,2003
17.H.T.Liu,J.R.Keefer,WangQF,andA.D.Friedman.ReciprocaleffectsofC/EBPαandPKCδonJunBexpressionandmonocyticdifferentiationdependupontheC/EBPαbasicregion.Blood,101(10):3885-92,2003
18.WangQF,A.D.Friedman.C/EBPsarerequiredforgranulopoiesisindependentoftheirinductionofthegranulocyte-colonystimulatingfactorreceptor.Blood,99(8):2776-85,2002
19.WangQF,J.Lauring,andM.S.Schlissel.c-MybbindstoasequenceintheproximalregionoftheRAG-2promoterandisessentialforpromoteractivityinT-lineagecells.MolecularandCellularBiology.20:9203-11,2000
20.XM.Li,BH.Schofield,WangQF,KH.Kim,SK.Huang.Inductionofpulmonaryallergicresponsesbyantigen-specificTh2cells.JournalofImmunology.160(3):1378-84,1998
社会任职：
中国医学科学院实验血液学国家重点实验室客座研究员；国家自然科学基金委员会第十三届和第十四届医学科学部血液系统专家评审组成员；
获奖及荣誉：
1997年TheAmericanAcademyofAllergy,AsthmaandImmunologyTravelAward2005年AmericanHeartAssociation:YoungInvestigatorForum大会发言荣誉奖
2008年CancerResearchFoundationYoungInvestigatorAward
