研究生导师介绍姓名：孙中生性别:男院系：基因组医学研究院行政职务：院长专业技术职称：研究员任职年月：2007-09从事专业1：生物信息与统计学从事专业2：遗传学导师类别：博士生导师(学术型)最后学历：最后学位：博士任硕导年月：2008任博导年月：2010是否院士：否是否国务院学科评议组成员：否毕业院校：美国德克萨斯州A＆M大学毕业专业：毕业时间：1992办公电话：E-mail：zsunusa@yahoo.com在职信息：在岗◇本人从事的主要研究方向的特点、意义及其水平:发现了哺乳动物关键的生物钟基因—mPer1和mPer2，该发现揭示了哺乳动物生物钟的分子生物学基础，曾经被《Science》评为1997年度十大科学突破。到目前为止，发表的多篇生物学方面的研究论文，被他人引用了1400多次。近几年开始从事表观基因组学研究，成功预测了人类全基因组CpG岛，运用自主研发的9KCGI芯片对恶性肿瘤、出生缺陷等疾病进行了大规模的DNA甲基化修饰研究，得到了一些有意义的候选基因，运用9KCGI芯片和bisulfite测序对不同的甲基化DNA富集技术进行了系统的评价；并且开发了基于Solexa测序仪的高通量、高分辨率、低成本的全基因组甲基化DNA检测技术，开发了新一代高通量测序相关软件MagicViewer（http://bioinformatics.zj.cn/magicviewer/）、分析小RNA转录组的综合在线服务平台——mirTools（http://centre.bioinformatics.zj.cn/mirtools）等软件或数据库。◇学术团体任职情况:中科院“百人计划”获得者，现任中科院北京生命科学院◇近五年在国内外核心期刊上发表学术论文情况:论文题目刊物名称刊物国家收录情况卷期排名NonredundantrolesofthemPer1andmPer2genesinthemammaliancircadianclock.Cell国外SCI2001,105,683-694.第五mPer1andmPer2areessentialfornormalresettingofthecircadianclock.J.Bio.Rhym.国外SCI2001,100-104.通讯作者ThemPer2geneencodesafunctionalcomponentofthemammaliancircadianclock.Nature国外SCI1999,400,169-173.第四Adifferentialresponseoftwoputativemammaliancircadianregulators,mper1andmper2,tolight.Cell国外SCI1997,91(7)1055-1064.第一Rigui,aputatuivemammalianorthologofthedrosophilaperiodgene.Cell国外SCI1997,90(6),1003–1011第一DeficiencyofantinociceptionandexcessivegroominginducedbyacuteimmobilizationstressinPer1mutantmice.PlosOne国外SCI2011,Jan14;6(1):e16212通讯作者Systematicevaluationofgenome-widemethylatedDNAenrichmentusingaCpGislandarrayBMCGenomics国外SCI2011Jan6;12:10通讯作者CharacterizationofthesmallRNAtranscriptomesofandrogendependentandindependentprostatecancercelllinebydeepsequencingPlosOne国外SCI2010Nov30;5(11):e15519通讯作者RegulationofPeripheralClocktoOscillationofSubstancePContributestoCircadianInflammatoryPainAnesthesiology国外SCI2012,Jlu;117(1):149-160通讯作者Detection,annotationandvisualizationofalternativesplicingfromRNA-SeqdatawithSplicingViewerGenomics国外SCI2012,Mar;99(3):178-82通讯作者RRBS-Analyser:AComprehensiveWebServerforReducedRepresentationRRBS-Analyser:AComprehensiveWebServerforReducedRepresentationHumanMutation国外SCI2013Dec;34(12):1606-10通讯作者mirTools2.0fornon-codingRNAdiscovery,profiling,andfunctionalannotationbasedonhigh-throughputsequencingRNABiology国外SCI2013Jul;10(7):1087-92通讯作者MagicViewer:integratedsolutionfornext-generationsequencingdatavisualizationandgeneticvariationdetectionandannotation.NucleicAcidsRes.国外SCI2010May5.doi:10.1093/nar/gkq302通讯作者mirTools:microRNAprofilinganddiscoverybasedonhigh-throughputsequencing.NucleicAcidsRes.国外SCINucleicAcidsResearch通讯作者ExpressionProfilingRevealsaPositiveRegulationbymper2onCircadianRhythmofCytotoxicityReceptors:Ly49CandNkg2d.ChronobiologyInternational.国外SCI2009,26(8):1514-44.通讯作者TheAPP-interactingproteinFE65isrequiredforhippocampus-dependentlearningandlong-termpotentiation.Learning&memory国外SCI10.1101/lm.1499309通讯作者ConvergingsignalonERK1/2activityregulatesgroupImGluR-mediatedArctranscription.NeurosciLett.国外SCI2009,460(1):36-40.通讯作者AntinociceptivesynergisticeffectofspinalmGluR2/3antagonistandglialcellsinhibitoronperipheralinflammation-inducedmechanicalhypersensitivity.BrainResearchBulletin国外SCI2009,79(3-4):219-23.通讯作者ProteomicAnalysisofRatPrefrontalCortexinThreePhasesofMorphine-inducedConditionedPlacePreference.JournalofProteomeResearch国内SCI2007,6(6):2239-47.通讯作者ThecircadianclockPeriod2generegulatesgammainterferonproductionofNKcellsinhostresponsetolipopolysaccharide-inducedendotoxicshock.InfectImmun.国外SCI2006,74(8):4750-4756.通讯作者CircadianClockGenesoscillateinhumanperipheralbloodmononuclearcell.Blood国外SCI2003,102(12):4143-4146.通讯作者Multipleimmune-regulatorydefectsintype-1diabetes.J.Clin.Invest国外SCI2002,109,131-140第五MicroRNA-34ainhibitsmigrationandinvasionofcoloncancercellsviatargetingtoFra-1Carcinogenesis国外SCI2012Mar;33(3):519-28通讯作者Exome-assistant:arapidandeasydetectionofdisease-relatedgenesandgeneticvariationsfromexomesequencingBMCGenomics国外SCI2012Dec11;13:692通讯作者MutationsofANK3identifiedbyexomesequencingareassociatedwithautismsusceptibilityHumanMutation国外SCI2012Dec;33(12):1635-8通讯作者IdentificationofanovelCys146XmutationofSOD1infamilialamyotrophiclateralsclerosisbywhole-exomesequencingGeneticsinMedicine国外SCI2012Sep;14(9):823-6通讯作者◇出版专著教材情况(注：在书名后注明教材或专著):名称类别出版单位日期排名◇成果获奖情况:成果名称颁奖部门等级完成日期证书号排名

◇近五完成的科研项目:项目名称任务来源完成形式完成日期鉴定验收单位主要结论排名
◇目前承担的主要项目:项目名称及下达编号项目类别项目来源起讫时间科研经费(万元)本人承担任务863项目：癌症基因组研究——以新一代测序技术研究癌症，课题名称：甲状腺癌组织样本和临床相关信息的收集。下达编号2006AA02A3022009年1月1日到2012年12月31日341课题负责人横向课题：人类遗传资源平台建设2009年1月1日到2012年12月31日350项目负责人表观基因组、转录组技术平台的搭建和优化。项目编号：2012AA02A2022012年到2015年225项目负责人食物诱导节律的产生及雌激素在其产生中的作用2013年1月到2016年12月85项目负责人浙江省自然科学基金重点项目：基于solexa测序的全基因组DNA甲基化检测方法的研发2011年1月1日到2014年12月31日30项目负责人