中国科学院北京基因组研究所研究生入学考试
《基因组学》考试大纲
一、 考试内容
1. 基因组导论
考试内容
l 基因组学的研究对象和发展历程
l 基因在DNA水平、RNA和蛋白质水平的定义
l 基因组的定义和基因组的分类
l 基因学研究的基本内容
l 基因组学研究的基本技术与方法
考试要求
l 了解基因组研究的基本对象、内涵和最新进展
l 了解基因的结构单元、功能单元和表型单元
l 了解基因组研究的基本方法：物理图谱的制作、DNA测序和注释
l 理解基因组组分变化的基本参数：GC含量、GC-skew、嘌呤含量
l 掌握基因组重复序列的分类（包括原核生物和真核生物）
2．遗传密码与基因组的进化
考试内容
l 遗传密码的发现
l 遗传密码的排列和内容导向的排列
l RNA世界假说
l 遗传密码的进化
l GC含量变化与密码子的动态关系
考试要求
l 记忆密码子表的密码子和氨基酸的排列
l 简述遗传密码中密码子排列的规律和基本关系
l 解释什么是RNA世界和了解细胞器的起源
l 举例解释密码子进化的假说
l 解释密码子或氨基酸变化与DNA组分动态变化的关系（原核生物基因组）
3．微生物基因组学
考试内容
l 真细菌基因组
l 古细菌基因组
l 极端环境微生物基因组
l 单细胞真核基因组
l 宏基因组
考试要求
l 全面了解真细菌基因组的结构和复制起始位点
l 全面了解古细菌基因组的结构和复制起始位点
l 了解细菌基因组的重复序列和极端环境微生物基因组的特点
l 全面了解横向转移的发生和对细菌基因组进化的意义
l 了解酵母基因组的大小和染色体的数量
4. 脊椎动物基因组学
考试内容
l 目前已经测定的脊椎动物基因组有哪些
l 灵长类基因组间的差异
l 哺乳动物Y染色体的进化
l 脊椎动物2R假说的内容和根据
l 脊椎动物基因数量的增加和基因大小的增加
考试要求
l 了解脊椎动物基因组中基因结构的特点
l 了解基因结构与重复序列的关系
l 列举种群特异的重复序列分类
l 了解脊椎动物基因组进化的基本动力
l 理解脊椎动物基因数量的概念
4. 节肢动物基因组
考试内容
l 昆虫基因组大小的变化范围和结构的特点
l 昆虫基因组重复序列与进化
l 节肢动物基因组结构与脊椎动物基因组的差异
l 昆虫基因组研究为模式生物研究提供了基本生物学基础
l 昆虫基因组研究与经典遗传学研究的关系
考试要求
l 了解昆虫基因组重复序列的种类
l 了解昆虫基因组大小的变化
l 节肢动物基因组研究的进展有哪些
l 以昆虫为模式的生物学研究内容有哪些
l 了解利用昆虫为模式的遗传学研究
5. 其他多细胞动物基因组和转录组研究
考试内容
l 线虫基因组
l 转录组研究
l 非编码RNA
l 小RNA的种类和定义
l 表观遗传学和甲基化
考试要求
l 了解线虫基因组和基因的结构特点
l 了解转录组研究的基本技术和方法
l 了解近年来非编码RNA和小RNA研究的进展
l 解释DNA甲基化和组蛋白修饰研究的方法
6. 植物基因组
考试内容
l 已经测序的植物基因组和植物基因组结构的特点
l 植物基因进化的原动力是基因组的重复（加倍）
l 植物基因组的共线性
l 杂交优势研究的理论
l 植物基因组研究的特点
考试要求
l 了解植物基因组结构的特点
l 熟悉植物基因组中的重复序列
l 植物基因组多倍体与基因组进化的关系
l 了解植物家养化过程中基因的变化
l 了解植物杂交优势的分子机理研究
l 了解植物基因组研究的最新进展（有哪些基因组的全序列是已知的）
7．人类基因能组研究
考试内容
l 人类基因组计划（理由、计划与实施）
l 人类基因组计划的后续工作
l 癌症和常见疾病的研究方法
l 全基因组关联性（Whole Genome Association）研究
l 人类基因组与灵长类基因组的基本差异
考试要求
l 了解人类基因组计划的历史
l 不同定义下人类基因组基因的数量
l 什么是SNP和HapMap计划
l 什么是全基因关联性研究和研究的基本方法
l 了解人类基因组研究的进展
8. 基因组研究技术与方法
考试内容
l 下一代基因组测序技术
l 基因测序技术的发展历史
l 发现和鉴定基因功能的方法
l 蛋白质组研究的基本方法和原理（如双向电泳和质谱）
l 蛋白质的功能域
考试要求
l 市场上有哪些“下一代”测序仪？
l 解释“下一代”测序仪的基本技术原理
l 了解基因标签的研究方法和数据分析原理
l 简述鉴定蛋白的基本方法
l 分析蛋白质功能域的方法
9. 基因组信息分析
考试内容
l 基因组信息研究与数据库
l 基因表达数据分析与数据库
l 基因的组装和重复序列识别
l 基因识别
l DNA序列的进化分析
考试要求
l 了解国际主要数据库（如Genbank）和常用工具（如blast）
l 了解EST、序列标签（尤其是新一代测序仪产生的数据）和芯片数据等数据库的基本内容
l 了解基因组序列组装的基本原理
l 了解基因识别软件和原理（包括真核与原核生物基因组）
l 掌握DNA序列进化研究的基本方法和常用软件
主要参考书目：
序号/书名/作者/出版社/备注
1）基因组III；T.A.布朗；袁建刚（译）；科学出版社。
2) 基因Ⅷ；本杰明·卢因；余龙、江松敏、赵寿元（译）；科学出版社。
