草莓CIPK基因家族的鉴定与表达分析
刘 涛，王萍萍，何红红，梁国平，卢世雄，陈佰鸿，毛 娟*甘肃农业大学园艺学院，兰州 730070
出版日期:2020-01-25发布日期:2020-01-25基金资助:甘肃省科技重大专项（18ZD2NA006）；甘肃省现代农业产业技术体系建设专项资金项目（GARS-SG-3）Identification and Expression Analysis of CIPK Gene Family in Strawberry
LIU Tao，WANG Pingping，HE Honghong，LIANG Guoping，LU Shixiong，CHEN Baihong，and MAO Juan*College of Horticulture，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China
Online:2020-01-25Published:2020-01-25摘要/Abstract
摘要： 从拟南芥数据库中获得CIPK基因家族注册号，运用生物信息学分析的方法，在蔷薇科森林草莓（Fragaria vesca）数据库中得到CIPK基因家族成员19个，可分为6个亚族。该基因家族分布在草莓7条染色体中的6条上。其编码蛋白的氨基酸数157 ~ 1 196，理论等电点3.91 ~ 9.34，分子量18 667.68 ~ 133 714.31 D。基因结构分析表明，有11条基因只有1个外显子，其余基因外显子数2 ~ 15。亚细胞定位结果表明，该基因家族成员主要在细胞质、细胞核和叶绿体上表达。蛋白质二级结构预测表明，该基因家族成员主要以α–螺旋、β–转角和不规则卷曲为主。对上游2 kb区域启动子顺式作用元件分析表明，该基因家族成员对逆境胁迫应答MYB响应明显，除FvCIPK02、FvCIPK15、FvCIPK17外，其他基因均对脱落酸应答元件ABRE响应明显。qRT-PCR数据分析表明，FvCIPK16、FvCIPK10和FvCIPK09分别在PEG、ABA和NaCl处理下，草莓试管苗中的相对表达量最高，分别是对照的18.4倍、29倍、13倍，说明FvCIPK16强响应干旱胁迫，FvCIPK10强响应ABA诱导，FvCIPK09强响应高盐胁迫；另外发现各处理的FvCIPK03相对表达量均下调，推测FvCIPK03在植物逆境胁迫中起负调节作用。
中图分类号:
S 668.4
引用本文
刘 涛，王萍萍，何红红，梁国平，卢世雄，陈佰鸿，毛 娟*. 草莓CIPK基因家族的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 127-142.
LIU Tao，WANG Pingping，HE Honghong，LIANG Guoping，LU Shixiong，CHEN Baihong，and MAO Juan*. Identification and Expression Analysis of CIPK Gene Family in Strawberry[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(1): 127-142.
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