研究生导师介绍姓名：包其郁性别:男院系：检验医学院、生命科学学院行政职务：专业技术职称：教授任职年月：2002-现在从事专业1：遗传学从事专业2：临床检验诊断学导师类别：博士生导师(学术型)最后学历：最后学位：博士任硕导年月：2002任博导年月：2007是否院士：否是否国务院学科评议组成员：否毕业院校：中国科学院遗传与发育生物学研究毕业专业：071007遗传学毕业时间：办公电话：0577-86699398E-mail：baoqywzmc@yahoo.com.cn在职信息：在岗◇本人从事的主要研究方向的特点、意义及其水平:现带领的科研团队主要从事：（1）病原原核生物致病机理和耐药机理，质粒携带功能基因的多态性及其分子进化，耐药性基因的播散规律和分子流行病学，耐药性基因检测芯片，耐药性相关基因的结构和功能的关系等研究，进而筛选和开发具有潜在应用价值的药物；（2）进行基于基因组、转录组、小RNA为基础的螺旋藻抗逆机理的功能基因组学研究；（3）环境生物化学和生态毒理学研究。参加了“人类基因组计划”和“水稻基因组计划”，为第一作者完成了“腾冲嗜热厌氧菌全基因组分析”，该研究为国内首次获得了一张原核生物全基因组序列图谱，填补了我国在此研究领域的空白。◇学术团体任职情况:浙江省生物化学与分子生物学学会理事◇近五年在国内外核心期刊上发表学术论文情况:论文题目刊物名称刊物国家收录情况卷期排名SequenceAnalysisofpKF3-70inKlebsiellapneumoniae:ProbableOriginfromR100-likePlasmidofEscherichiacoli.PlosOne国外SCI2010，5(1)通讯作者proTF:acomprehensivedataandphylogenomicsresourceforprokaryotictranscriptionfactors.Bioinformatics国外SCI2010,26(19):2493-58MagicViewer:integratedsolutionfornext-generationsequencingdatavisualizationandgeneticvariationdetectionandannotationNucleicAcidsRes国外SCI2010Jul;38(WebServerissue):W732-67ExtensivehomologousrecombinationinthecoregenomeofRickettsia.ComparativeandFunctionalGenomics国外SCI2009：doi:10.1155/2009/510270通讯作者geneofPseudomonasaeruginosaanditsrolein{beta}-lactamaseexpression.AntimicroandChemotherapy国外SCI2010，54(11):4772-9并列第一作者SequencingandgeneticvariationofmultidrugresistanceplasmidsinclinicalsamplesPlosOne国外SCI2010,5(4):e10141通讯作者CodonUsagePatternsinCorynebacteriumglutamicum:MutationalBias,NaturalSelectionandAminoAcidConservation.CompFunctGenomics国外SCI2010:343569通讯作者FlyPhy:aphylogeneticanalysisplatformforDrosophilagenesandgenefamilies.BMCBioinformatics国外SCI2009,10:123通讯作者PGA4genomicsforcomparativegenomeassemblybasedongeneticalgorithmoptimization.Genomics国外SCI2009.06.0063PlasmoGF:anintegratedsystemforcomparativegenomicsandphylogeneticanalysisofPlasmodiumgenefamilies.Bioinformatics国外SCI2008,24(9):1217-20通讯作者Lineage-SpecificDomainFusionintheEvolutionofPurineNucleotideCyclasesinCyanobacteria.JMolEvol国外SCI2008Jul;67(1):85-94通讯作者CSCDB:thecAMPandcGMPsignalingcomponentsdatabase.Genomics国外SCI2008,92(1):60-4并列第一作者ArchaeaTF:AnintegrateddatabaseofputativetranscriptionfactorsinArchaea.Genomics国外SCI2008，91(1):102-107通讯作者cTFbase:adatabaseforcomparativegenomicsoftranscriptionfactorsincyanobacteria.BMCGenomics国外SCI2007,8:104通讯作者GeneticdistanceofSARScoronavirusfromtherecentnaturalcase.VetMicrobiol国外SCI2007,120(1-2):167-1724ACompleteSequenceoftheT.tengcongensisGenome.GenomeResearch国外SCI2002，12（5）：689-700.1CompletenucleotidesequenceofpBMB67,a67-kbplasmidfromBacillusthuringiensisstrainYBT-1520.Plasmid国外SCI2007,57(1):44-542Alithium-sensitiveandsodium-tolerant3'-phosphoadenosine-5'-phosphataseencodedbyhalAfromthecyanobacteriumArthrospiraplatensisiscloselyrelatedtoitscounterpartsfromyeastsandplants.ApplEnvironMicrobiol国外SCI2006,72(1):245-513Genome-wideanalysisofrestriction-modificationsysteminunicellularandfilamentouscyanobacteria.PhysiolGenomics国外SCI2006,24(3):181-90通讯作者Finishingtheeuchromaticsequenceofthehumangenome.Nature国外SCI2004,431:931-945参加ADraftSequenceoftheRiceGenome(OryzasativeL.ssp.indica).Science国外SCI2002，296：79－92.参加Initialsequencingandanalysisofthehumangenome.Nature国外SCI2001，409：860-921.参加◇出版专著教材情况(注：在书名后注明教材或专著):名称类别出版单位日期排名分子诊断学教材高教出版社2007-05-01参加◇成果获奖情况:成果名称颁奖部门等级完成日期证书号排名温州地区小二喉乳头状瘤病因学及临床治疗研究省部三等奖0503256第二肝病实验诊断项目分类方法的研究省部三等奖0203113-2第二小儿腹泻病原及其分子生物学研究省部三等奖994253第一中国科学院院长特别奖省部第一

◇近五完成的科研项目:项目名称任务来源完成形式完成日期鉴定验收单位主要结论排名人体内和细胞传代培养SARS病毒基因组的遗传变异研究论文国家自然基金会通过1螺旋藻全基因生物信息分析论文国家自然基金会通过1螺旋藻功能基因组及抗盐碱功能相关基因的研究论文浙江省自然科学基金会通过1农业微生物杀虫防病功能基因的发掘和分子机理研究论文国家937计划通过2疾病相关细菌耐药性基因检测芯片的制备论文浙江省科技厅通过1
◇目前承担的主要项目:项目名称及下达编号项目类别项目来源起讫时间科研经费(万元)本人承担任务病原菌耐药性基因芯片的制备2011.1-2011.1220承担螺旋藻抗逆功能基因的克隆及应用研究，2009C330402009-201130承担ampG基因结构和功能的多样性及其阻抑药物的筛选，H201000222010-201210承担高通量测序分析志贺氏菌质粒及其耐药基因2011.1-2011.1215承担高通量测序分析病原菌质粒携带的耐药新基因，811716142011-201456承担钝顶螺旋藻全基因组中与环境胁迫应答有关的sRNA的寻找及调控网络研究，310711152011-201333承担病原菌抗β-内酰胺类药物高度相关膜转运蛋白AmpG阻遏物的筛选2012-201430承担