桃MRLK家族全基因组鉴定及蚜虫侵染后的表达分析
樊美丽,潘 磊,曾文芳,鲁振华,崔国朝,孟君仁,靳 哲,王志强,牛 良*中国农业科学院郑州果树研究所,国家桃葡萄改良中心,农业部果树育种技术重点实验室,郑州 450009
出版日期:
2020-08-25发布日期:
2020-08-25基金资助:
国家重点研发计划项目(2019YFD1000801-03);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610192020407)Genome Wide Identification of MRLK Family Genes and Expression Analysis in Response to Aphid Infection in Peach
FAN Meili,PAN Lei,ZENG Wenfang,LU Zhenhua,CUI Guochao,MENG Junren,JIN Zhe,WANG Zhiqiang,and NIU Liang*Zhengzhou Fruit Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,National Peach and Grape Improvement Center,Key Laboratory of Fruit Breeding Technology of Ministry of Agriculture,Zhengzhou 450009,China
Online:
2020-08-25Published:
2020-08-25摘要/Abstract
摘要: 以Malectin(PF11721)、Malectin-like(PF12819)和Pkinase(PF07714)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定桃(Prunus persica)基因组中全部MRLK类受体激酶(Malectin receptor-like kinases)家族成员,并利用转录组测序分析桃绿蚜侵染不同时间MRLK在抗蚜和感蚜品系材料中的表达情况。利用生物信息学手段进行分析,共获得41个MRLK家族成员,这些基因分布在桃的8条染色体上。家族成员氨基酸数量介于391 ~ 1 035 aa,分子量44.05 ~ 115.09 kD,等电点5.38 ~ 9.16。分析系统进化树发现拟南芥、水稻和桃的MRLK家族分为5个亚组,其中桃MRLK家族成员分布在Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚组上。亚细胞定位预测显示该家族成员全部定位在细胞膜上。顺式作用元件预测结果显示该家族成员启动子包含光、激素以及响应生物与非生物胁迫的作用元件。桃绿蚜侵染结果表明,桃MRLK家族中19个基因在5个桃材料中均未表达,15个基因在抗蚜品系‘P5868’与其他4个材料之间无差异表达。PpMRLK2、PpMRLK9、PpMRLK22、PpMRLK23、PpMRLK24、PpMRLK26和PpMRLK32在抗蚜品系‘P5868’中表达量比其他品系高,其中PpMRLK26表达量差异显著。进一步分析发现,在抗蚜品系‘P5868’中表达的22个MRLK呈组成型表达,蚜虫侵染处理不会对基因的表达产生影响。综上,推测PpMRLK26可能调控抗蚜品系‘P5868’的抗蚜性状的形成。
中图分类号:
S 662.1
引用本文
樊美丽,潘 磊,曾文芳,鲁振华,崔国朝,孟君仁,靳 哲,王志强,牛 良*. 桃MRLK家族全基因组鉴定及蚜虫侵染后的表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(8): 1438-1450.
FAN Meili,PAN Lei,ZENG Wenfang,LU Zhenhua,CUI Guochao,MENG Junren,JIN Zhe,WANG Zhiqiang,and NIU Liang*. Genome Wide Identification of MRLK Family Genes and Expression Analysis in Response to Aphid Infection in Peach[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(8): 1438-1450.
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