葡萄蚕豆萎蔫病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法及应用
张梦妍,张尊平,任 芳,胡国君,范旭东*,董雅凤*中国农业科学院果树研究所,国家落叶果树脱毒中心,辽宁兴城 125100
出版日期:
2020-01-25发布日期:
2020-01-25基金资助:
国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-29-bc-1);国家重点研发计划项目(2018YFD0201301);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项Establishment and Application of a Real-time Fluorescent Quantitative RT-PCR for Detection of Grapevine fabavirus
ZHANG Mengyan,ZHANG Zunping,REN Fang,HU Guojun,FAN Xudong*,and DONG Yafeng*National Center for Eliminating Viruses from Deciduous Fruit Tree,Research Institute of Pomology,Chinese Academy of Agriculture Sciences,Xingcheng,Liaoning 125100,China
Online:
2020-01-25Published:
2020-01-25摘要/Abstract
摘要: 建立了葡萄蚕豆萎蔫病毒(Grapevine fabavirus,GFabV)的实时荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)检测技术。该技术标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系(扩增效率103.8%,相关系数0.998),灵敏度是常规RT-PCR的1 000倍,并具有特异性。采用RT-qPCR和常规RT-PCR方法对葡萄不同发育时期及不同部位的316个样品进行检测,结果表明RT-qPCR方法对GFabV的检出率(96.8%)明显高于RT-PCR(70.8%)。RT-qPCR对休眠枝条中GFabV的检出率达100%,对其他部位样品的检出率均在92%以上,明显高于RT-PCR(42% ~ 97%)。各个发育时期样品GFabV的RT-qPCR检出率(85% ~ 95%)也普遍高于RT-PCR(70% ~ 90%)。该技术对于田间样品的检测适用范围广。
中图分类号:
S 663.1
引用本文
张梦妍,张尊平,任 芳,胡国君,范旭东*,董雅凤*. 葡萄蚕豆萎蔫病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法及应用[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 187-194.
ZHANG Mengyan,ZHANG Zunping,REN Fang,HU Guojun,FAN Xudong*,and DONG Yafeng*. Establishment and Application of a Real-time Fluorescent Quantitative RT-PCR for Detection of Grapevine fabavirus[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(1): 187-194.
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