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北京协和医学院药用植物研究所导师信息简介列表(4)
本站小编 免费考研网/2020-05-10
技进步一等奖和中华中医药学会自然科学一等奖各1项(均为第三完成人)。
主要研究方向:中药分子鉴定;重要药用植物有效成分生物合成途径关键酶基因的克隆、鉴定。
[1] Ma SJ#, Lv QD#, Zhou H, Fang J, Cheng WL, Jiang CX, Cheng KJ*, Yao, H*. Identification of Traditional She Medicine Shi-Liang Tea Species and Closely Related Species Using the ITS2 Barcode. Applied Sciences, 2017, 7(3): 195.
[2] Yang P, Zhou H, Qian J, Xu HB, Shao QS, Li YH, Yao H*. The complete chloroplast genome sequence of Dendrobium officinale. Mitochondrial DNA Part A, 2016, 27(2): 1262–1264.
[3] Yu H#, Wu KY#, Song JY, Zhu YJ, Yao Hui*, Luo K, Dai Y, Xu SJ, Lin Yulin*. Expedient identification of Magnoliaceae species by DNA barcoding. Plant Omics, 2014, 7(1): 47-53.
[4] Chen SL#*, Pang XH#, Song JY*, Shi LC, Yao H, Han J, Leon C. A renaissance in herbal medicine identification: From morphology to DNA. Biotechnology Advances, 2014, 32(7): 1237-1244.
[5] Hou D, Song JY, Shi LC, Ma XY, Xin TY, Han JP, Xiao W, Sun ZY, Cheng RY, Yao H*. Stability and Accuracy Assessment of Identification of Traditional Chinese Materia Medica Using DNA Barcoding: A Case Study on Flos Lonicerae Japonicae. BioMed Research International, 2013: 549037.
[6] Yao H#, Song Y#, Liu C#, Luo K, Han JP, Li Y, Pang XH, Xu HX, Zhu YJ*, Xiao PG, Chen SL*. Use of ITS2 Region as the Universal DNA Barcode for Plants and Animals. PLoS ONE, 2010, 5(10): e13102.
[7] Chen SL*, Yao H, Han JP, Liu C, Song JY*, Shi LC, Zhu YJ, Ma XY, Gao T, Pang XH, Luo K, Li Y, Li XW, Jia XC, Lin YL, Leon C. Validation of the ITS2 Region as a Novel DNA Barcode for Identifying Medicinal Plant Species. PLoS ONE, 2010, 5(1): e8613.
[8] 姚辉,杨培, 周红, 马双姣, 宋经元, 陈士林*. 基于叶绿体psbK-psbI序列的石斛属药用植物鉴定. 药学学报,2015,50 (6):783 ?787.
[9] 陈士林*,姚辉,韩建萍,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直. 中药材DNA条形码分子鉴定指导原则. 中国中药杂志,2013,38(2):141-148.
[10] 朱英杰,陈士林,姚辉*,谭睿*,宋经元,罗焜,鲁静. 重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究. 药学学报,2010,45(3):376-385.
宋经元 博士
博士、药用植物鉴定研究中心副主任
宋经元男,湖北当阳人,生于1969年12月,博士,研究员,博士生导师
现任中国医学科学院药用植物研究所中药鉴定中心副主任,中国医学科学院药用植物研究所云南分所、重庆分所副所长,教育部“中药资源工程研究中心”主任,中国医学科学院“本草基因组协同创新团队”首席专家。担任国家自然科学基金、科技部重点研发计划等评审专家。承担国家自然科学基金面上和重点项目、国家重大新药创制、科技部十二五支撑计划、863计划、“濒危药材繁育”国家工程实验室建设、国家中药标准化项目等。任《药学学报》等5种期刊编委,Mol Plant、
Biotechnol Adv、APSB等期刊审稿专家,中国野生植物保护协会药用植物保育委员会秘书长和副主任委员、中国质量协会中药分会副会长。
学科专业:中药学、生药学
研究方向:药用植物功能基因组、结构基因组与生物信息分析、细胞培养与活性成分生产调控、中药DNA条形码鉴定。
学习经历
1987.09-1991.07 中国农业大学(原北京农业大学)植物生理生化 学士
1995.09-1998.07北京协和医学院(原中国协和医科大学)生药学 硕士
1999.09-2002.07北京协和医学院(原中国协和医科大学)生药学 博士
工作经历
1991.07-至今 中国医学科学院药用植物研究所
2004.06-2006.08 美国北卡州立大学木本植物功能基因组学 博士后
2016.11-2017.04 美国哈佛医学院 基因组编辑 高级研究学者(CSC资助)
人才项目和荣誉
国家百千万人才工程2019
国家人力资源和社会保障部突出贡献中青年专家2019
中共中央 国务院 中央军委 庆祝中华人民共和国成立70周年纪念章2019
国务院政府特殊津贴2019
国家卫生计生委突出贡献中青年专家2017
北京协和医学院优秀教师2015
北京市科技新星2003
主要业绩
参加工作以来,一直专注于利用现代生命科学技术研究中草药,在中药学科建设、人才培养等方面开展创新性研究。
作为主创人,在国际上提出并验证核基因组序列ITS2作为植物通用DNA条形码理论,创建了“本草基因组学”学科及中草药DNA条形码鉴定技术。该技术列入《中国药典》指导原则,并被国家检验检疫、公安部、中药企业等应用。研究成果入选2016中国十大医学进展;“本草基因组学”列为普通高等教育十三五规划教材,该课程2018年评为北京协和医学院精品建设课程。
负责的本草基因组协同创新团队,已搭建基因资源获取、生物信息分析、基因功能验证软硬件系统,成为支撑本草基因资源保护和中药研发原创的重要平台。
获国家科技进步二等奖1项、省部级一等奖3项、省部级三等奖2项。培养的研究生8人次获得国家奖学金、北京市和北京协和医学院优秀毕业生称号。
代表性论文:(#并列第一作者,*通讯作者)
1. Pu X, Li Z, Tian Y, Gao R, Hao L, Hu Y, He C, Sun W, Xu M, Peters RJ, Van de Peer Y, Xu Z*, Song Jingyuan*. The honeysuckle genome provides insight into the molecular mechanism of carotenoid metabolism underlying dynamic flower coloration.New Phytologist. 2020, doi: 10.1111/nph.16552.
2. Zhang Y, Ji A, Xu Z, Luo H, Song Jingyuan*. The AP2/ERF transcription factor SmERF128 positively regulates diterpenoid biosynthesis in Salvia miltiorrhiza. Plant Molecular Biology. 2019, 100: 83–93.(封面文章)
3. Xu Z, Xin T, Bartels D, Li Y, Gu W, Yao H, Liu S, Yu H, Pu X, Zhou J, Xu J, Xi C, Lei H, Song Jingyuan*, Chen S*. Genome analysis of the ancient tracheophyte Selaginella tamariscina reveals evolutionary features relevant to the acquisition of desiccation tolerance. Molecular Plant. 2018, 11(7): 983-994. (Spotlight评述)
4. Xin T, Xu Z, Jia J, Leon C, Hu S, Lin Y, Ragupathy S, Song Jingyuan*, Newmaster SG*. Biomonitoring for traditional herbal medicinal products using DNA metabarcoding and single molecule, real-time sequencing. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2018, 8(3): 488-497.
5. Huang X#, Zhou G#, Wu W#, Duan Y, Ma G, Song Jingyuan, Xiao R, Vandenberghe L, Zhang F, D'Amore PA, Lei H*. Genome editing abrogates angiogenesis in vivo. Nature Communications. 2017, 8(1): 112.
6. Xu Z, Song Jingyuan*. The 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase superfamily participates in tanshinone production of Salvia miltiorrhiza. Journal of Experimental Botany. 2017, 68(9): 2299-2308.
7. Chen SL*, Song Jingyuan, Sun C, Xu J, Zhu YJ, Verpoorte R, Fan TP*. Herbal genomics: Examining the biology of traditional medicines. Science. 2015, 347(6219 Suppl): S27-S29.
8. Xu Z#, Peters RJ#, Weirather J, Luo H, Liao B, Zhang X, Zhu Y, Ji A, Zhang B, Hu S, Au KF, Song Jingyuan*, Chen S*. Full-length transcriptome sequences and splice variants obtained by a combination of sequencing platforms applied to different root tissues of Salvia miltiorrhiza and tanshinone biosynthesis. Plant Journal. 2015, 82(6): 951-961.
9. Li QS, Li Y, Song Jingyuan*, Xu H, Xu J, Zhu Y, Li X, Gao H, Dong L, Qian J, Sun C, Chen S*. High-accuracy de novo assembly and SNP detection of chloroplast genomes using a SMRT circular consensus sequencing strategy. New Phytologist. 2014, 204(4): 1041-1049.
10. Chen S*#, Pang X#, Song Jingyuan*, Shi L, Yao H, Han J, Leon C. A renaissance in herbal medicine identification: From morphology to DNA. Biotechnology Advances. 2014, 32(7): 1237-1244.
11. 贠凯祎, 徐志超, 宋经元*. 含马兜铃酸中药及其检测研究进展. 中国科学: 生命科学. 2019, 49 (3): 238 -249.
12. 贠凯祎, 向丽, 王晓玥, 刘杨, 姚辉, 宋经元*. 基于便携式和CFX96实时荧光PCR仪的冬虫夏草及其混伪品鉴定研究. 药学学报.2019, 54(4): 746 -752.
13. 浦香东,徐志超,宋经元*. 基于组学的丹参酮生物合成途径新基因CYP71D375克隆和功能研究. 中国科学:生命科学. 2018, 48(4): 390-398.
14.辛天怡,李西文,姚辉,韩建萍,宋经元*,陈士林*. 中药材二维DNA条形码流通监管体系研究. 中国科学:生命科学. 2015, 45(7): 695-702.
15.季爱加, 罗红梅, 徐志超, 张鑫, 宋经元*,陈士林*. 药用植物转录因子AP2/ERF研究与展望. 科学通报. 2015, 60(14): 1272-1284.
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