甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析

张焕欣，李国权，杨惠栋，曹 娜，朱方红*

江西省农业科学院园艺研究所，南昌 330200

出版日期:2019-11-25发布日期:2019-11-25


基金资助:国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-25）；公益性行业（农业）科研专项（201503110-05）；江西省青年科学基金项目（20192BAB214017）；江西省科技支撑计划项目（20141BBF60017）；江西省农业科学院创新基金项目（20181CBS002）

Genome-wide Identification and Expression of Dof Family in Melon（Cucumis melo）

ZHANG Huanxin，LI Guoquan，YANG Huidong，CAO Na，and ZHU Fanghong*

Institute of Horticulture，Jiangxi Academy of Agricultural Sciences，Nanchang 330200，China

Online:2019-11-25Published:2019-11-25

摘要/Abstract

摘要： 基于甜瓜全基因组数据信息，利用生物信息学方法对甜瓜Dof家族基因进行了全面鉴定和系统发育分析，并通过Real-time PCR方法检测了CmDof家族成员对模拟干旱（PEG6000）、盐和低温胁迫的应答。结果表明：在甜瓜中存在34个Dof基因，除1、5和7号染色体外其余染色体均有分布，发生11次染色体片段重复事件和2次串联重复事件，外显子数在1 ~ 3之间，其蛋白质等电点在4.95 ~ 9.59之间；蛋白序列系统发育分析显示CmDof蛋白可分为9个进化亚群；组织表达模式分析发现该家族基因具有一定的时空表达特异性；多数CmDof基因对PEG6000、盐和低温胁迫有响应，其中CmDof3/CmDof5/CmDof10/ CmDof17、CmDof3/CmDof5/CmDof10和CmDof3/CmDof5/CmDof32分别响应PEG6000、盐和低温胁迫。
中图分类号:
S 652

引用本文

张焕欣，李国权，杨惠栋，曹 娜，朱方红*. 甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(11): 2176-2187.
ZHANG Huanxin，LI Guoquan，YANG Huidong，CAO Na，and ZHU Fanghong*. Genome-wide Identification and Expression of Dof Family in Melon（Cucumis melo）[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(11): 2176-2187.





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