本系前身是于1954年成立的、以周同庆教授（我国著名光谱学家，中科院学部委员）为主任的光学教研室。教研室于1964年研制出He-Ne等多种气体激光器后，积极开展各类激光器和相关元器件、激光技术和应用及光物理等研究工作，研究队伍迅速扩大。1978年成立以章志鸣教授为主任的激光物理和光学研究室，1981年批准成为光学硕士点。 1984年被批准为光学博士点，1988年批准为国家级重点学科，同年建立三束材料改性国家重点联合实验室复旦分部。在1988年的光学学科点评估和1993年的博士点评估中，本学科排列全国高校光学专业的第一，并于1990年荣获国家科委和教委共同颁发的“全国高等学校科学研究先进集体”称号。1996年被确立为“211工程”重点建设学科。2000年9月该学科点大部与陈良尧教授研究组合并，成立“复旦大学光科学与工程系”。

全系現有教师27人，技术及管理人员7人。在27名教师中，教授12人（其中院士2人，博士生导师7人），副教授14人。在全体教师队伍中，具有博士学位的教师为20名，占全体教师人数的74%。教师队伍的年龄结构比较合理，12位教授中，61岁以上为3人（其中2位为院士）51-60岁之间为4人，41-50岁之间为1人，40岁以下为5人。在14位副教授中，绝大多数为40岁以下的年轻教师。

我系从2000年至2003年共获得研究经费人民币1330万元，其中2000年为316万元，2001年为330万元，2002年为448万元，2003年为236万元。从发表论文来看，从2000年至2003年我系在SCI刊物上发表论文93篇，其中 2000年为33篇，2001年为21篇，2002年为18篇，2003年为21篇（至2003年11月30日统计）。这四年中，我系获国家批准的发明专利5项，另外被国家接受申请的发明专利为10项。