菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析
汪豪英1,2,*，刘志远2,*，王晓武2，武 剑2，张合龙2，夏志兰1，徐兆生2,**，钱 伟2,**1湖南农业大学园艺园林学院，长沙 410128；2中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081
出版日期:2019-08-25发布日期:2019-08-25基金资助:中国农业科学院科技创新工程项目（CAAS-ASTIP-IVFCAAS）；国家自然科学基金项目（31872102）；北京市科技计划项目（Z171100001517014）；中国农业科学院基本科研业务费项目（1610102018004）；国家重点研发计划项目（2018YFD0100805）；农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目Genome-wide Association Studies for Monoecism in Spinach
WANG Haoying1,2,*，LIU Zhiyuan2,*，WANG Xiaowu2，WU Jian2，ZHANG Helong2，XIA Zhilan1，XU Zhaosheng2,**，and QIAN Wei2,**1College of Horticulture and Landscape，Hunan Agricultural University，Changsha 410128，China；2Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081，China
Online:2019-08-25Published:2019-08-25摘要/Abstract
摘要： 菠菜为典型的雌雄异株植物，少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点，对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析，同时进行测序深度为10×的重测序。重测序共获得了3 420 496个SNP，过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点。利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析（GWAS）。利用压缩混合线性模型（compress mixed linear model，cMLM）在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域。基于强关联信号SNP位点LD值（31.2 kb）的大小，将控制菠菜雌雄同株的基因Xm定位在64.6 kb的区间内。该范围内存在3个基因：Spo24600、Spo24601和Spo24602。该研究在关联区域内开发了KASP标记，可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定。
中图分类号:
S 636.1
引用本文
汪豪英1,2,*，刘志远2,*，王晓武2，武 剑2，张合龙2，夏志兰1，徐兆生2,**，钱 伟2,**. 菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(8): 1495-1502.
WANG Haoying1,2,*，LIU Zhiyuan2,*，WANG Xiaowu2，WU Jian2，ZHANG Helong2，XIA Zhilan1，XU Zhaosheng2,**，and QIAN Wei2,**. Genome-wide Association Studies for Monoecism in Spinach[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(8): 1495-1502.
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