草莓白化相关病毒中国分离物全基因组分析

陈道, 张洁, 吴祖建, 丁新伦^*()

福建农林大学植物病毒研究所,闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室,福建省植物病毒重点实验室,福州 350002

收稿日期:2020-09-13修回日期:2020-12-11出版日期:2021-01-25发布日期:2021-01-29
通讯作者:丁新伦E-mail:dingxinlun@163.com

基金资助:福建省自然科学基金项目(2019J01656);福建农林大学科技创新专项(CXZX2016132);福建农林大学科技创新专项(CXZX2019018G)

Genome Sequence of Strawberry Pallidosis-associated Virus Isolated in China

CHEN Dao, ZHANG Jie, WU Zujian, DING Xinlun^*()

State Key Laboratory of Ecological Pest Control for Fujian and Taiwan Crops,Key Laboratory of Plant Virology of Fujian Province,Institute of Plant Virology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China

Received:2020-09-13Revised:2020-12-11Online:2021-01-25Published:2021-01-29
Contact:DING Xinlun E-mail:dingxinlun@163.com

摘要/Abstract

摘要： 草莓白化相关病毒（strawberry pallidosis-associated virus,SPaV）属于长线形病毒科（Closteroviridae）毛形病毒属（Crinivirus）,可引起草莓病害,2017年在中国首次报道。采用高通量测序、RACE和RT-PCR技术获得了SPaV中国分离物（FJ）的基因组全长。该病毒含有两条正单链基因组RNA1和RNA2。RNA1全长8 048 nt,5′和3′非编码区序列分别为264和197 nt,含有3个开放阅读框（ORF）,分别编码ORF 1a/1b融合蛋白和p9蛋白。RNA2全长7 977 nt,5′和3′非编码区序列分别为248和186 nt,含有8个开放阅读框（ORF）,分别编码HSP70h、CPh、CP、CPm、p7、p6、p9和p28等8个蛋白。RNA1和RNA2与美国M1分离物分别具有98.5%和99.0%的核苷酸一致性;系统发育分析结果表明,SPaV中国分离物（FJ）单独处在一个分支。对SPaV来源的小RNA的分析表明,来源于SPaV的小RAN长度以21和22 nt为主。
中图分类号:
S668.4

引用本文

陈道, 张洁, 吴祖建, 丁新伦. 草莓白化相关病毒中国分离物全基因组分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(1): 146-152.
CHEN Dao, ZHANG Jie, WU Zujian, DING Xinlun. Genome Sequence of Strawberry Pallidosis-associated Virus Isolated in China[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(1): 146-152.





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