柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

王福生1,2，余 洪1，胡 洲1，管德龙3，张 盼1，朱世平1,2，赵晓春1,2,*

1西南大学/中国农业科学院柑桔研究所，重庆400712；2国家柑桔工程技术研究中心，重庆400712；3陕西师范大学生命科学学院，西安710119

出版日期:2020-01-25发布日期:2020-01-25


基金资助:国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-26）；重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目；西南大学双一流学科建设项目；中国博士后科学基金项目（2017M622946）；重庆市博士后科研项目（XmT2018062）

Genome-wide Analysis of SAUR Gene Family in Citrus

WANG Fusheng1,2，YU Hong1，HU Zhou1，GUAN Delong3，ZHANG Pan1，ZHU Shiping1,2，and ZHAO Xiaochun1,2,*

1Citrus Research Institute，Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences，Chongqing 400712，China；2National Citrus Engineering Research Center，Chongqing 400712，China；3College of Life Sciences，Shaanxi Normal University，Xi’an 710119，China

Online:2020-01-25Published:2020-01-25

摘要/Abstract

摘要： 分析SAUR（Small auxin up-regulated RNA）基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等，从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均，呈现明显的串联重复现象，基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子，含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示，来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组，每一组都含有5个物种的家族成员，并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明，CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。qRT-PCR分析结果显示，大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。
中图分类号:
S 666

引用本文

王福生1,2，余 洪1，胡 洲1，管德龙3，张 盼1，朱世平1,2，赵晓春1,2,*. 柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 23-40.
WANG Fusheng1,2，YU Hong1，HU Zhou1，GUAN Delong3，ZHANG Pan1，ZHU Shiping1,2，and ZHAO Xiaochun1,2,*. Genome-wide Analysis of SAUR Gene Family in Citrus[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(1): 23-40.





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