钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选

马璐琳^1,2,*, 段青^1,*, 崔光芬¹, 杜文文¹, 贾文杰¹, 王祥宁¹, 王继华^1,**(), 陈发棣^2,**()

¹云南省农业科学院花卉研究所,云南省花卉育种重点实验室,国家观赏园艺工程技术研究中心,昆明 650205
²南京农业大学园艺学院,南京 210095

收稿日期:2020-09-27修回日期:2020-12-10出版日期:2021-02-25发布日期:2021-03-09
通讯作者:王继华,陈发棣E-mail:wangjh0505@sohu.com;chenfd@njau.edu.cn

基金资助:国家自然科学基金项目(31960612);云南省农业科学院应用基础研究重点项目(YJZ201701);云南省科技领军人才计划项目(2016HA005);云南省现代农业花卉苗木产业技术体系建设项目(2017KJTX0010);云南省重大科技专项计划项目(2019ZG006)

Selection and Validation of Reference Genes for qRT-PCR Analysis of the Correlated Genes in Flower Pigments Biosynthesis Pathway of Anemone obtusiloba

MA Lulin^1,2,*, DUAN Qing^1,*, CUI Guangfen¹, DU Wenwen¹, JIA Wenjie¹, WANG Xiangning¹, WANG Jihua^1,**(), CHEN Fadi^2,**()

¹Flower Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Yunnan Flower Breeding Key Lab,National Engineering Research Center for Ornamental Horticulture,Kunming 650205,China
²College Horticulture of Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China

Received:2020-09-27Revised:2020-12-10Online:2021-02-25Published:2021-03-09
Contact:WANG Jihua,CHEN Fadi E-mail:wangjh0505@sohu.com;chenfd@njau.edu.cn

摘要/Abstract

摘要： 为了筛选适合于钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中相关基因qRT-PCR表达分析时的内参基因,根据钝裂银莲花蓝/白不同花色花器官组织的转录组测序结果,选取了多聚泛素酶基因（polyubiquitin,UBQ）、微管蛋白基因（β-tubulin,β-TUB）、水通道蛋白基因（aquaporin,AQP）、肌动蛋白基因（actin,ACT）、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶基因（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH）、组蛋白基因（histone,HIS）、转录延伸因子基因（elongation factor 1-β,EF-1β）和60S核糖体蛋白基因（60S ribosomal protein L13-1,RPL13）等8个常用内参基因作为候选基因,以钝裂银莲花的叶片、茎杆和蓝/白色花器官等不同组织为试验材料,通过qRT-PCR检测这8个候选内参基因的表达情况,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper等软件对其稳定性进行分析评价。结果表明：8个候选内参基因中,UBQ表现最稳定,而β-TUB相对稳定性最差。以最稳定的UBQ为内参对钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中16个相关基因表达情况进行qRT-PCR分析,结果与前期转录组测序结果一致。UBQ为钝裂银莲花花色素合成途径相关基因表达分析的最适内参基因。
中图分类号:
S682

引用本文

马璐琳, 段青, 崔光芬, 杜文文, 贾文杰, 王祥宁, 王继华, 陈发棣. 钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选[J]. 园艺学报, 2021, 48(2): 377-388.
MA Lulin, DUAN Qing, CUI Guangfen, DU Wenwen, JIA Wenjie, WANG Xiangning, WANG Jihua, CHEN Fadi. Selection and Validation of Reference Genes for qRT-PCR Analysis of the Correlated Genes in Flower Pigments Biosynthesis Pathway of Anemone obtusiloba[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(2): 377-388.





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