辣椒 β–酮脂酰辅酶 A 合酶基因家族的鉴定与表达分析
易 婷 1,张志硕 2,汤冰倩 1,谢玲玲 2,*,邹学校 1,3,*1 湖南大学研究生院隆平分院,长沙 410125;2 湖南省蔬菜研究所,长沙 410125;3 湖南农业大学园艺园林学院,长沙 410125
出版日期:
2020-02-25发布日期:
2020-02-25基金资助:
湖南省重点研发计划项目(2017NK2373)Identification and Expression Analysis of the KCS Gene Family in Pepper
YI Ting1,ZHANG Zhishuo2,TANG Bingqian1,XIE Lingling2,*,and ZOU Xuexiao1,3,*1Longping Branch,Graduate School of Hunan University,Changsha 410125,China;2Hunan Research Institute of Vegetables,Changsha 410125,China;3Horticulture & Landscape College,Hunan Agricultural University,Changsha 410125,China
Online:
2020-02-25Published:
2020-02-25摘要/Abstract
摘要: 为深入了解 β–酮脂酰辅酶 A 合酶(β-ketoacyl-CoA synthase,KCS)基因家族在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定所有 KCS 基因家族成员,对基因染色体定位、系统发育关系、基因结构、蛋白保守基序和组织表达模式等进行分析,并通过 qRT-PCR 方法检测基因在高温、低温和 NaCl胁迫下的响应。从辣椒基因组中共鉴定出 22 个 KCS 家族基因,其不均匀地分布在辣椒的 9 条染色体上;系统发育分析表明辣椒 KCS 基因家族可分为 4 组,每组含有不同数量的基因;该家族成员含有 0 ~ 3 个内含子,保守基序有 6 ~ 14 个;KCS 家族基因具有不同的表达模式;高温、低温和 NaCl 处理可以抑制或激活该家族成员的表达。
中图分类号:
S 641.3
引用本文
易 婷 1,张志硕 2,汤冰倩 1,谢玲玲 2,*,邹学校 1,3,*. 辣椒 β–酮脂酰辅酶 A 合酶基因家族的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(2): 370-382.
YI Ting1,ZHANG Zhishuo2,TANG Bingqian1,XIE Lingling2,*,and ZOU Xuexiao1,3,*. Identification and Expression Analysis of the KCS Gene Family in Pepper[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(2): 370-382.
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