葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
黄晓婧1,张 珺1,夏 惠1,2,邓群仙1,王 进1,2,吕秀兰1,2,梁 东1,2,*1四川农业大学园艺学院,成都 611130;2四川农业大学果蔬研究所,成都 611130
出版日期:
2019-10-25发布日期:
2019-10-25基金资助:
四川省科技厅应用基础项目(2017JY0169);四川省科技基础条件平台项目(18PTDJ0140,2019JDPT0009)Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera
HUANG Xiaojing1,ZHANG Jun1,XIA Hui1,2,DENG Qunxian1,WANG Jin1,2,Lü Xiulan1,2,and LIANG Dong1,2,*1College of Horticulture,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China;2Institute of Pomology and Olericulture,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China
Online:
2019-10-25Published:
2019-10-25摘要/Abstract
摘要: 从葡萄基因组中共鉴定出54个MADS-box基因,其中Type-Ⅰ型10个,Type-Ⅱ型44个,分布于15条染色体中,编码的蛋白质序列为62 ~ 596个氨基酸,外显子数1 ~ 16个。启动子区含有大量光信号、植物激素、胁迫和分生组织等相关功能域。根据实时荧光定量RT-PCR的结果发现,SEP、FUL、FLC、SVP、SOC1和ANR1亚类基因随叶片生长表达水平逐步升高,在成熟叶中最高,衰老叶片中下降;果实第1次膨大期和果实转色期是SEP、SOC1和ANR1亚类基因的两个表达高峰期;单氰胺处理诱导SVP、AGL15、SOC1、AP3/PI、AGL12和FLC亚类基因在休眠过程中表达量持续上升,在休眠解除过程表达量下降。
中图分类号:
S 663.1
引用本文
黄晓婧1,张 珺1,夏 惠1,2,邓群仙1,王 进1,2,吕秀兰1,2,梁 东1,2,*. 葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(10): 1882-1896.
HUANG Xiaojing1,ZHANG Jun1,XIA Hui1,2,DENG Qunxian1,WANG Jin1,2,Lü Xiulan1,2,and LIANG Dong1,2,*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(10): 1882-1896.
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