利用转录组测序分析外源GA3解除大蒜气生鳞茎休眠相关基因
董玉惠1，王立霞1，顾启玉1，刘中良2，孙秀东1，刘世琦1,*1山东农业大学园艺科学与工程学院，山东省大蒜工程技术研究中心，作物生物学国家重点试验室，山东泰安271018；2泰安市农业科学研究院，山东泰安 271000
出版日期:2019-12-25发布日期:2019-12-25基金资助:国家自然科学基金项目（31772323）；山东省自然科学基金项目（2R2016CM33）Analysis of Differentially Expressed Genes of Exogenous GA3 Releasing Aerial Bulbs Dormancy in Garlic Based on Transcriptome Sequencing
DONG Yuhui1，WANG Lixia1，GU Qiyu1，LIU Zhongliang2，SUN Xiudong1，and LIU Shiqi1,*1College of Horticulture Science and Engineering，Shandong Agricultural University，Shandong garlic Engineering Research Center，State Key Laboratory of Crop Biology，Tai’an，Shandong 271018，China；2Tai’an Academy of Agricultural Sciences，Tai’an，Shandong 271000，China
Online:2019-12-25Published:2019-12-25摘要/Abstract
摘要： 利用外源GA3打破‘金乡’大蒜气生鳞茎休眠，采用高通量测序技术对休眠气生鳞茎和GA3处理气生鳞茎进行转录组测序，分析筛选响应外源GA3的差异表达基因，探究差异表达基因与GA3解除气生鳞茎休眠的关系。结果表明：外源GA3可有效打破气生鳞茎休眠；通过转录组测序得到上调差异基因4 588个，下调差异基因55 857个；28 107个差异表达基因在KEGG中获得注释，其中在代谢途径中获得注释的差异基因最多，其次为遗传信息处理途径。差异表达基因较多的富集于植物激素信号转导途径且富集结果显著；筛选出参与GA、ABA、ZR信号转导的显著差异表达基因GAI、SLR1、PP2C等，其表达情况与气生鳞茎内源激素含量的变化情况一致，推测外源GA3可通过抑制GA信号途径负调控因子DELLA基因的表达，激活赤霉素的生物合成及信号转导过程，使气生鳞茎休眠解除，同时PYL的表达量显著降低，从而使得脱落酸含量相对降低，有利于休眠解除；qRT-PCR验证结果显示测序结果和实际结果一致。
中图分类号:
S 633.4
引用本文
董玉惠1，王立霞1，顾启玉1，刘中良2，孙秀东1，刘世琦1,*. 利用转录组测序分析外源GA3解除大蒜气生鳞茎休眠相关基因[J]. 园艺学报, 2019, 46(12): 2335-2346.
DONG Yuhui1，WANG Lixia1，GU Qiyu1，LIU Zhongliang2，SUN Xiudong1，and LIU Shiqi1,*. Analysis of Differentially Expressed Genes of Exogenous GA3 Releasing Aerial Bulbs Dormancy in Garlic Based on Transcriptome Sequencing[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(12): 2335-2346.
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