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马铃薯CHI家族基因鉴定及其对外源水杨酸和茉莉酸的响应分析

本站小编 Free考研考试/2021-12-26

马铃薯CHI家族基因鉴定及其对外源水杨酸和茉莉酸的响应分析

荐红举1, 万梦圆1, 付毅1, 丁艺1, 琚熙三1, 尚丽娜1, 李辉1, 王季春1, 胡柏耿2, 吕典秋1,**()
1西南大学农学与生物科技学院,南方山地农业教育部工程研究中心,重庆 400715
2国家马铃薯工程技术研究中心,山东德州 253600
收稿日期:2020-03-30修回日期:2020-06-02出版日期:2021-01-25发布日期:2021-01-29
通讯作者:吕典秋E-mail:smallpotatoes@126.com

基金资助:对发展中国家科技援助项目(KY201904016);西南大学人才引进项目(SWU019008);重庆市技术创新与应用发展专项(cstc2019jscx-msxmX0398)

Genome-wide Identification and Expression Analysis of Chitinase Gene Family in Potato and Its Response to Exogenous Salicylic Acid and Jasmonic Acid

JIAN Hongju1, WAN Mengyuan1, FU Yi1, DING Yi1, JU Xisan1, SHANG Lina1, LI Hui1, WANG Jichun1, HU Bogeng2, Lü Dianqiu1,**()
1College of Agronomy and Biotechnology,State Cultivation Base of Crop Stress Biology for Southern Mountainous Land of Southwest University,Southwest University,Chongqing 400715,China
2National Engineering Research Center for Potato,Dezhou,Shandong 253600,China
Received:2020-03-30Revised:2020-06-02Online:2021-01-25Published:2021-01-29
Contact:Lü Dianqiu E-mail:smallpotatoes@126.com






摘要/Abstract


摘要: 利用拟南芥几丁质酶(Chitinase,CHI)基因家族蛋白序列在马铃薯基因组内进行BlastP分析,获得马铃薯CHI家族成员,并对其进行基因结构分析、motif预测、进化树构建、顺式作用元件和组织表达分析。共有26个马铃薯CHI基因成员得到鉴定,其所有成员均含有较少的内含子,其中motif 1 ~ motif 6均含有具有催化功能的GH19结构域。一共检测到166个胁迫或激素响应元件。进化树分析显示,CHI分为6个亚家族。马铃薯几丁质酶基因在不同组织中差异表达并且在水杨酸或茉莉酸处理后诱导表达,暗示水杨酸和茉莉酸对几丁质酶家族有不同的调控作用。
中图分类号:
S532

引用本文



荐红举, 万梦圆, 付毅, 丁艺, 琚熙三, 尚丽娜, 李辉, 王季春, 胡柏耿, 吕典秋. 马铃薯CHI家族基因鉴定及其对外源水杨酸和茉莉酸的响应分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(1): 83-95.
JIAN Hongju, WAN Mengyuan, FU Yi, DING Yi, JU Xisan, SHANG Lina, LI Hui, WANG Jichun, HU Bogeng, Lü Dianqiu. Genome-wide Identification and Expression Analysis of Chitinase Gene Family in Potato and Its Response to Exogenous Salicylic Acid and Jasmonic Acid[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 48(1): 83-95.





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