摘要： 【目的】在全基因组水平鉴定、分类和命名中华按蚊Anopheles sinensis有机阳离子转运体(organic cation transporter, OCT)家族基因，为昆虫OCT基因提供信息框架。【方法】从NCBI, VectorBase和EMBL数据库下载冈比亚按蚊An. gambiae、黑腹果蝇Drosophila melanogaster和秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans已知的OCT氨基酸序列作为询问序列，基于中华按蚊基因组与转录组测序数据，通过本地Blast搜索鉴定中华按蚊基因组上OCT基因；运用生物信息学方法预测中华按蚊OCT基因的基因结构、Scaffold定位和保守基序等特征，通过最大似然法构建中华按蚊OCT基因的系统发育树。【结果】中华按蚊共有54个OCT家族基因，分属于OCTA, OCTB和OCTC 3个亚家族，分别有33, 15和6个基因。除AsOCTA20和AsOCTB2外，其余OCT基因编码的氨基酸序列均具有MFS_1和Sugar_tr跨膜结构域(transmembrane domain, TMD)，大多数OCT氨基酸序列有12个TMD。所有OCT氨基酸序列都有GRK-(PT)-VL， PES-(APVS)和EQFPT-(VI)-RN 3个保守基序，各亚家族还有各自的保守基序。4对基因(AsOCTB4a和AsOCTB4b, AsOCTA10a和AsOCTA10b, AsOCTA19a和AsOCTA19b,以及AsOCTA23a和AsOCTA23b)源自基因重复事件。AsOCTC基因较为原始，AsOCTB基因较为进化，都是明显的单系; AsOCTA基因介于两者之间，进化关系较为复杂。【结论】本研究丰富了中华按蚊基因组数据，为后续中华按蚊OCT基因功能特别是杀虫剂抗性机制方面的功能研究奠定了基础。
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中华按蚊OCT家族基因的多样性及序列特征
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
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