四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
彭期定,吕 蕊,杨 婷,林宏辉,席德慧*四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都 610065
出版日期:
2020-01-25发布日期:
2020-01-25基金资助:
国家自然科学基金项目(31270290,31772131);四川省应用基础项目(2019YJ0135);中央高校基础研究经费项目(SCU2019D013)RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Actinidia virus 1 from Sichuan Province
PENG Qiding,Lü Rui,YANG Ting,LIN Honghui,and XI Dehui*Key Laboratory of Bio-resource and Eco-environment of Ministry of Education,College of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu 610065,China
Online:
2020-01-25Published:
2020-01-25摘要/Abstract
摘要: 为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1(Actinidia virus 1,AcV-1)在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性,采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检测。结果表明,22份样品为AcV-1阳性,检出率为24.4%。将获得的5个AcV-1分离物和已报道的新西兰分离物K75的外壳蛋白(coat protein,CP)基因序列进行比对,结果表明,分离物间核苷酸序列和氨基酸序列的相似性分别为84.8% ~ 97.1%和89.7% ~ 99.6%,其中除邛崃分离物HYH5与新西兰分离物K75的核苷酸序列相似性较高(97.1%)外,其余4个分离物均低于91%。系统进化分析结果显示,这些分离物主要聚集在3个分支上,分离物HYH5与新西兰分离物K75位于同一分支,其余分离物位于另外2个分支。
中图分类号:
S 663.4
引用本文
彭期定,吕 蕊,杨 婷,林宏辉,席德慧*. 四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 120-126.
PENG Qiding,Lü Rui,YANG Ting,LIN Honghui,and XI Dehui*. RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Actinidia virus 1 from Sichuan Province[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(1): 120-126.
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