香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

孙雪丽，刘 范，田 娜，项蕾蕾，郝向阳，王 云，彭丽云，王天池，程春振*，赖钟雄*

福建农林大学园艺学院，园艺植物生物工程研究所，福州 350002

出版日期:2019-10-25发布日期:2019-10-25


基金资助:国家自然科学基金项目（31601713）；福建农林大学科技创新专项基金项目（CXZX2018082）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-32-11）；福建农林大学“校****科研人才”计划项目（xjq201721）；福建省高原学科建设经费项目（102/71201801101）

Genome-wide Identification and Expression Analysis of Aux/IAA Gene Family in Banana

SUN Xueli，LIU Fan，TIAN Na，XIANG Leilei，HAO Xiangyang，WANG Yun，PENG Liyun，WANG Tianchi，CHENG Chunzhen*，and LAI Zhongxiong*

College of Horticulture，Institute of Horticultural Biotechnology，Fujian Agriculture and Forestry University，Fuzhou 350002，China

Online:2019-10-25Published:2019-10-25

摘要/Abstract

摘要： 对香蕉Aux/IAA基因家族进行了全基因组鉴定，获得分布于除1号染色体外的10条染色体上的44个家族成员，其CDS长度为378 ~ 1 062 bp，其中10个存在选择性剪切体。它们编码的蛋白包含125 ~ 353个氨基酸，均为不含信号肽的亲水蛋白。序列分析结果表明：该基因家族成员多为5个外显子和4个内含子的基因结构，编码蛋白多具有4个典型的保守基序。亚细胞定位预测结果显示，Aux/IAA成员多定位于细胞核、细胞质和叶绿体，定位情况与保守结构域有一定相关性。MaIAA31是该家族中唯一预测有跨膜区域且亚细胞观察定位在胞外的成员。进化树分析结果显示，香蕉Aux/IAA可分为2大类8个亚组。顺式作用元件分析结果显示该家族成员启动子包含激素、光、非生物以及生物胁迫响应相关元件。通过分析部分成员在不同激素和逆境处理下的表达情况发现：MaIAA基因的表达受多因素调控，其中MaIAA27变化显著，MaIAA15响应干旱和盐胁迫，MaIAA25在热、低温和机械损伤胁迫下显著上调，暗示它们在香蕉响应这些逆境的过程中发挥作用。
中图分类号:
S 668.1

引用本文

孙雪丽，刘 范，田 娜，项蕾蕾，郝向阳，王 云，彭丽云，王天池，程春振*，赖钟雄*. 香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(10): 1919-1935.
SUN Xueli，LIU Fan，TIAN Na，XIANG Leilei，HAO Xiangyang，WANG Yun，PENG Liyun，WANG Tianchi，CHENG Chunzhen*，and LAI Zhongxiong*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of Aux/IAA Gene Family in Banana[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(10): 1919-1935.





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